seq1 = pF1KE1398.tfa, 3306 bp
seq2 = pF1KE1398/gi568815582r_8794001.tfa (gi568815582r:8794001_9030400), 236400 bp

>pF1KE1398 3306
>gi568815582r:8794001_9030400 (Chr16)

(complement)

1-79  (67116-67194)   100% ->
80-184  (100004-100108)   100% ->
185-383  (106988-107186)   100% ->
384-522  (109106-109244)   100% ->
523-611  (109954-110042)   100% ->
612-720  (111262-111370)   100% ->
721-851  (113245-113375)   100% ->
852-906  (113845-113899)   100% ->
907-987  (114876-114956)   100% ->
988-1078  (115057-115147)   100% ->
1079-1161  (119574-119656)   100% ->
1162-1271  (121951-122060)   100% ->
1272-1428  (123819-123975)   100% ->
1429-1573  (125070-125214)   100% ->
1574-1704  (125836-125966)   100% ->
1705-1839  (126999-127133)   100% ->
1840-1941  (127919-128020)   100% ->
1942-2047  (128214-128319)   100% ->
2048-2140  (129167-129259)   100% ->
2141-2208  (129344-129411)   100% ->
2209-2309  (129771-129871)   100% ->
2310-2463  (130644-130797)   100% ->
2464-2531  (131213-131280)   100% ->
2532-2640  (131762-131870)   100% ->
2641-2718  (131964-132041)   100% ->
2719-2819  (133302-133402)   100% ->
2820-2919  (134660-134759)   100% ->
2920-3039  (135251-135370)   100% ->
3040-3111  (135546-135617)   100% ->
3112-3202  (135761-135851)   100% ->
3203-3306  (136297-136400)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAAAGCGGGCGAGCAGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  67116 ATGAACCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAAAGCGGGCGAGCAGCAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCGAGCCCGAGGACATGGAGATGGAAG         CGGGAGATACAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
  67166 GAGCGAGCCCGAGGACATGGAGATGGAAGGTG...AAGCGGGAGATACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGACCCACCAAGAATTACTCAGAACCCTGTGATCAATGGGAATGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100016 ATGACCCACCAAGAATTACTCAGAACCCTGTGATCAATGGGAATGTGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGAGTGATGGACACAACACCGCGGAGGAGGACATGGAGGATG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100066 CTGAGTGATGGACACAACACCGCGGAGGAGGACATGGAGGATGGTA...C

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185   ACACCAGTTGGCGCTCCGAGGCAACCTTTCAGTTCACTGTGGAGCGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106986 AGACACCAGTTGGCGCTCCGAGGCAACCTTTCAGTTCACTGTGGAGCGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAGCAGACTGAGTGAGTCGGTCCTTAGCCCTCCGTGTTTTGTGCGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107036 TCAGCAGACTGAGTGAGTCGGTCCTTAGCCCTCCGTGTTTTGTGCGAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGCCATGGAAGATTATGGTGATGCCACGCTTTTATCCAGACAGACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107086 CTGCCATGGAAGATTATGGTGATGCCACGCTTTTATCCAGACAGACCACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCAAAAAAGCGTAGGATTCTTTCTCCAGTGCAATGCTGAATCTGATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107136 CCAAAAAAGCGTAGGATTCTTTCTCCAGTGCAATGCTGAATCTGATTCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 C         GTCATGGTCTTGCCATGCACAAGCAGTGCTGAAGATAATA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107186 CGTA...CAGGTCATGGTCTTGCCATGCACAAGCAGTGCTGAAGATAATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATTACAGAGATGATGAAAAGTCGTTCAGTCGTCGTATTAGTCATTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109146 AATTACAGAGATGATGAAAAGTCGTTCAGTCGTCGTATTAGTCATTTGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTCCATAAAGAAAATGATTGGGGATTTTCCAATTTTATGGCCTGGAGT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 109196 CTTCCATAAAGAAAATGATTGGGGATTTTCCAATTTTATGGCCTGGAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    523         GAAGTGACCGATCCTGAGAAAGGATTTATAGATGATGACAAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109246 TA...TAGGAAGTGACCGATCCTGAGAAAGGATTTATAGATGATGACAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTTACCTTTGAAGTCTTTGTACAGGCGGATGCTCCCCATGGAGTTGC   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 109996 GTTACCTTTGAAGTCTTTGTACAGGCGGATGCTCCCCATGGAGTTGCGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    612       GTGGGATTCAAAGAAGCACACAGGCTACGTCGGCTTAAAGAATC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110046 ...CAGGTGGGATTCAAAGAAGCACACAGGCTACGTCGGCTTAAAGAATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGGAGCGACTTGTTACATGAACAGCCTGCTACAGACGTTATTTTTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111306 AGGGAGCGACTTGTTACATGAACAGCCTGCTACAGACGTTATTTTTCACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AATCAGCTACGAAAG         GCTGTGTACATGATGCCAACCGAGGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 111356 AATCAGCTACGAAAGGTA...CAGGCTGTGTACATGATGCCAACCGAGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGATGATTCGTCTAAAAGCGTCCCTTTAGCATTACAAAGAGTGTTCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113271 GGATGATTCGTCTAAAAGCGTCCCTTTAGCATTACAAAGAGTGTTCTATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AATTACAGCATAGTGATAAACCTGTAGGAACAAAAAAGTTAACAAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113321 AATTACAGCATAGTGATAAACCTGTAGGAACAAAAAAGTTAACAAAGTCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTTGG         GTGGGAAACTTTAGATAGCTTCATGCAACATGATGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113371 TTTGGGTA...AAGGTGGGAAACTTTAGATAGCTTCATGCAACATGATGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCAGGAGCTTTGTCGAGTG         TTGCTCGATAATGTGGAAAATA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 113881 TCAGGAGCTTTGTCGAGTGGTA...CAGTTGCTCGATAATGTGGAAAATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AGATGAAAGGCACCTGTGTAGAGGGCACCATACCCAAATTATTCCGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114898 AGATGAAAGGCACCTGTGTAGAGGGCACCATACCCAAATTATTCCGCGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AAAATGGTG         TCCTATATCCAGTGTAAAGAAGTAGACTATCG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 114948 AAAATGGTGGTA...CAGTCCTATATCCAGTGTAAAGAAGTAGACTATCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GTCTGATAGAAGAGAAGATTATTATGATATCCAGCTAAGTATCAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115089 GTCTGATAGAAGAGAAGATTATTATGATATCCAGCTAAGTATCAAAGGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGAAAAATA         TATTTGAATCATTTGTGGATTATGTGGCAGTA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 115139 AGAAAAATAGTA...AAGTATTTGAATCATTTGTGGATTATGTGGCAGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GAACAGCTCGATGGGGACAATAAATACGACGCTGGGGAACATGGCTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119606 GAACAGCTCGATGGGGACAATAAATACGACGCTGGGGAACATGGCTTACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 G         GAAGCAGAGAAAGGTGTGAAATTCCTAACATTGCCACCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119656 GGTA...TAGGAAGCAGAGAAAGGTGTGAAATTCCTAACATTGCCACCAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 TGTTACATCTACAACTGATGAGATTTATGTATGACCCTCAGACGGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121991 TGTTACATCTACAACTGATGAGATTTATGTATGACCCTCAGACGGACCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AATATCAAGATCAATGATAG         GTTTGAATTCCCAGAGCAGTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 122041 AATATCAAGATCAATGATAGGTA...TAGGTTTGAATTCCCAGAGCAGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 ACCACTTGATGAATTTTTGCAAAAAACAGATCCTAAGGACCCTGCAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123840 ACCACTTGATGAATTTTTGCAAAAAACAGATCCTAAGGACCCTGCAAATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 ATATTCTTCATGCAGTCCTGGTTCATAGTGGAGATAATCATGGTGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123890 ATATTCTTCATGCAGTCCTGGTTCATAGTGGAGATAATCATGGTGGACAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 TATGTGGTTTATCTAAACCCCAAAGGGGATGGCAAA         TGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 123940 TATGTGGTTTATCTAAACCCCAAAGGGGATGGCAAAGTA...CAGTGGTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TAAATTTGATGACGACGTGGTGTCAAGGTGTACTAAAGAGGAAGCAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125075 TAAATTTGATGACGACGTGGTGTCAAGGTGTACTAAAGAGGAAGCAATTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 AGCACAATTATGGGGGTCACGATGACGACCTGTCTGTTCGACACTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125125 AGCACAATTATGGGGGTCACGATGACGACCTGTCTGTTCGACACTGCACT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 AATGCTTACATGTTAGTCTACATCAGGGAATCAAAACTGA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 125175 AATGCTTACATGTTAGTCTACATCAGGGAATCAAAACTGAGTG...CAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TGAAGTTTTACAGGCGGTCACCGACCATGATATTCCTCAGCAGTTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125837 TGAAGTTTTACAGGCGGTCACCGACCATGATATTCCTCAGCAGTTGGTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 AGCGATTACAAGAAGAGAAAAGGATCGAGGCTCAGAAGCGGAAGGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125887 AGCGATTACAAGAAGAGAAAAGGATCGAGGCTCAGAAGCGGAAGGAGCGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CAGGAAGCCCATCTCTATATGCAAGTGCAG         ATAGTCGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 125937 CAGGAAGCCCATCTCTATATGCAAGTGCAGGTC...CAGATAGTCGCAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 GGACCAGTTTTGTGGCCACCAAGGGAATGACATGTACGATGAAGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127010 GGACCAGTTTTGTGGCCACCAAGGGAATGACATGTACGATGAAGAAAAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 TGAAATACACTGTGTTCAAAGTATTGAAGAACTCCTCGCTTGCTGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127060 TGAAATACACTGTGTTCAAAGTATTGAAGAACTCCTCGCTTGCTGAGTTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 GTTCAGAGCCTCTCTCAGACCATG         GGATTTCCACAAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 127110 GTTCAGAGCCTCTCTCAGACCATGGTG...CAGGGATTTCCACAAGATCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 AATTCGATTGTGGCCCATGCAAGCAAGGAGTAATGGAACAAAACGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127936 AATTCGATTGTGGCCCATGCAAGCAAGGAGTAATGGAACAAAACGACCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 CAATGTTAGATAATGAAGCCGACGGCAATAAAACA         ATGATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 127986 CAATGTTAGATAATGAAGCCGACGGCAATAAAACAGTA...TAGATGATT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 GAGCTCAGTGATAATGAAAACCCTTGGACAATATTCCTGGAAACAGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128220 GAGCTCAGTGATAATGAAAACCCTTGGACAATATTCCTGGAAACAGTTGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 TCCCGAGCTGGCTGCTAGTGGAGCGACCTTACCCAAGTTTGATAAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128270 TCCCGAGCTGGCTGCTAGTGGAGCGACCTTACCCAAGTTTGATAAAGATC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048          ATGATGTAATGTTATTTTTGAAGATGTATGATCCCAAAACG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128320 GTA...TAGATGATGTAATGTTATTTTTGAAGATGTATGATCCCAAAACG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 CGGAGCTTGAATTACTGTGGGCATATCTACACACCAATATCCTGTAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129208 CGGAGCTTGAATTACTGTGGGCATATCTACACACCAATATCCTGTAAAAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 AC         GTGACTTGCTCCCAGTTATGTGTGACAGAGCAGGATTTA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129258 ACGTA...TAGGTGACTTGCTCCCAGTTATGTGTGACAGAGCAGGATTTA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 TTCAAGATACTAGCCTTATCCTCTATGAG         GAAGTTAAACCG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 129383 TTCAAGATACTAGCCTTATCCTCTATGAGGTT...TAGGAAGTTAAACCG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2221 AATTTAACAGAGAGAATTCAGGACTATGACGTGTCTCTTGATAAAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129783 AATTTAACAGAGAGAATTCAGGACTATGACGTGTCTCTTGATAAAGCCCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2271 TGATGAACTAATGGATGGTGACATCATAGTATTTCAGAA         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 129833 TGATGAACTAATGGATGGTGACATCATAGTATTTCAGAAGTA...CAGGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2312 ATGACCCTGAAAATGATAACAGTGAATTACCCACCGCAAAGGAGTATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130646 ATGACCCTGAAAATGATAACAGTGAATTACCCACCGCAAAGGAGTATTTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2362 CGAGATCTCTACCACCGCGTTGATGTCATTTTCTGTGATAAAACAATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130696 CGAGATCTCTACCACCGCGTTGATGTCATTTTCTGTGATAAAACAATCCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2412 TAATGATCCTGGATTTGTGGTTACGTTATCAAATAGAATGAATTATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130746 TAATGATCCTGGATTTGTGGTTACGTTATCAAATAGAATGAATTATTTTC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2462 AG         GTTGCAAAGACAGTTGCACAGAGGCTCAACACAGATCCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130796 AGGTA...TAGGTTGCAAAGACAGTTGCACAGAGGCTCAACACAGATCCA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2503 ATGTTGCTGCAGTTTTTCAAGTCTCAAGG         TTATAGGGATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 131252 ATGTTGCTGCAGTTTTTCAAGTCTCAAGGGTA...TAGTTATAGGGATGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2544 CCCAGGTAATCCTCTTAGACATAATTATGAAGGTACTTTAAGAGATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131774 CCCAGGTAATCCTCTTAGACATAATTATGAAGGTACTTTAAGAGATCTTC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2594 TACAGTTCTTCAAGCCTAGACAACCTAAGAAACTTTACTATCAGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 131824 TACAGTTCTTCAAGCCTAGACAACCTAAGAAACTTTACTATCAGCAGGTA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2641       CTTAAGATGAAAATCACAGACTTTGAGAACAGGCGAAGTTTTAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131874 ...TAGCTTAAGATGAAAATCACAGACTTTGAGAACAGGCGAAGTTTTAA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2685 ATGTATATGGTTAAACAGCCAATTTAGGGAAGAG         GAAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 132008 ATGTATATGGTTAAACAGCCAATTTAGGGAAGAGGTA...TAGGAAATAA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2726 CACTATATCCAGACAAGCATGGGTGTGTCCGGGACCTGTTAGAAGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133309 CACTATATCCAGACAAGCATGGGTGTGTCCGGGACCTGTTAGAAGAATGT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2776 AAAAAGGCCGTGGAGCTTGGGGAGAAAGCATCAGGGAAACTTAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 133359 AAAAAGGCCGTGGAGCTTGGGGAGAAAGCATCAGGGAAACTTAGGCA...

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2820    GCTGCTAGAAATTGTAAGCTACAAAATCATTGGTGTTCATCAAGAAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134657 CAGGCTGCTAGAAATTGTAAGCTACAAAATCATTGGTGTTCATCAAGAAG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2867 ATGAACTATTAGAATGTTTATCTCCTGCAACGAGCCGGACGTTTCGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134707 ATGAACTATTAGAATGTTTATCTCCTGCAACGAGCCGGACGTTTCGAATA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2917 GAG         GAAATCCCTTTGGACCAGGTGGACATAGACAAAGAGAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134757 GAGGTA...CAGGAAATCCCTTTGGACCAGGTGGACATAGACAAAGAGAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2958 TGAGATGCTTGTCACAGTGGCGCATTTCCACAAAGAGGTCTTCGGAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135289 TGAGATGCTTGTCACAGTGGCGCATTTCCACAAAGAGGTCTTCGGAACGT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3008 TCGGAATCCCGTTTTTGCTGAGGATACACCAG         GGCGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 135339 TCGGAATCCCGTTTTTGCTGAGGATACACCAGGTA...TAGGGCGAGCAT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3049 TTTCGAGAAGTGATGAAGCGAATCCAGAGCCTGCTGGACATCCAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135555 TTTCGAGAAGTGATGAAGCGAATCCAGAGCCTGCTGGACATCCAGGAGAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3099 GGAGTTTGAGAAG         TTTAAATTTGCAATTGTAATGATGGGCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 135605 GGAGTTTGAGAAGGTG...TAGTTTAAATTTGCAATTGTAATGATGGGCC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3140 GACACCAGTACATAAATGAAGACGAGTATGAAGTAAATTTGAAAGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135789 GACACCAGTACATAAATGAAGACGAGTATGAAGTAAATTTGAAAGACTTT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3190 GAGCCACAGCCCG         GTAATATGTCTCATCCTCGGCCTTGGCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 135839 GAGCCACAGCCCGGTA...CAGGTAATATGTCTCATCCTCGGCCTTGGCT

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3231 AGGGCTCGACCACTTCAACAAAGCCCCAAAGAGGAGTCGCTACACTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136325 AGGGCTCGACCACTTCAACAAAGCCCCAAAGAGGAGTCGCTACACTTACC

   3550     .    :    .    :    .
   3281 TTGAAAAGGCCATTAAAATCCATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||
 136375 TTGAAAAGGCCATTAAAATCCATAAC