seq1 = pF1KE1337.tfa, 474 bp
seq2 = pF1KE1337/gi568815586r_10307656.tfa (gi568815586r:10307656_10509575), 201920 bp

>pF1KE1337 474
>gi568815586r:10307656_10509575 (Chr12)

(complement)

1-187  (100001-100187)   100% ->
188-286  (100566-100664)   100% ->
287-340  (101194-101247)   100% ->
341-474  (101787-101920)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATAAACAAAGAGGAACCTACTCAGAAGTGAGTCTGGCCCAGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATAAACAAAGAGGAACCTACTCAGAAGTGAGTCTGGCCCAGGACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAAGAGGCAGCAAAGGAAACTTAAGGGCAATAAAATCTCCATTTCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAAGAGGCAGCAAAGGAAACTTAAGGGCAATAAAATCTCCATTTCAGGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAAACAGGAAATATTCCAAGTAGAATTAAACCTTCAAAATGCTTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAAACAGGAAATATTCCAAGTAGAATTAAACCTTCAAAATGCTTCTTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATCATCAAGGGAATGACAAGACATATCACTGCAAAG         GTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100151 GATCATCAAGGGAATGACAAGACATATCACTGCAAAGGTA...CAGGTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACTGCCACCTCCAGAGAAGCTCACTGCTGAGGTCCTAGGAATCATTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100570 ACTGCCACCTCCAGAGAAGCTCACTGCTGAGGTCCTAGGAATCATTTGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGTCCTGATGGCCACTGTGTTAAAAACAATAGTTCTTATTCCTT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100620 TTGTCCTGATGGCCACTGTGTTAAAAACAATAGTTCTTATTCCTTGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287     GTATTGGAGTACTGGAGCAGAACAATTTTTCCCTGAATAGAAGAAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100670 .TAGGTATTGGAGTACTGGAGCAGAACAATTTTTCCCTGAATAGAAGAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGAAAG         CACGTCATTGTGGCCATTGTCCTGAGGAGTGGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101240 GCAGAAAGGTA...TAGCACGTCATTGTGGCCATTGTCCTGAGGAGTGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTACATATTCCAACAGTTGTTATTACATTGGTAAGGAAAGAAGAACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101820 TTACATATTCCAACAGTTGTTATTACATTGGTAAGGAAAGAAGAACTTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAGAAAGAGTTTGCTGGCCTGTGCTTCGAAGAACTCTGATCTGCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101870 GAAGAAAGAGTTTGCTGGCCTGTGCTTCGAAGAACTCTGATCTGCTTTCT

    500 
    474 A
        |
 101920 A