seq1 = pF1KE1348.tfa, 1416 bp
seq2 = pF1KE1348/gi568815591f_80546741.tfa (gi568815591f:80546741_80774144), 227404 bp

>pF1KE1348 1416
>gi568815591f:80546741_80774144 (Chr7)

1-120  (100001-100120)   100% ->
121-281  (109800-109960)   100% ->
282-429  (114323-114470)   100% ->
430-609  (116250-116429)   99% ->
610-701  (117666-117757)   100% ->
702-748  (119703-119749)   100% ->
749-818  (123213-123282)   100% ->
819-1006  (124237-124424)   100% ->
1007-1125  (125182-125300)   100% ->
1126-1199  (126030-126103)   100% ->
1200-1254  (126615-126669)   100% ->
1255-1416  (127243-127404)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTGTGACCGGAACTGTGGGCTCATCGCTGGGGCTGTCATTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCTGTGACCGGAACTGTGGGCTCATCGCTGGGGCTGTCATTGGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCCTGGCTGTGTTTGGAGGTATTCTAATGCCAGTTGGAGACCTGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTCCTGGCTGTGTTTGGAGGTATTCTAATGCCAGTTGGAGACCTGCTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCAGAAGACAATTAAAAAG         CAAGTTGTCCTCGAAGAAGGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100101 TCCAGAAGACAATTAAAAAGGTA...TAGCAAGTTGTCCTCGAAGAAGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACAATTGCTTTTAAAAATTGGGTTAAAACAGGCACAGAAGTTTACAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109821 ACAATTGCTTTTAAAAATTGGGTTAAAACAGGCACAGAAGTTTACAGACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTTTGGATCTTTGATGTGCAAAATCCACAGGAAGTGATGATGAACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109871 GTTTTGGATCTTTGATGTGCAAAATCCACAGGAAGTGATGATGAACAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCAACATTCAAGTTAAGCAAAGAGGTCCTTATACGTACAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 109921 GCAACATTCAAGTTAAGCAAAGAGGTCCTTATACGTACAGGTG...TAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTCGTTTTCTAGCCAAGGAAAATGTAACCCAGGACGCTGAGGACAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114324 GTTCGTTTTCTAGCCAAGGAAAATGTAACCCAGGACGCTGAGGACAACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGTCTCTTTCCTGCAGCCCAATGGTGCCATCTTCGAACCTTCACTATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114374 AGTCTCTTTCCTGCAGCCCAATGGTGCCATCTTCGAACCTTCACTATCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGGAACAGAGGCTGACAACTTCACAGTTCTCAATCTGGCTGTGGCA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 114424 TTGGAACAGAGGCTGACAACTTCACAGTTCTCAATCTGGCTGTGGCAGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    430       GCTGCATCCCATATCTATCAAAATCAATTTGTTCAAATGATCCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114474 ...TAGGCTGCATCCCATATCTATCAAAATCAATTTGTTCAAATGATCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAATTCACTTATTAACAAGTCAAAATCTTCTATGTTCCAAGTCAGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116294 CAATTCACTTATTAACAAGTCAAAATCTTCTATGTTCCAAGTCAGAACTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGAGAGAACTGTTATGGGGCTATAGGGATCCATTTTTGAGTTTGGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 116344 TGAGAGAACTGTTATGGGGCTATAGGGATCCATTTTTGAGTTTGGTTCCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TACCCTGTTACTACCACAGTTGGTCTGTTTTATCCT         TACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 116394 TACCCTGTTACTACCACAGTTGGTCTGTTTTATCCTGTA...CAGTACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAATACTGCAGATGGAGTTTATAAAGTTTTCAATGGAAAAGATAACATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117671 CAATACTGCAGATGGAGTTTATAAAGTTTTCAATGGAAAAGATAACATAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTAAAGTTGCCATAATCGACACATATAAAGGTAAAAG         GAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 117721 GTAAAGTTGCCATAATCGACACATATAAAGGTAAAAGGTA...TAGGAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGTCCTATTGGGAAAGTCACTGCGACATGATTAATGGTACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 119707 CTGTCCTATTGGGAAAGTCACTGCGACATGATTAATGGTACAGGTA...C

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    749   ATGCAGCCTCATTTCCACCTTTTGTTGAGAAAAGCCAGGTATTGCAGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123211 AGATGCAGCCTCATTTCCACCTTTTGTTGAGAAAAGCCAGGTATTGCAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCTTTTCTTCTGATATTTGCAG         GTCAATCTATGCTGTATTT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 123261 TCTTTTCTTCTGATATTTGCAGGTA...TAGGTCAATCTATGCTGTATTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GAATCCGACGTTAATCTGAAAGGAATCCCTGTGTATAGATTTGTTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124256 GAATCCGACGTTAATCTGAAAGGAATCCCTGTGTATAGATTTGTTCTTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 ATCCAAGGCCTTTGCCTCTCCAGTTGAAAACCCAGACAACTATTGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124306 ATCCAAGGCCTTTGCCTCTCCAGTTGAAAACCCAGACAACTATTGTTTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCACAGAAAAAATTATCTCAAAAAATTGTACATCATATGGTGTGCTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124356 GCACAGAAAAAATTATCTCAAAAAATTGTACATCATATGGTGTGCTAGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATCAGCAAATGCAAAGAAG         GGAGACCTGTGTACATTTCACT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 124406 ATCAGCAAATGCAAAGAAGGTG...CAGGGAGACCTGTGTACATTTCACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TCCTCATTTTCTGTATGCAAGTCCTGATGTTTCAGAACCTATTGATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125204 TCCTCATTTTCTGTATGCAAGTCCTGATGTTTCAGAACCTATTGATGGAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TAAACCCAAATGAAGAAGAACATAGGACATACTTGGATATTGAACCT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 125254 TAAACCCAAATGAAGAAGAACATAGGACATACTTGGATATTGAACCTGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1126       ATAACTGGATTCACTTTACAATTTGCAAAACGGCTGCAGGTCAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125304 ...TAGATAACTGGATTCACTTTACAATTTGCAAAACGGCTGCAGGTCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCTATTGGTCAAGCCATCAGAAAAAATTCA         AGTATTAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 126074 CCTATTGGTCAAGCCATCAGAAAAAATTCAGTG...CAGAGTATTAAAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ATCTGAAGAGGAACTATATTGTGCCTATTCTTTGGCTTAATGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 126626 ATCTGAAGAGGAACTATATTGTGCCTATTCTTTGGCTTAATGAGGTT...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1255    ACTGGGACCATTGGTGATGAGAAGGCAAACATGTTCAGAAGTCAAGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127240 CAGACTGGGACCATTGGTGATGAGAAGGCAAACATGTTCAGAAGTCAAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 AACTGGAAAAATAAACCTCCTTGGCCTGATAGAAATGATCTTACTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127290 AACTGGAAAAATAAACCTCCTTGGCCTGATAGAAATGATCTTACTCAGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TTGGTGTGGTGATGTTTGTTGCTTTTATGATTTCATATTGTGCATGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127340 TTGGTGTGGTGATGTTTGTTGCTTTTATGATTTCATATTGTGCATGCAGA

   1500     .    :    .
   1402 TCGAAAACAATAAAA
        |||||||||||||||
 127390 TCGAAAACAATAAAA