seq1 = pF1KE1371.tfa, 585 bp
seq2 = pF1KE1371/gi568815582r_88543356.tfa (gi568815582r:88543356_88751013), 207658 bp

>pF1KE1371 585
>gi568815582r:88543356_88751013 (Chr16)

(complement)

1-58  (100001-100058)   98% ->
59-128  (102900-102969)   100% ->
129-203  (103839-103913)   100% ->
204-287  (104176-104259)   100% ->
288-369  (104817-104898)   100% ->
370-585  (107443-107658)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCAGATCGAGTGGGCCATGTGGGCCAACGAGCAGGCGCTGGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100001 ATGGGGCAGATCGAGTGGGCCATGTGGGCCAACGAACAGGCGCTGGCGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCCTGA         TCCTCATCACCGGGGGCATCGTGGCCACAGCTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCCTGAGTG...CAGTCCTCATCACCGGGGGCATCGTGGCCACAGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGCGCTTCACCCAGTGGTACTTTGGTGCCTACTCCAT         TGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102933 GGCGCTTCACCCAGTGGTACTTTGGTGCCTACTCCATGTA...CAGTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCGGGCGTGTTTGTGTGCCTGCTGGAGTACCCCCGGGGGAAGAGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103843 GCGGGCGTGTTTGTGTGCCTGCTGGAGTACCCCCGGGGGAAGAGGAAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGGCTCCACCATGGAGCGCTG         GGGACAGAAGTACATGACCG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 103893 GGGCTCCACCATGGAGCGCTGGTG...CAGGGGACAGAAGTACATGACCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CCGTGGTGAAGCTGTTCGGGCCCTTTACCAGGAATTACTATGTTCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104196 CCGTGGTGAAGCTGTTCGGGCCCTTTACCAGGAATTACTATGTTCGGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTCCTGCATCTCCT         GCTCTCGGTGCCCGCCGGCTTCCTGCT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104246 GTCCTGCATCTCCTGTG...CAGGCTCTCGGTGCCCGCCGGCTTCCTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GGCCACCATCCTTGGGACCGCCTGCCTGGCCATTGCGAGCGGCATCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104844 GGCCACCATCCTTGGGACCGCCTGCCTGGCCATTGCGAGCGGCATCTACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TACTG         GCGGCTGTGCGTGGCGAGCAGTGGACGCCCATCGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104894 TACTGGTG...CAGGCGGCTGTGCGTGGCGAGCAGTGGACGCCCATCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 CCCAAGCCCCGGGAGCGGCCGCAGATCGGAGGCACCATCAAGCAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107479 CCCAAGCCCCGGGAGCGGCCGCAGATCGGAGGCACCATCAAGCAGCCGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CAGCAACCCCCCGCCGCGGCCCCCGGCCGAGGCCCGCAAGAAGCCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107529 CAGCAACCCCCCGCCGCGGCCCCCGGCCGAGGCCCGCAAGAAGCCCAGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGGAGGAGGCTGCGGCGGCGGCGGGGGGACCCCCGGGAGGTCCCCAGGTC
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107579 AGGAGGAGGCTGCGGTGGCGGCGGGGGGACCCCCGGGAGGTCCCCAGGTC

    600     .    :    .    :    .    :
    556 AACCCCATCCCGGTGACCGACGAGGTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 107629 AACCCCATCCCGGTGACCGACGAGGTCGTG