seq1 = pF1KE1401.tfa, 342 bp
seq2 = pF1KE1401/gi568815594r_73898012.tfa (gi568815594r:73898012_74098581), 200570 bp

>pF1KE1401 342
>gi568815594r:73898012_74098581 (Chr4)

(complement)

1-109  (100001-100109)   100% ->
110-242  (100244-100376)   100% ->
243-326  (100487-100570)   100% ->
327-342  (100927-100942)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCTCCTGTCCAGCCGCGCGGCCCGTGTCCCCGGTCCTTCGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCTCCTGTCCAGCCGCGCGGCCCGTGTCCCCGGTCCTTCGAGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGTGCGCGCTGTTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGACGCAGCCAGGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGTGCGCGCTGTTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGACGCAGCCAGGGCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGCCAGCG         CTGGTCCTGCCGCTGCTGTGTTGAGAGAGCTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGCCAGCGGTG...CAGCTGGTCCTGCCGCTGCTGTGTTGAGAGAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGTTGCGTTTGTTTACAGACCACGCAAGGAGTTCATCCCAAAATGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100276 CGTTGCGTTTGTTTACAGACCACGCAAGGAGTTCATCCCAAAATGATCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAATCTGCAAGTGTTCGCCATAGGCCCACAGTGCTCCAAGGTGGAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100326 TAATCTGCAAGTGTTCGCCATAGGCCCACAGTGCTCCAAGGTGGAAGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 T         AGCCTCCCTGAAGAACGGGAAGGAAATTTGTCTTGATCCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100376 TGTA...CAGAGCCTCCCTGAAGAACGGGAAGGAAATTTGTCTTGATCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAGCCCCTTTTCTAAAGAAAGTCATCCAGAAAATTTTGGACGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100527 GAAGCCCCTTTTCTAAAGAAAGTCATCCAGAAAATTTTGGACGGGTA...

    350     .    :    .
    327    TGGAAACAAGGAAAAC
        >>>||||||||||||||||
 100924 CAGTGGAAACAAGGAAAAC