seq1 = pF1KE1370.tfa, 747 bp
seq2 = pF1KE1370/gi568815597f_76599789.tfa (gi568815597f:76599789_76800535), 200747 bp

>pF1KE1370 747
>gi568815597f:76599789_76800535 (Chr1)

1-747  (100001-100747)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCCCTCCAGGAAGTTCTTCGTTGGGGGAAACTGGAAGATGAACGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCCCTCCAGGAAGTTCTTCGTTGGGGGGAACTGGAAGATGAACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGGAAGCAGAGTCTGGGGGAGCTCATCGGCACTCTGAACGCGGCCAAGG
        ||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||
 100051 GCGAAAGCAGAGTCTGCGGGAGCTCGTCCGCACTCTGAACGCGGCCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCGGCCGACACCGAGGTGGTTTGTGCTCCCCCTACTGCCTATATCGAC
        |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
 100101 TGCCGGCCGACACCGAGGTGGTTTGTACTCCGCCTACTGCCTATATCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCGCCCGGCAGAAGCTAGATCCCAAGATTGCTGTGGCTGCGCAGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCGCCCGGCAGAAGCTAGATCCCAAGATTGCTGTGGCTGCGCAGAACTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTACAAAGTGACTAATGGGGCTTTTACTGGGGAGATCAGCCCTGGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTACAAAGTGACTAATGGGGCTTTTACTGGGGAGATCAGCCCTGGCATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAAAGACTGCGGAGCCACGTGGGTGGTCCTGGGGCACTCAGAGAGAAGG
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAAAGACTGCAGAGCCACGTGGGTGGTCCTGGGGCACTCAGAGAGAAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CATGTCTTTGGGGAGTCAGATGAGCTGATTGGGCAGAAAGTGGCCCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CATGTCTTTGGGGAGTCAGATGAGCTGATTGGGCAGAAAGTGGCCCATGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCTGGCAGAGGGACTCGGAGTAATCGCCTGCATTGGGGAGAAGCTAGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100351 TCTGGCAGAGGGACTCGGAGTAATCGCCTGCACTGGGGAGAAGCTAGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAAGGGAAGCTGGCATCACTGAGAAGGTTGTTTTCGAGCAGACAAAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAAGGGAAGCTGGCATCACTGAGAAGGTTGTTTTCGAGCAGACAAAGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCGCAGATAACGTGAAGGACTGGAGCAAGGTCGTCCTGGCCTATGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCGCAGATAACGTGAAGGACTGGAGCAAGGTCGTCCTGGCCTATGAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGTGTGGGCCATTGGTACTGGCAAGACTGCAACACCCCAACAGGCCCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100501 TGTGTGGGCCATTGGTACTGGCAAGACTGCAACACCCCAACAGGACCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGTACACGAGAAGCTCCGAGGATGGCTGAAGTCCAACGTCTCTGATGCG
        |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100551 AAGTACACGACAAGCTCCGAGGATGGCTTAAGTCCAACGTCTCTGATGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGGCTCAGAGCACCCGTATCATTTATGGAGGCTCTGTGACTGGGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGGCTCAGAGCACCCGTATCATTTATGGAGGCTCTGTGACTGGGGCAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTGCAAGGAGCTGGCCAGCCAGCCTGATGTGGATGGCTTCCTTGTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
 100651 CTGCAAGGAGCTGGCCAGCCAGCCTGGCGTGGATGGCTTCCTTGTGGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    701 GTGCTTCCCTCAAGCCCGAATTCGTGGACATCATCAATGCCAAACAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTGCTTCCCTCAAGCCCGAATTCGTGGACATCATCAATGCCAAACAA