seq1 = pF1KE1381.tfa, 2349 bp
seq2 = pF1KE1381/gi568815587r_66232279.tfa (gi568815587r:66232279_66436402), 204124 bp

>pF1KE1381 2349
>gi568815587r:66232279_66436402 (Chr11)

(complement)

1-86  (100001-100086)   100% ->
87-267  (100245-100425)   100% ->
268-382  (100527-100641)   100% ->
383-455  (100721-100793)   100% ->
456-547  (100905-100996)   100% ->
548-1285  (101152-101889)   100% ->
1286-1591  (102179-102484)   100% ->
1592-1723  (102745-102876)   100% ->
1724-1875  (102994-103145)   100% ->
1876-2349  (103651-104124)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAGCCCTGGAGAGTCAGGCGCGGGCTCTCCTGGAGCCCCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAGCCCTGGAGAGTCAGGCGCGGGCTCTCCTGGAGCCCCCAGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCCAGCTTCACTACTGGGCACCTGGCGAGAGAAAA         GCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100051 GTCCAGCTTCACTACTGGGCACCTGGCGAGAGAAAAGTT...CAGGCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCAGGACCCACTGTATGACGTGCCCAATGCCAGCGGCGGGCAGGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100250 CCCAGGACCCACTGTATGACGTGCCCAATGCCAGCGGCGGGCAGGCAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGCCGCAGCGGCCGGGGCGCGTTGTGAGCCTGCGGGAGCGCCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100300 GGGCCGCAGCGGCCGGGGCGCGTTGTGAGCCTGCGGGAGCGCCTGCTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACCCGGCCCGTGTGGCTGCAGCTGCAAGCCAACGCAGCGGCCGCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100350 CACCCGGCCCGTGTGGCTGCAGCTGCAAGCCAACGCAGCGGCCGCACTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACATGCTGAGGACCGAGCCCCCGGGG         ACGTTCCTCGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100400 ACATGCTGAGGACCGAGCCCCCGGGGGTG...CAGACGTTCCTCGTGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAATCTAACACCCGCCAGTGCCAGGCCCTGTGCATGCGGTTGCCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100542 AAATCTAACACCCGCCAGTGCCAGGCCCTGTGCATGCGGTTGCCTGAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGTGGCCCCTCCTTCGTCTCCAGCCACTACATCCTGGAGAGCCCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100592 CAGTGGCCCCTCCTTCGTCTCCAGCCACTACATCCTGGAGAGCCCTGGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383          GCGTCTCCTTGGAGGGCTCGGAGCTCATGTTCCCAGACCTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100642 GTG...CAGGCGTCTCCTTGGAGGGCTCGGAGCTCATGTTCCCAGACCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTCCAGCTCATCTGTGCCTACTGCCACACCCG         GGACATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100762 GTCCAGCTCATCTGTGCCTACTGCCACACCCGGTG...CAGGGACATCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCTCCTCCCGCTGCAGCTCCCCAGAGCCATCCACCACGCAGCCACTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100914 TCTCCTCCCGCTGCAGCTCCCCAGAGCCATCCACCACGCAGCCACTCACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGAGCTGGAGGCCATCTCCCATCTGGGCATTG         AGTTCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100964 AAGAGCTGGAGGCCATCTCCCATCTGGGCATTGGTA...TAGAGTTCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGCTCCTCCCTCAACATCAAGGCTCAGCGGGGCCCGGCTGGAGGCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101160 AGCTCCTCCCTCAACATCAAGGCTCAGCGGGGCCCGGCTGGAGGCCCAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTTGCCCCAGCTGAAGGCCCGGTCCCCTCAAGAGCTGGACCAGGGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101210 GTTGCCCCAGCTGAAGGCCCGGTCCCCTCAAGAGCTGGACCAGGGCACCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GAGCCGCCTTGTGCTTCTTCAACCCCCTGTTCCCGGGGGACCTAGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101260 GAGCCGCCTTGTGCTTCTTCAACCCCCTGTTCCCGGGGGACCTAGGGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ACCAAGCGGGAGAAATTCAAGAGAAGCTTCAAAGTGCGCGTGTCCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101310 ACCAAGCGGGAGAAATTCAAGAGAAGCTTCAAAGTGCGCGTGTCCACAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GACCTCCAGCCCCCTGTCTCCACCTGCCGTGCCACCTCCCCCCGTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101360 GACCTCCAGCCCCCTGTCTCCACCTGCCGTGCCACCTCCCCCCGTCCCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGCTGCCAGGGGCAGTCCCCAGCCAGACAGAGCGGCTGCCCCCTTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101410 TGCTGCCAGGGGCAGTCCCCAGCCAGACAGAGCGGCTGCCCCCTTGCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTGCTACGGAGGGAGAGCTCAGTGGGGTACCGCGTGCCAGCAGGCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101460 CTGCTACGGAGGGAGAGCTCAGTGGGGTACCGCGTGCCAGCAGGCAGTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCCTAGCCTTCCGCCTATGCCCTCCCTCCAAGAGGTGGACTGCGGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101510 CCCTAGCCTTCCGCCTATGCCCTCCCTCCAAGAGGTGGACTGCGGCTCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCAGCAGCTCCGAGGAGGAGGGGGTGCCAGGGTCCCGGGGGAGCCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101560 CCAGCAGCTCCGAGGAGGAGGGGGTGCCAGGGTCCCGGGGGAGCCCAGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ACCTCACCCCACCTGGGCCGCCGACGACCTCTGCTTCGGTCCATGAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101610 ACCTCACCCCACCTGGGCCGCCGACGACCTCTGCTTCGGTCCATGAGCGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CGCCTTCTGCTCCCTACTGGCACCGGAGCGGCAGGTGGGCCGGGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101660 CGCCTTCTGCTCCCTACTGGCACCGGAGCGGCAGGTGGGCCGGGCTGCGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CAGCACTGATGCAGGACCGACACACAGCCGCGGGCCAGCTGGTGCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101710 CAGCACTGATGCAGGACCGACACACAGCCGCGGGCCAGCTGGTGCAGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CTACTGACCCAGGTGCGGGCTGGGCCCGAGCCCCAGGAGCTGCAGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101760 CTACTGACCCAGGTGCGGGCTGGGCCCGAGCCCCAGGAGCTGCAGGGCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CCGTCAGGCGCTGAGCCGGGCCCGGGCCATGCTGAGTGCGGAGCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101810 CCGTCAGGCGCTGAGCCGGGCCCGGGCCATGCTGAGTGCGGAGCTGGGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CTGAGAAGCTGCTGTCGCCTAAGAGGCTGG         AACATGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101860 CTGAGAAGCTGCTGTCGCCTAAGAGGCTGGGTG...CAGAACATGTCCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GAGAAGTCATTGCATTGCTCTGTGCTCAAGCCTCTCCGGCCCATCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102190 GAGAAGTCATTGCATTGCTCTGTGCTCAAGCCTCTCCGGCCCATCCTGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 AGCCCGCCTGCGGCGCCGGCTTGCCGCAGACGGCTCCCTGGGCCGCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102240 AGCCCGCCTGCGGCGCCGGCTTGCCGCAGACGGCTCCCTGGGCCGCCTAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 CTGAGGGCCTCCGCCTGGCCCGGGCCCAGGGCCCCGGAGCCTTCGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102290 CTGAGGGCCTCCGCCTGGCCCGGGCCCAGGGCCCCGGAGCCTTCGGGTCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 CACCTGAGCCTGCCCTCCCCAGTAGAGTTGGAGCAAGTGCGCCAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102340 CACCTGAGCCTGCCCTCCCCAGTAGAGTTGGAGCAAGTGCGCCAGAAGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 GCTGCAGCTGCTCCGCACCTACTCACCCAGCGCCCAGGTCAAGCGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102390 GCTGCAGCTGCTCCGCACCTACTCACCCAGCGCCCAGGTCAAGCGGCTCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 TGCAGGCCTGCAAGCTGCTCTACATGGCCCTGAGGACCCAGGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102440 TGCAGGCCTGCAAGCTGCTCTACATGGCCCTGAGGACCCAGGAAGGTA..

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592     GGGAGGGCGCGGGTGCCGACGAGTTCCTGCCTCTGCTGAGCCTCGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102490 .CAGGGGAGGGCGCGGGTGCCGACGAGTTCCTGCCTCTGCTGAGCCTCGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 CTTGGCCCACTGTGACCTTCCTGAGCTGCTGCTGGAGGCCGAGTACATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102791 CTTGGCCCACTGTGACCTTCCTGAGCTGCTGCTGGAGGCCGAGTACATGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CGGAGCTGCTGGAGCCCAGCCTGCTTACTGGAGAGG         GTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102841 CGGAGCTGCTGGAGCCCAGCCTGCTTACTGGAGAGGGTG...CAGGTGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 TACTACCTGACCAGCCTCTCTGCCAGCCTGGCCCTGCTGAGTGGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102999 TACTACCTGACCAGCCTCTCTGCCAGCCTGGCCCTGCTGAGTGGCCTGGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 TCAGGCCCACACCCTCCCACTGAGCCCCGTGCAGGAGCTACGGCGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103049 TCAGGCCCACACCCTCCCACTGAGCCCCGTGCAGGAGCTACGGCGCTCCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 TCAGCCTCTGGGAGCAGCGCCGCCTGCCTGCCACCCACTGCTTCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103099 TCAGCCTCTGGGAGCAGCGCCGCCTGCCTGCCACCCACTGCTTCCAGGTA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1876       CACCTCCTCCGAGTAGCCTATCAGGATCCCAGCAGTGGCTGCAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103149 ...TAGCACCTCCTCCGAGTAGCCTATCAGGATCCCAGCAGTGGCTGCAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 CTCCAAGACCCTGGCCGTGCCCCCAGAGGCCTCGATTGCCACCCTGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 103695 CTCCAAGACCCTGGCCGTGCCCCCAGAAGCCTCGATTGCCACCCTGAACC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 AGCTCTGTGCCACCAAGTTCCGAGTGACCCAGCCCAACACTTTTGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103745 AGCTCTGTGCCACCAAGTTCCGAGTGACCCAGCCCAACACTTTTGGCCTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 TTCCTGTACAAGGAGCAGGGCTACCACCGCCTGCCCCCTGGGGCCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103795 TTCCTGTACAAGGAGCAGGGCTACCACCGCCTGCCCCCTGGGGCCCTGGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 CCACAGGCTGCCCACCACTGGCTACCTCGTCTACCGCCGGGCAGAGTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 103845 CCACAGGCTGCCCACCACTGGCTACCTCGTCTACCGCCGGGCGGAGTGGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 CTGAGACCCAGGGGGCTGTGACAGAGGAGGAGGGCAGTGGGCAGTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103895 CTGAGACCCAGGGGGCTGTGACAGAGGAGGAGGGCAGTGGGCAGTCAGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 GCAAGAAGCAGAGGGGAGGAGCAAGGGTGCCAGGGAGATGGGGATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103945 GCAAGAAGCAGAGGGGAGGAGCAAGGGTGCCAGGGAGATGGGGATGCTGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2220 GGTCAAAGCCAGCCCCAGGGACATTCGGGAACAGTCTGAGACAACTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103995 GGTCAAAGCCAGCCCCAGGGACATTCGGGAACAGTCTGAGACAACTGCTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2270 AAGGGGGCCAGGGTCAAGCCCAGGAAGGCCCTGCTCAGCCAGGGGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104045 AAGGGGGCCAGGGTCAAGCCCAGGAAGGCCCTGCTCAGCCAGGGGAACCA

   2400     .    :    .    :    .    :
   2320 GAGGCAGAGGGAAGCCGGGCAGCAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 104095 GAGGCAGAGGGAAGCCGGGCAGCAGAGGAG