seq1 = pF1KE1323.tfa, 285 bp
seq2 = pF1KE1323/gi568815596f_227713912.tfa (gi568815596f:227713912_227916384), 202473 bp

>pF1KE1323 285
>gi568815596f:227713912_227916384 (Chr2)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-188  (101546-101657)   100% ->
189-266  (102396-102473)   100% ->
267-285  (103151-103169)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGCTGTACCAAGAGTTTGCTCCTGGCTGCTTTGATGTCAGTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGCTGTACCAAGAGTTTGCTCCTGGCTGCTTTGATGTCAGTGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTCCACCTCTGCGGCGAATCAGAAG         CAAGCAACTTTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 ACTCCACCTCTGCGGCGAATCAGAAGGTA...CAGCAAGCAACTTTGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCTGTCTTGGATACACAGACCGTATTCTTCATCCTAAATTTATTGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101561 GCTGTCTTGGATACACAGACCGTATTCTTCATCCTAAATTTATTGTGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCACACGGCAGCTGGCCAATGAAGGCTGTGACATCAATGCTATCAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101611 TTCACACGGCAGCTGGCCAATGAAGGCTGTGACATCAATGCTATCATGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    189       CTTTCACACAAAGAAAAAGTTGTCTGTGTGCGCAAATCCAAAAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101661 ...CAGCTTTCACACAAAGAAAAAGTTGTCTGTGTGCGCAAATCCAAAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGACTTGGGTGAAATATATTGTGCGTCTCCTCAG         TAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102440 AGACTTGGGTGAAATATATTGTGCGTCTCCTCAGGTA...CAGTAAAAAA

    300     .    :
    274 GTCAAGAACATG
        ||||||||||||
 103158 GTCAAGAACATG