seq1 = pF1KE1330.tfa, 396 bp
seq2 = pF1KE1330/gi568815597r_162298923.tfa (gi568815597r:162298923_162512016), 213094 bp

>pF1KE1330 396
>gi568815597r:162298923_162512016 (Chr1)

(complement)

1-134  (100001-100134)   100% ->
135-198  (109215-109278)   100% ->
199-363  (112930-113094)   100% ->
364-396  (114702-114734)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCTGCCTTACTACCATGGACGTCTGACCAAGCAAGACTGTGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCTGCCTTACTACCATGGACGTCTGACCAAGCAAGACTGTGAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGCTGCTCAAGGAAGGGGTGGATGGCAACTTTCTTTTAAGAGACAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGCTGCTCAAGGAAGGGGTGGATGGCAACTTTCTTTTAAGAGACAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTCGATACCAGGAGTCCTGTGCCTCTGTGTCTC         GTTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100101 AGTCGATACCAGGAGTCCTGTGCCTCTGTGTCTCGTG...CAGGTTTAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATATTGTCTACACATACCGAATCTTCAGAGAGAAACACGGGTATTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109222 AATATTGTCTACACATACCGAATCTTCAGAGAGAAACACGGGTATTACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATACAG         ACTGCAGAAGGTTCTCCAAAACAGGTCTTTCCAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109272 GATACAGGTA...CAGACTGCAGAAGGTTCTCCAAAACAGGTCTTTCCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCCTAAAGGAACTGATCTCCAAATTTGAAAAACCAAATCAGGGGATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112964 GCCTAAAGGAACTGATCTCCAAATTTGAAAAACCAAATCAGGGGATGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTCACCTTTTAAAGCCAATAAAGAGAACCAGCCCCAGCTTGAGATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113014 GTTCACCTTTTAAAGCCAATAAAGAGAACCAGCCCCAGCTTGAGATGGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGGATTGAAATTAGAGTTGGAAACATTTGTG         AACAGTAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 113064 AGGATTGAAATTAGAGTTGGAAACATTTGTGGTA...AAGAACAGTAACA

    400     .    :    .    :
    374 GCGATTATGTGGATGTCTTGCCT
        |||||||||||||||||||||||
 114712 GCGATTATGTGGATGTCTTGCCT