seq1 = pF1KE1409.tfa, 1404 bp
seq2 = pF1KE1409/gi568815590r_23091697.tfa (gi568815590r:23091697_23325061), 233365 bp

>pF1KE1409 1404
>gi568815590r:23091697_23325061 (Chr8)

(complement)

1-306  (100001-100306)   100% ->
307-403  (112850-112946)   100% ->
404-517  (122301-122414)   100% ->
518-629  (123143-123254)   100% ->
630-703  (124302-124375)   100% ->
704-799  (124462-124557)   100% ->
800-831  (125145-125176)   100% ->
832-1014  (125614-125796)   100% ->
1015-1087  (127858-127930)   100% ->
1088-1404  (133049-133365)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCCACCACCAGCTAGAGTACATCTAGGTGCGTTCCTGGCAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCCACCACCAGCTAGAGTACATCTAGGTGCGTTCCTGGCAGTGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCGAATCCCGGGAGCGCAGCGAGTGGGACAGAGGCAGCCGCGGCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCGAATCCCGGGAGCGCAGCGAGTGGGACAGAGGCAGCCGCGGCCACAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAGCAAAGTGTGGGGCTCTTCCGCGGGGAGGATTGAACCACGAGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAGCAAAGTGTGGGGCTCTTCCGCGGGGAGGATTGAACCACGAGGCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCGAGGAGCGCTCCCTACCTCCATGGGACAGCACGGACCCAGTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCCGAGGAGCGCTCCCTACCTCCATGGGACAGCACGGACCCAGTGCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCCCGGGCAGGGCGCGCCCCAGGACCCAGGCCGGCGCGGGAAGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCCCGGGCAGGGCGCGCCCCAGGACCCAGGCCGGCGCGGGAAGCCAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTCGGCTCCGGGTCCACAAGACCTTCAAGTTTGTCGTCGTCGGGGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTCGGCTCCGGGTCCACAAGACCTTCAAGTTTGTCGTCGTCGGGGTCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCAG         GTCGTACCTAGCTCAGCTGCAACCATCAAACTTCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCAGGTG...CAGGTCGTACCTAGCTCAGCTGCAACCATCAAACTTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGATCAATCAATTGGCACACAGCAATGGGAACATAGCCCTTTGGGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112885 TGATCAATCAATTGGCACACAGCAATGGGAACATAGCCCTTTGGGAGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGTGTCCACCAG         GATCTCATAGATCAGAACATCCTGGAGCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 112935 TGTGTCCACCAGGTA...CAGGATCTCATAGATCAGAACATCCTGGAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGTAACCGGTGCACAGAGGGTGTGGGTTACACCAATGCTTCCAACAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122330 TGTAACCGGTGCACAGAGGGTGTGGGTTACACCAATGCTTCCAACAATTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTTTGCTTGCCTCCCATGTACAGCTTGTAAATCAG         ATGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 122380 GTTTGCTTGCCTCCCATGTACAGCTTGTAAATCAGGTA...CAGATGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGAGAGAAGTCCCTGCACCACGACCAGGAACACAGCATGTCAGTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123149 AAGAGAGAAGTCCCTGCACCACGACCAGGAACACAGCATGTCAGTGCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCAGGAACTTTCCGGAATGACAATTCTGCTGAGATGTGCCGGAAGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123199 CCAGGAACTTTCCGGAATGACAATTCTGCTGAGATGTGCCGGAAGTGCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAGAGG         GTGCCCCAGAGGGATGGTCAAGGTCAAGGATTGTA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123249 CAGAGGGTG...CAGGTGCCCCAGAGGGATGGTCAAGGTCAAGGATTGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CGCCCTGGAGTGACATCGAGTGTGTCCACAAAGAATCAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 124337 CGCCCTGGAGTGACATCGAGTGTGTCCACAAAGAATCAGGTA...CAGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AATGGACATAATATATGGGTGATTTTGGTTGTGACTTTGGTTGTTCCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124464 AATGGACATAATATATGGGTGATTTTGGTTGTGACTTTGGTTGTTCCGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCTGTTGGTGGCTGTGCTGATTGTCTGTTGTTGCATCGGCTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 124514 GCTGTTGGTGGCTGTGCTGATTGTCTGTTGTTGCATCGGCTCAGGTA...

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    800    GTTGTGGAGGGGACCCCAAGTGCATGGACAGG         GTGTGT
        >>>||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 125142 TAGGTTGTGGAGGGGACCCCAAGTGCATGGACAGGGTG...AAGGTGTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TTCTGGCGCTTGGGTCTCCTACGAGGGCCTGGGGCTGAGGACAATGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125620 TTCTGGCGCTTGGGTCTCCTACGAGGGCCTGGGGCTGAGGACAATGCTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CAACGAGATTCTGAGCAACGCAGACTCGCTGTCCACTTTCGTCTCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125670 CAACGAGATTCTGAGCAACGCAGACTCGCTGTCCACTTTCGTCTCTGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AGCAAATGGAAAGCCAGGAGCCGGCAGATTTGACAGGTGTCACTGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125720 AGCAAATGGAAAGCCAGGAGCCGGCAGATTTGACAGGTGTCACTGTACAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TCCCCAGGGGAGGCACAGTGTCTGCTG         GGACCGGCAGAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 125770 TCCCCAGGGGAGGCACAGTGTCTGCTGGTG...CAGGGACCGGCAGAAGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGAAGGGTCTCAGAGGAGGAGGCTGCTGGTTCCAGCAAATGGTGCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127872 TGAAGGGTCTCAGAGGAGGAGGCTGCTGGTTCCAGCAAATGGTGCTGACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CCACTGAGA         CTCTGATGCTGTTCTTTGACAAGTTTGCAAAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 127922 CCACTGAGAGTA...CAGCTCTGATGCTGTTCTTTGACAAGTTTGCAAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ATCGTGCCCTTTGACTCCTGGGACCAGCTCATGAGGCAGCTGGACCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133081 ATCGTGCCCTTTGACTCCTGGGACCAGCTCATGAGGCAGCTGGACCTCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GAAAAATGAGATCGATGTGGTCAGAGCTGGTACAGCAGGCCCAGGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133131 GAAAAATGAGATCGATGTGGTCAGAGCTGGTACAGCAGGCCCAGGGGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCTTGTATGCAATGCTGATGAAATGGGTCAACAAAACTGGACGGAACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133181 CCTTGTATGCAATGCTGATGAAATGGGTCAACAAAACTGGACGGAACGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TCGATCCACACCCTGCTGGATGCCTTGGAGAGGATGGAAGAGAGACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133231 TCGATCCACACCCTGCTGGATGCCTTGGAGAGGATGGAAGAGAGACATGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AAAAGAGAAGATTCAGGACCTCTTGGTGGACTCTGGAAAGTTCATCTACT
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133281 AAGAGAGAAGATTCAGGACCTCTTGGTGGACTCTGGAAAGTTCATCTACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .
   1370 TAGAAGATGGCACAGGCTCTGCCGTGTCCTTGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133331 TAGAAGATGGCACAGGCTCTGCCGTGTCCTTGGAG