seq1 = pF1KE1316.tfa, 819 bp
seq2 = pF1KE1316/gi568815589r_97575442.tfa (gi568815589r:97575442_97797292), 221851 bp

>pF1KE1316 819
>gi568815589r:97575442_97797292 (Chr9)

(complement)

1-172  (100001-100172)   100% ->
173-283  (103534-103644)   100% ->
284-389  (107654-107759)   100% ->
390-555  (110032-110197)   100% ->
556-673  (112253-112370)   100% ->
674-819  (121706-121851)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCCGACGGGGCTTTGCCGGAGGCGGCGGCTTTAGAGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGCCGACGGGGCTTTGCCGGAGGCGGCGGCTTTAGAGCAACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGGAGCTGCCTGCCTCGGTGCGGGCGAGTATCGAGCGGAAGCGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCGGAGCTGCCTGCCTCGGTGCGGGCGAGTATCGAGCGGAAGCGGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGCACTGATGCTGCGCCAGGCCCGGCTGGCTGCCCGGCCCTACTCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGCACTGATGCTGCGCCAGGCCCGGCTGGCTGCCCGGCCCTACTCGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACGGCGGCTGCGGCTACTGGAG         GCATGGCTAATGTAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100151 ACGGCGGCTGCGGCTACTGGAGGTT...TAGGCATGGCTAATGTAAAAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCCCCAAAGATAATTGACACAGGAGGAGGCTTCATTTTAGAAGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103553 AGCCCCAAAGATAATTGACACAGGAGGAGGCTTCATTTTAGAAGAGGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGAAGAAGAACAGAAAATTGGAAAAGTTGTTCATCAACCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103603 AAGAAGAAGAACAGAAAATTGGAAAAGTTGTTCATCAACCAGGTA...TA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    284  GACCTGTTATGGAATTTGATTATGTAATATGCGAAGAATGTGGGAAAGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107653 GGACCTGTTATGGAATTTGATTATGTAATATGCGAAGAATGTGGGAAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ATTTATGGATTCTTATCTTATGAACCACTTTGATTTGCCAACTTGTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107703 ATTTATGGATTCTTATCTTATGAACCACTTTGATTTGCCAACTTGTGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTGCAG         AGATGCTGATGATAAACACAAGCTTATAACCAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107753 ACTGCAGGTA...CAGAGATGCTGATGATAAACACAAGCTTATAACCAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACAGAGGCAAAACAAGAATATCTTCTGAAAGACTGTGATTTAGAAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110066 ACAGAGGCAAAACAAGAATATCTTCTGAAAGACTGTGATTTAGAAAAAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGAGCCACCTCTTAAATTTATTGTGAAGAAGAATCCACATCATTCACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110116 AGAGCCACCTCTTAAATTTATTGTGAAGAAGAATCCACATCATTCACAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGGGTGATATGAAACTCTACTTAAAGTTACAG         ATTGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 110166 GGGGTGATATGAAACTCTACTTAAAGTTACAGGTC...TAGATTGTGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGGTCTCTTGAAGTTTGGGGTAGTCAAGAAGCATTAGAAGAAGCAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112262 AGGTCTCTTGAAGTTTGGGGTAGTCAAGAAGCATTAGAAGAAGCAAAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGTCCGACAGGAAAACCGAGAAAAAATGAAACAGAAGAAATTTGATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112312 AGTCCGACAGGAAAACCGAGAAAAAATGAAACAGAAGAAATTTGATAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGTAAAAG         AATTGCGGCGAGCAGTAAGAAGCAGCGTGTGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 112362 AAGTAAAAGGTA...CAGAATTGCGGCGAGCAGTAAGAAGCAGCGTGTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAAAGGGAGACGATTGTTCATCAACATGAGTATGGACCAGAAGAAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121738 AAAAGGGAGACGATTGTTCATCAACATGAGTATGGACCAGAAGAAAACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGAAGATGACATGTACCGTAAGACTTGTACTATGTGTGGCCATGAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121788 AGAAGATGACATGTACCGTAAGACTTGTACTATGTGTGGCCATGAACTGA

    850     .    :
    806 CATATGAAAAAATG
        ||||||||||||||
 121838 CATATGAAAAAATG