seq1 = pF1KE1375.tfa, 636 bp
seq2 = pF1KE1375/gi568815595r_167584311.tfa (gi568815595r:167584311_167820157), 235847 bp

>pF1KE1375 636
>gi568815595r:167584311_167820157 (Chr3)

(complement)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-150  (115263-115316)   100% ->
151-268  (123032-123149)   100% ->
269-395  (124436-124562)   100% ->
396-474  (132465-132543)   100% ->
475-557  (132842-132924)   100% ->
558-636  (135769-135847)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGATGACAATGGAAGAGATGAAGAATGAAGCTGAGACCACATCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGATGACAATGGAAGAGATGAAGAATGAAGCTGAGACCACATCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTTTCTATGCCCCTCTATGCAGTCATGTATCCTGTGTTTAATGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 GGTTTCTATGCCCCTCTATGCAGTCATGTATCCTGTGTTTAATGAGGTG.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      CTAGAACGAGTAAATCTGTCTGCAGCCCAGACACTGAGAGCCGCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..CAGCTAGAACGAGTAAATCTGTCTGCAGCCCAGACACTGAGAGCCGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCATCAAG         GCTGAAAAAGAAAATCCAGGTCTCACACAAGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 115308 TTCATCAAGGTG...TAGGCTGAAAAAGAAAATCCAGGTCTCACACAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CATCATTATGAAAATTTTAGAGAAAAAAAGCGTGGAAGTTAACTTCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123064 CATCATTATGAAAATTTTAGAGAAAAAAAGCGTGGAAGTTAACTTCACGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGTCCCTTCTTCGTATGGCAGCTGATGATGTAGAAG         AGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 123114 AGTCCCTTCTTCGTATGGCAGCTGATGATGTAGAAGGTA...CAGAGTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATGATTGAACGACCAGAGCCAGAATTCCAAGACCTAAACGAAAAGGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124441 ATGATTGAACGACCAGAGCCAGAATTCCAAGACCTAAACGAAAAGGCACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGCACTTAAACAAATTCTCAGTAAGATCCCAGATGAGATCAATGACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124491 AGCACTTAAACAAATTCTCAGTAAGATCCCAGATGAGATCAATGACAGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGAGGTTTCTGCAGACAATCAA         GGATATAGCTAGTGCAATA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 124541 TGAGGTTTCTGCAGACAATCAAGTA...CAGGGATATAGCTAGTGCAATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAAGAACTTCTTGATACAGTGAATAATGTCTTCAAGAAATATCAATACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132484 AAAGAACTTCTTGATACAGTGAATAATGTCTTCAAGAAATATCAATACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAACCGCAGG         GCACTTGAACACCAAAAGAAAGAATTTGTAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 132534 GAACCGCAGGGTA...TAGGCACTTGAACACCAAAAGAAAGAATTTGTAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGTACTCCAAAAGTTTCAGTGATACTCTGAAAACGTATTTTAAAGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132873 AGTACTCCAAAAGTTTCAGTGATACTCTGAAAACGTATTTTAAAGATGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AA         GGCAATAAATGTGTTCGTAAGTGCCAACCGACTAATTCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132923 AAGTA...CAGGGCAATAAATGTGTTCGTAAGTGCCAACCGACTAATTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TCAAACCAACTTAATACTTCAGACCTTCAAAACTGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135808 TCAAACCAACTTAATACTTCAGACCTTCAAAACTGTGGCC