seq1 = pF1KE1326.tfa, 1722 bp
seq2 = pF1KE1326/gi568815597r_155190575.tfa (gi568815597r:155190575_155401395), 210821 bp

>pF1KE1326 1722
>gi568815597r:155190575_155401395 (Chr1)

(complement)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-283  (101116-101298)   100% ->
284-375  (105640-105731)   100% ->
376-507  (105828-105959)   100% ->
508-694  (106094-106280)   100% ->
695-965  (106644-106914)   100% ->
966-1116  (107011-107161)   100% ->
1117-1269  (107806-107958)   100% ->
1270-1436  (108053-108219)   100% ->
1437-1618  (109459-109640)   100% ->
1619-1722  (110718-110821)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGATCCAGGAGAACATATCATCCCTGCAGCTTCGGTCATGGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGATCCAGGAGAACATATCATCCCTGCAGCTTCGGTCATGGGTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAAGTCCCAAAGAGACTTAGCAAAGTCCATCCTGATTGGGGCTCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAAGTCCCAAAGAGACTTAGCAAAGTCCATCCTGATTGGGGCTCCAGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          GGCCAGCGGGGTATCTGCGGCGGGCCAGTGTGGCCCAACTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTA...CAGGGCCAGCGGGGTATCTGCGGCGGGCCAGTGTGGCCCAACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCCAGGAGCTGGGCACTGCCTTCTTCCAGCAGCAGCAGCTGCCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101157 ACCCAGGAGCTGGGCACTGCCTTCTTCCAGCAGCAGCAGCTGCCAGCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATGGCAGACACCTTCCTGGAACACCTCTGCCTACTGGACATTGACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101207 TATGGCAGACACCTTCCTGGAACACCTCTGCCTACTGGACATTGACTCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCCCGTGGCTGCTCGCAGTACCAGCATCATTGCCACCATCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101257 AGCCCGTGGCTGCTCGCAGTACCAGCATCATTGCCACCATCGGTA...TA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    284  GGCCAGCATCTCGCTCCGTGGAGCGCCTCAAGGAGATGATCAAGGCCGG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105639 GGGCCAGCATCTCGCTCCGTGGAGCGCCTCAAGGAGATGATCAAGGCCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GATGAACATTGCGCGACTCAACTTCTCCCACGGCTCCCACGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 105689 GATGAACATTGCGCGACTCAACTTCTCCCACGGCTCCCACGAGGTG...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    376   TACCATGCTGAGTCCATCGCCAACGTCCGGGAGGCGGTGGAGAGCTTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105826 AGTACCATGCTGAGTCCATCGCCAACGTCCGGGAGGCGGTGGAGAGCTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCAGGTTCCCCACTCAGCTACCGGCCCGTGGCCATCGCCCTGGACACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105876 GCAGGTTCCCCACTCAGCTACCGGCCCGTGGCCATCGCCCTGGACACCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGGACCGGAGATCCGCACTGGGATCCTGCAGGGG         GGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 105926 GGGACCGGAGATCCGCACTGGGATCCTGCAGGGGGTG...TAGGGTCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGTCGGAAGTGGAGCTGGTGAAGGGCTCCCAGGTGCTGGTGACTGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106101 AGTCGGAAGTGGAGCTGGTGAAGGGCTCCCAGGTGCTGGTGACTGTGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCCGCGTTCCGGACGCGGGGGAACGCGAACACCGTGTGGGTGGACTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106151 CCCGCGTTCCGGACGCGGGGGAACGCGAACACCGTGTGGGTGGACTACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAATATTGTCCGGGTCGTGCCGGTGGGGGGCCGCATCTACATTGACGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106201 CAATATTGTCCGGGTCGTGCCGGTGGGGGGCCGCATCTACATTGACGACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGCTCATCTCCCTAGTGGTCCAGAAAATCG         GCCCAGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 106251 GGCTCATCTCCCTAGTGGTCCAGAAAATCGGTG...CAGGCCCAGAGGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGGTGACCCAAGTGGAGAACGGCGGCGTCCTGGGCAGCCGGAAGGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106655 CTGGTGACCCAAGTGGAGAACGGCGGCGTCCTGGGCAGCCGGAAGGGCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAACTTGCCAGGGGCCCAGGTGGACTTGCCCGGGCTGTCCGAGCAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106705 GAACTTGCCAGGGGCCCAGGTGGACTTGCCCGGGCTGTCCGAGCAGGACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCCGAGACCTGCGCTTCGGGGTGGAGCATGGGGTGGACATCGTCTTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106755 TCCGAGACCTGCGCTTCGGGGTGGAGCATGGGGTGGACATCGTCTTTGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TCCTTTGTGCGGAAAGCCAGCGACGTGGCTGCCGTCAGGGCTGCTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106805 TCCTTTGTGCGGAAAGCCAGCGACGTGGCTGCCGTCAGGGCTGCTCTGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TCCGGAAGGACACGGCATCAAGATCATCAGCAAAATTGAGAACCACGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106855 TCCGGAAGGACACGGCATCAAGATCATCAGCAAAATTGAGAACCACGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GCGTGAAGAG         GTTTGATGAAATCCTGGAGGTGAGCGACGGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106905 GCGTGAAGAGGTG...CAGGTTTGATGAAATCCTGGAGGTGAGCGACGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ATCATGGTGGCACGGGGGGACCTAGGCATCGAGATCCCAGCAGAGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107042 ATCATGGTGGCACGGGGGGACCTAGGCATCGAGATCCCAGCAGAGAAGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TTTCCTGGCTCAGAAGATGATGATTGGGCGCTGCAACTTGGCGGGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107092 TTTCCTGGCTCAGAAGATGATGATTGGGCGCTGCAACTTGGCGGGCAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CTGTTGTCTGTGCCACACAG         ATGCTGGAGAGCATGATTACC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 107142 CTGTTGTCTGTGCCACACAGGTC...CAGATGCTGGAGAGCATGATTACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AAGCCCCGGCCAACGAGGGCAGAGACAAGCGATGTCGCCAATGCTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107827 AAGCCCCGGCCAACGAGGGCAGAGACAAGCGATGTCGCCAATGCTGTGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGATGGGGCTGACTGCATCATGCTGTCAGGGGAGACTGCCAAGGGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107877 GGATGGGGCTGACTGCATCATGCTGTCAGGGGAGACTGCCAAGGGCAACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TCCCTGTGGAAGCGGTGAAGATGCAGCATGCG         ATTGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 107927 TCCCTGTGGAAGCGGTGAAGATGCAGCATGCGGTA...CAGATTGCCCGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAGGCAGAGGCCGCAGTGTACCACCGGCAGCTGTTTGAGGAGCTACGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108062 GAGGCAGAGGCCGCAGTGTACCACCGGCAGCTGTTTGAGGAGCTACGTCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGCAGCGCCACTAAGCCGTGATCCCACTGAGGTCACCGCCATTGGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108112 GGCAGCGCCACTAAGCCGTGATCCCACTGAGGTCACCGCCATTGGTGCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGGAGGCTGCCTTCAAGTGCTGTGCTGCTGCCATCATTGTGCTGACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108162 TGGAGGCTGCCTTCAAGTGCTGTGCTGCTGCCATCATTGTGCTGACCACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 ACTGGCCG         CTCAGCCCAGCTTCTGTCTCGGTACCGACCTCG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108212 ACTGGCCGGTG...CAGCTCAGCCCAGCTTCTGTCTCGGTACCGACCTCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GGCAGCAGTCATTGCTGTCACCCGCTCTGCCCAGGCTGCCCGCCAGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109492 GGCAGCAGTCATTGCTGTCACCCGCTCTGCCCAGGCTGCCCGCCAGGTCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 ACTTATGCCGAGGAGTCTTCCCCTTGCTTTACCGTGAACCTCCAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109542 ACTTATGCCGAGGAGTCTTCCCCTTGCTTTACCGTGAACCTCCAGAAGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 ATCTGGGCAGATGATGTAGATCGCCGGGTGCAATTTGGCATTGAAAGTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 109592 ATCTGGGCAGATGATGTAGATCGCCGGGTGCAATTTGGCATTGAAAGTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1619         GAAAGCTCCGTGGCTTCCTCCGTGTTGGAGACCTGGTGATTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109642 TG...CAGGAAAGCTCCGTGGCTTCCTCCGTGTTGGAGACCTGGTGATTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TGGTGACAGGCTGGCGACCTGGCTCCGGCTACACCAACATCATGAGGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 110760 TGGTGACAGGCTGGCGACCTGGCTCCGGCTACACCAACATCATGCGGGTG

   1800     .    :
   1711 CTAAGCATATCC
        ||||||||||||
 110810 CTAAGCATATCC