seq1 = pF1KE1365.tfa, 1170 bp
seq2 = pF1KE1365/gi568815591f_74674032.tfa (gi568815591f:74674032_74889157), 215126 bp

>pF1KE1365 1170
>gi568815591f:74674032_74889157 (Chr7)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-153  (103236-103316)   100% ->
154-229  (105051-105126)   100% ->
230-395  (105226-105391)   100% ->
396-451  (106749-106804)   100% ->
452-574  (108908-109030)   100% ->
575-682  (109494-109601)   100% ->
683-800  (111151-111268)   100% ->
801-905  (113953-114057)   100% ->
906-1051  (114528-114673)   100% ->
1052-1170  (115008-115126)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGACACCTTCATCCGTCACATCGCCCTGCTGGGCTTTGAGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGACACCTTCATCCGTCACATCGCCCTGCTGGGCTTTGAGAAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCGTACCCAGCCAGCACTAT         GTGTACATGTTCCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 CTTCGTACCCAGCCAGCACTATGTG...CAGGTGTACATGTTCCTGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATGGCAGGACCTGTCGGAGAAGGTGGTCTACCGGCGCTTCACCGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103255 AATGGCAGGACCTGTCGGAGAAGGTGGTCTACCGGCGCTTCACCGAGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACGAGTTCCAT         AAAACCTTAAAAGAAATGTTCCCTATTGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103305 TACGAGTTCCATGTG...TAGAAAACCTTAAAAGAAATGTTCCCTATTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGCAGGGGCGATCAATCCAGAGAACAGGATCATCCCCCACCTCCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105080 GGCAGGGGCGATCAATCCAGAGAACAGGATCATCCCCCACCTCCCAGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    230       CTCCCAAGTGGTTTGACGGGCAGCGGGCCGCCGAGAACCGCCAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105130 ...CAGCTCCCAAGTGGTTTGACGGGCAGCGGGCCGCCGAGAACCGCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGCACACTTACCGAGTACTGCAGCACGCTCATGAGCCTGCCCACCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105270 GGCACACTTACCGAGTACTGCAGCACGCTCATGAGCCTGCCCACCAAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTCCCGCTGTCCCCACCTCCTCGACTTCTTCAAGGTGCGCCCTGATGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105320 CTCCCGCTGTCCCCACCTCCTCGACTTCTTCAAGGTGCGCCCTGATGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCAAGCTCCCCACGGACAACCA         GACAAAAAAGCCAGAGACA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105370 TCAAGCTCCCCACGGACAACCAGTG...CAGGACAAAAAAGCCAGAGACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TACTTGATGCCCAAAGATGGCAAGAGTACCGCGACAG         ACAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 106768 TACTTGATGCCCAAAGATGGCAAGAGTACCGCGACAGGTG...CAGACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CACCGGCCCCATCATCCTGCAGACGTACCGCGCCATTGCCAACTACGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108912 CACCGGCCCCATCATCCTGCAGACGTACCGCGCCATTGCCAACTACGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGACCTCGGGCTCCGAGATGGCTCTGTCCACGGGGGACGTGGTGGAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108962 AGACCTCGGGCTCCGAGATGGCTCTGTCCACGGGGGACGTGGTGGAGGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTAGAGAAGAGCGAGAGCG         GTTGGTGGTTCTGTCAGATGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109012 GTAGAGAAGAGCGAGAGCGGTC...CAGGTTGGTGGTTCTGTCAGATGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGCAAAGCGAGGCTGGATCCCAGCGTCCTTCCTCGAGCCCCTGGACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109516 AGCAAAGCGAGGCTGGATCCCAGCGTCCTTCCTCGAGCCCCTGGACAGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTGACGAGACGGAAGACCCTGAGCCCAACTATGCAG         GTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 109566 CTGACGAGACGGAAGACCCTGAGCCCAACTATGCAGGTG...CAGGTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CCATACGTCGCCATCAAGGCCTACACTGCTGTGGAGGGGGACGAGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111156 CCATACGTCGCCATCAAGGCCTACACTGCTGTGGAGGGGGACGAGGTGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCTGCTCGAGGGTGAAGCTGTTGAGGTCATTCACAAGCTCCTGGACGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111206 CCTGCTCGAGGGTGAAGCTGTTGAGGTCATTCACAAGCTCCTGGACGGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GGTGGGTCATCAG         GAAAGACGACGTCACAGGCTACTTCCCG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 111256 GGTGGGTCATCAGGTA...CAGGAAAGACGACGTCACAGGCTACTTCCCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TCCATGTACCTGCAAAAGTCAGGGCAAGACGTGTCCCAGGCCCAACGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113981 TCCATGTACCTGCAAAAGTCAGGGCAAGACGTGTCCCAGGCCCAACGCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GATCAAGCGGGGGGCGCCGCCCCGCAG         GTCGTCCATCCGCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 114031 GATCAAGCGGGGGGCGCCGCCCCGCAGGTA...CAGGTCGTCCATCCGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ACGCGCACAGCATCCACCAGCGGTCGCGGAAGCGCCTCAGCCAGGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114542 ACGCGCACAGCATCCACCAGCGGTCGCGGAAGCGCCTCAGCCAGGACGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TATCGCCGCAACAGCGTCCGTTTTCTGCAGCAGCGACGCCGCCAGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114592 TATCGCCGCAACAGCGTCCGTTTTCTGCAGCAGCGACGCCGCCAGGCGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GCCGGGACCGCAGAGCCCCGGGAGCCCGCTCG         AGGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 114642 GCCGGGACCGCAGAGCCCCGGGAGCCCGCTCGGTG...CAGAGGAGGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GGCAGACGCAGCGCTCTAAACCGCAGCCGGCGGTGCCCCCGCGGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115017 GGCAGACGCAGCGCTCTAAACCGCAGCCGGCGGTGCCCCCGCGGCCGAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GCCGACCTCATCCTGAACCGCTGCAGCGAGAGCACCAAGCGGAAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115067 GCCGACCTCATCCTGAACCGCTGCAGCGAGAGCACCAAGCGGAAGCTGGC

   1250     .    :
   1161 GTCTGCCGTC
        ||||||||||
 115117 GTCTGCCGTC