seq1 = pF1KE1411.tfa, 597 bp
seq2 = pF1KE1411/gi568815586f_93578775.tfa (gi568815586f:93578775_93950268), 371494 bp

>pF1KE1411 597
>gi568815586f:93578775_93950268 (Chr12)

1-298  (100001-100298)   100% ->
299-597  (271196-271494)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCCAGAGACAAACAAGTACTCCGCTCACTTCGCCTGGAGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCCAGAGACAAACAAGTACTCCGCTCACTTCGCCTGGAGCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCAGAGGTATTGGTGGAGGGACTGGTTCTTCAGTACCTCTACCAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCAGAGGTATTGGTGGAGGGACTGGTTCTTCAGTACCTCTACCAGGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAATCTTGACGGAAAACCATATTCAAGAAATCAATGCTCAAACCACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAATCTTGACGGAAAACCATATTCAAGAAATCAATGCTCAAACCACAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCCGGAAAACAATGCTCCTGCTGGATATCCTACCTTCCAGGGGCCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCCGGAAAACAATGCTCCTGCTGGATATCCTACCTTCCAGGGGCCCTAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCATTTGATACATTCCTAGATTCCCTACAGGAGTTTCCCTGGGTCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCATTTGATACATTCCTAGATTCCCTACAGGAGTTTCCCTGGGTCAGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAAGCTGAAGAAGGCAAGGGAAGAGGCCATGACCGACCTGCCTGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100251 AGAAGCTGAAGAAGGCAAGGGAAGAGGCCATGACCGACCTGCCTGCAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    299        GTGACAGATTGACTGGGATCCCCTCGCACATCCTCAACAGCTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 A...CAGGTGACAGATTGACTGGGATCCCCTCGCACATCCTCAACAGCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCATCAGACCGGCAGATTAACCAGCTGGCCCAGAGGCTGGGCCCTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271239 CCCATCAGACCGGCAGATTAACCAGCTGGCCCAGAGGCTGGGCCCTGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGGAGCCCATGGTGCTGTCTCTGGGACTGTCCCAGACGGATATCTACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271289 GGGAGCCCATGGTGCTGTCTCTGGGACTGTCCCAGACGGATATCTACCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGTAAGGCCAACCACCCCCACAACGTGCAGTCGCAGGTGGTGGAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271339 TGTAAGGCCAACCACCCCCACAACGTGCAGTCGCAGGTGGTGGAGGCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATCCGTTGGCGGCAGCGCTTCGGGAAGCAGGCCACCTTCCAGAGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271389 CATCCGTTGGCGGCAGCGCTTCGGGAAGCAGGCCACCTTCCAGAGCCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACAACGGGCTGCGGGCTGTGGAGGTGGACCCCTCGCTGCTCCTGCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271439 ACAACGGGCTGCGGGCTGTGGAGGTGGACCCCTCGCTGCTCCTGCACATG

    600     .
    592 TTGGAG
        ||||||
 271489 TTGGAG