seq1 = pF1KE1370.tfa, 747 bp
seq2 = pF1KE1370/gi568815586f_6767567.tfa (gi568815586f:6767567_6970380), 202814 bp

>pF1KE1370 747
>gi568815586f:6767567_6970380 (Chr12)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-239  (101298-101421)   100% ->
240-324  (101533-101617)   100% ->
325-457  (101692-101824)   100% ->
458-543  (102122-102207)   100% ->
544-631  (102483-102570)   100% ->
632-747  (102699-102814)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCCCTCCAGGAAGTTCTTCGTTGGGGGAAACTGGAAGATGAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCCCTCCAGGAAGTTCTTCGTTGGGGGAAACTGGAAGATGAACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGGAAGCAGAGTCTGGGGGAGCTCATCGGCACTCTGAACGCGGCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGGAAGCAGAGTCTGGGGGAGCTCATCGGCACTCTGAACGCGGCCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCGGCCGACACCG         AGGTGGTTTGTGCTCCCCCTACTGCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCGGCCGACACCGGTA...CAGAGGTGGTTTGTGCTCCCCCTACTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATATCGACTTCGCCCGGCAGAAGCTAGATCCCAAGATTGCTGTGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101324 TATATCGACTTCGCCCGGCAGAAGCTAGATCCCAAGATTGCTGTGGCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAGAACTGCTACAAAGTGACTAATGGGGCTTTTACTGGGGAGATCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101374 GCAGAACTGCTACAAAGTGACTAATGGGGCTTTTACTGGGGAGATCAGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    240        CCCTGGCATGATCAAAGACTGCGGAGCCACGTGGGTGGTCCTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101424 G...TAGCCCTGGCATGATCAAAGACTGCGGAGCCACGTGGGTGGTCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGGCACTCAGAGAGAAGGCATGTCTTTGGGGAGTCAGATGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101576 GGGCACTCAGAGAGAAGGCATGTCTTTGGGGAGTCAGATGAGGTT...CA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    325  CTGATTGGGCAGAAAGTGGCCCATGCTCTGGCAGAGGGACTCGGAGTAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101691 GCTGATTGGGCAGAAAGTGGCCCATGCTCTGGCAGAGGGACTCGGAGTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCGCCTGCATTGGGGAGAAGCTAGATGAAAGGGAAGCTGGCATCACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101741 TCGCCTGCATTGGGGAGAAGCTAGATGAAAGGGAAGCTGGCATCACTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGGTTGTTTTCGAGCAGACAAAGGTCATCGCAG         ATAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101791 AAGGTTGTTTTCGAGCAGACAAAGGTCATCGCAGGTA...CAGATAACGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAAGGACTGGAGCAAGGTCGTCCTGGCCTATGAGCCTGTGTGGGCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102129 GAAGGACTGGAGCAAGGTCGTCCTGGCCTATGAGCCTGTGTGGGCCATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTACTGGCAAGACTGCAACACCCCAACAG         GCCCAGGAAGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 102179 GTACTGGCAAGACTGCAACACCCCAACAGGTA...TAGGCCCAGGAAGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CACGAGAAGCTCCGAGGATGGCTGAAGTCCAACGTCTCTGATGCGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102495 CACGAGAAGCTCCGAGGATGGCTGAAGTCCAACGTCTCTGATGCGGTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCAGAGCACCCGTATCATTTATGGAG         GCTCTGTGACTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102545 TCAGAGCACCCGTATCATTTATGGAGGTG...CAGGCTCTGTGACTGGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CAACCTGCAAGGAGCTGGCCAGCCAGCCTGATGTGGATGGCTTCCTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102714 CAACCTGCAAGGAGCTGGCCAGCCAGCCTGATGTGGATGGCTTCCTTGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GGTGGTGCTTCCCTCAAGCCCGAATTCGTGGACATCATCAATGCCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102764 GGTGGTGCTTCCCTCAAGCCCGAATTCGTGGACATCATCAATGCCAAACA

    800 
    747 A
        |
 102814 A