seq1 = pF1KE1346.tfa, 765 bp
seq2 = pF1KE1346/gi568815584r_24473640.tfa (gi568815584r:24473640_24676223), 202584 bp

>pF1KE1346 765
>gi568815584r:24473640_24676223 (Chr14)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-203  (100812-100959)   100% ->
204-339  (101414-101549)   100% ->
340-594  (101725-101979)   100% ->
595-765  (102414-102584)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCCACTCCTGCTTCTGCTGGCCTTTCTCCTACCCACTGGGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCCACTCCTGCTTCTGCTGGCCTTTCTCCTACCCACTGGGGCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCAG         GGGAGATCATCGGAGGCCGGGAGAGCAGGCCCCACT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCAGGTG...CAGGGGAGATCATCGGAGGCCGGGAGAGCAGGCCCCACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCGCCCCTACATGGCGTATCTTCAGATCCAGAGTCCAGCAGGTCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100848 CCCGCCCCTACATGGCGTATCTTCAGATCCAGAGTCCAGCAGGTCAGAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGATGTGGAGGGTTCCTGGTGCGAGAAGACTTTGTGCTGACAGCAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100898 AGATGTGGAGGGTTCCTGGTGCGAGAAGACTTTGTGCTGACAGCAGCTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTGCTGGGGAAG         CAATATAAATGTCACCCTGGGCGCCCACA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100948 TTGCTGGGGAAGGTG...CAGCAATATAAATGTCACCCTGGGCGCCCACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATATCCAGAGACGGGAAAACACCCAGCAACACATCACTGCGCGCAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101443 ATATCCAGAGACGGGAAAACACCCAGCAACACATCACTGCGCGCAGAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCCGCCACCCTCAATATAATCAGCGGACCATCCAGAATGACATCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101493 ATCCGCCACCCTCAATATAATCAGCGGACCATCCAGAATGACATCATGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ATTGCAG         CTGAGCAGAAGAGTCAGACGGAATCGAAACGTGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101543 ATTGCAGGTA...CAGCTGAGCAGAAGAGTCAGACGGAATCGAAACGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACCCAGTGGCTCTGCCTAGAGCCCAGGAGGGACTGAGACCCGGGACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101759 ACCCAGTGGCTCTGCCTAGAGCCCAGGAGGGACTGAGACCCGGGACGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGCACTGTGGCCGGCTGGGGCAGGGTCAGCATGAGGAGGGGAACAGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101809 TGCACTGTGGCCGGCTGGGGCAGGGTCAGCATGAGGAGGGGAACAGATAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACTCCGAGAGGTGCAGCTGAGAGTGCAGAGGGATAGGCAGTGCCTCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101859 ACTCCGAGAGGTGCAGCTGAGAGTGCAGAGGGATAGGCAGTGCCTCCGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCTTCGGTTCCTACGACCCCCGAAGGCAGATTTGTGTGGGGGACCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101909 TCTTCGGTTCCTACGACCCCCGAAGGCAGATTTGTGTGGGGGACCGGCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAACGGAAGGCTGCCTTCAAG         GGGGATTCCGGAGGCCCCCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101959 GAACGGAAGGCTGCCTTCAAGGTA...CAGGGGGATTCCGGAGGCCCCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTGTGTAACAATGTGGCCCACGGCATCGTCTCCTATGGAAAGTCGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102434 GCTGTGTAACAATGTGGCCCACGGCATCGTCTCCTATGGAAAGTCGTCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGGTTCCTCCAGAAGTCTTCACCAGGGTCTCAAGTTTCCTGCCCTGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102484 GGGTTCCTCCAGAAGTCTTCACCAGGGTCTCAAGTTTCCTGCCCTGGATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGGACAACAATGAGAAGCTTCAAACTGCTGGATCAGATGGAGACCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102534 AGGACAACAATGAGAAGCTTCAAACTGCTGGATCAGATGGAGACCCCCCT

    800 
    765 G
        |
 102584 G