seq1 = pF1KE1395.tfa, 1080 bp
seq2 = pF1KE1395/gi568815591r_117178158.tfa (gi568815591r:117178158_117422989), 244832 bp

>pF1KE1395 1080
>gi568815591r:117178158_117422989 (Chr7)

(complement)

1-83  (100001-100083)   100% ->
84-310  (102197-102423)   100% ->
311-588  (107642-107919)   100% ->
589-853  (125114-125378)   100% ->
854-1080  (144606-144832)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGCCCCTCTCGGTGGAATCTGGCTCTGGCTCCCTCTGCTCTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACGCCCCTCTCGGTGGAATCTGGCTCTGGCTCCCTCTGCTCTTGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGCTCACCCCCGAGGTCAACTCTTCATGGTG         GTACATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100051 CTGGCTCACCCCCGAGGTCAACTCTTCATGGTGGTA...TAGGTACATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAGCTACAGGTGGCTCCTCCAGGGTGATGTGCGATAATGTGCCAGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102205 GAGCTACAGGTGGCTCCTCCAGGGTGATGTGCGATAATGTGCCAGGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGAGCAGCCAGCGGCAGCTGTGTCACCGACATCCAGATGTGATGCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102255 GTGAGCAGCCAGCGGCAGCTGTGTCACCGACATCCAGATGTGATGCGTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATTAGCCAGGGCGTGGCCGAGTGGACAGCAGAATGCCAGCACCAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102305 CATTAGCCAGGGCGTGGCCGAGTGGACAGCAGAATGCCAGCACCAGTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCAGCACCGCTGGAATTGCAACACCCTGGACAGGGATCACAGCCTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102355 GCCAGCACCGCTGGAATTGCAACACCCTGGACAGGGATCACAGCCTTTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCAGGGTCCTACTCCGAA         GTAGTCGGGAATCTGCCTTTGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102405 GGCAGGGTCCTACTCCGAAGTA...CAGGTAGTCGGGAATCTGCCTTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTATGCCATCTCCTCAGCTGGAGTTGTATTTGCCATCACCAGGGCCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107664 TTATGCCATCTCCTCAGCTGGAGTTGTATTTGCCATCACCAGGGCCTGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCCAAGGAGAAGTAAAATCCTGTTCCTGTGATCCAAAGAAGATGGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107714 GCCAAGGAGAAGTAAAATCCTGTTCCTGTGATCCAAAGAAGATGGGAAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCAAGGACAGCAAAGGCATTTTTGATTGGGGTGGCTGCAGTGATAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107764 GCCAAGGACAGCAAAGGCATTTTTGATTGGGGTGGCTGCAGTGATAACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGACTATGGGATCAAATTTGCCCGCGCATTTGTGGATGCAAAGGAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107814 TGACTATGGGATCAAATTTGCCCGCGCATTTGTGGATGCAAAGGAAAGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAGGAAAGGATGCCAGAGCCCTGATGAATCTTCACAACAACAGAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107864 AAGGAAAGGATGCCAGAGCCCTGATGAATCTTCACAACAACAGAGCTGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AGGAAG         GCTGTAAAGCGGTTCTTGAAACAAGAGTGCAAGTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107914 AGGAAGGTA...CAGGCTGTAAAGCGGTTCTTGAAACAAGAGTGCAAGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCACGGGGTGAGCGGCTCATGTACTCTCAGGACATGCTGGCTGGCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125149 CCACGGGGTGAGCGGCTCATGTACTCTCAGGACATGCTGGCTGGCCATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCGACTTCAGGAAAACGGGCGATTATCTCTGGAGGAAGTACAATGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125199 CCGACTTCAGGAAAACGGGCGATTATCTCTGGAGGAAGTACAATGGGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ATCCAGGTGGTCATGAACCAGGATGGCACAGGTTTCACTGTGGCTAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125249 ATCCAGGTGGTCATGAACCAGGATGGCACAGGTTTCACTGTGGCTAACGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GAGGTTTAAGAAGCCAACGAAAAATGACCTCGTGTATTTTGAGAATTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125299 GAGGTTTAAGAAGCCAACGAAAAATGACCTCGTGTATTTTGAGAATTCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CAGACTACTGTATCAGGGACCGAGAGGCAG         GCTCCCTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 125349 CAGACTACTGTATCAGGGACCGAGAGGCAGGTA...CAGGCTCCCTGGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ACAGCAGGCCGTGTGTGCAACCTGACTTCCCGGGGCATGGACAGCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144617 ACAGCAGGCCGTGTGTGCAACCTGACTTCCCGGGGCATGGACAGCTGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AGTCATGTGCTGTGGGAGAGGCTACGACACCTCCCATGTCACCCGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144667 AGTCATGTGCTGTGGGAGAGGCTACGACACCTCCCATGTCACCCGGATGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CCAAGTGTGGGTGTAAGTTCCACTGGTGCTGCGCCGTGCGCTGTCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144717 CCAAGTGTGGGTGTAAGTTCCACTGGTGCTGCGCCGTGCGCTGTCAGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TGCCTGGAAGCTCTGGATGTGCACACATGCAAGGCCCCCAAGAACGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144767 TGCCTGGAAGCTCTGGATGTGCACACATGCAAGGCCCCCAAGAACGCTGA

   1100     .    :    .
   1065 CTGGACAACCGCTACA
        ||||||||||||||||
 144817 CTGGACAACCGCTACA