seq1 = pF1KE1315.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE1315/gi568815587r_73875010.tfa (gi568815587r:73875010_74078378), 203369 bp

>pF1KE1315 927
>gi568815587r:73875010_74078378 (Chr11)

(complement)

1-126  (100001-100126)   100% ->
127-337  (100283-100493)   100% ->
338-532  (101362-101556)   100% ->
533-634  (101637-101738)   100% ->
635-815  (102708-102888)   100% ->
816-927  (103258-103369)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTGGGTTCAAGGCCACAGATGTGCCCCCTACTGCCACTGTGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTGGGTTCAAGGCCACAGATGTGCCCCCTACTGCCACTGTGAAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTTGGGGCTGGCACAGCTGCCTGCATCGCAGATCTCATCACCTTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTTGGGGCTGGCACAGCTGCCTGCATCGCAGATCTCATCACCTTTCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGATACTGCTAAAGTCCGGTTACAG         ATCCAAGGAGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100101 TGGATACTGCTAAAGTCCGGTTACAGGTG...CAGATCCAAGGAGAAAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGGGGCCAGTGCGCGCTACAGCCAGCGCCCAGTACCGCGGTGTGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100298 CAGGGGCCAGTGCGCGCTACAGCCAGCGCCCAGTACCGCGGTGTGATGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACCATTCTGACCATGGTGCGTACTGAGGGCCCCCGAAGCCTCTACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100348 CACCATTCTGACCATGGTGCGTACTGAGGGCCCCCGAAGCCTCTACAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGCTGGTTGCCGGCCTGCAGCGCCAAATGAGCTTTGCCTCTGTCCGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100398 GGCTGGTTGCCGGCCTGCAGCGCCAAATGAGCTTTGCCTCTGTCCGCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCCTGTATGATTCTGTCAAACAGTTCTACACCAAGGGCTCTGAGC    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100448 GGCCTGTATGATTCTGTCAAACAGTTCTACACCAAGGGCTCTGAGCGTG.

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    338      ATGCCAGCATTGGGAGCCGCCTCCTAGCAGGCAGCACCACAGGTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100498 ..CAGATGCCAGCATTGGGAGCCGCCTCCTAGCAGGCAGCACCACAGGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCTGGCTGTGGCTGTGGCCCAGCCCACGGATGTGGTAAAGGTCCGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101407 CCCTGGCTGTGGCTGTGGCCCAGCCCACGGATGTGGTAAAGGTCCGATTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAAGCTCAGGCCCGGGCTGGAGGTGGTCGGAGATACCAAAGCACCGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101457 CAAGCTCAGGCCCGGGCTGGAGGTGGTCGGAGATACCAAAGCACCGTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGCCTACAAGACCATTGCCCGAGAGGAAGGGTTCCGGGGCCTCTGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101507 TGCCTACAAGACCATTGCCCGAGAGGAAGGGTTCCGGGGCCTCTGGAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533          GGACCTCTCCCAATGTTGCTCGTAATGCCATTGTCAACTGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101557 GTG...CAGGGACCTCTCCCAATGTTGCTCGTAATGCCATTGTCAACTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCTGAGCTGGTGACCTATGACCTCATCAAGGATGCCCTCCTGAAAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101678 GCTGAGCTGGTGACCTATGACCTCATCAAGGATGCCCTCCTGAAAGCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCTCATGACAG         ATGACCTCCCTTGCCACTTCACTTCTGCCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101728 CCTCATGACAGGTG...CAGATGACCTCCCTTGCCACTTCACTTCTGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTGGGGCAGGCTTCTGCACCACTGTCATCGCCTCCCCTGTAGACGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102738 TTGGGGCAGGCTTCTGCACCACTGTCATCGCCTCCCCTGTAGACGTGGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAGACGAGATACATGAACTCTGCCCTGGGCCAGTACAGTAGCGCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102788 AAGACGAGATACATGAACTCTGCCCTGGGCCAGTACAGTAGCGCTGGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTGTGCCCTTACCATGCTCCAGAAGGAGGGGCCCCGAGCCTTCTACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102838 CTGTGCCCTTACCATGCTCCAGAAGGAGGGGCCCCGAGCCTTCTACAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 G         GTTCATGCCCTCCTTTCTCCGCTTGGGTTCCTGGAACGTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102888 GGTG...TAGGTTCATGCCCTCCTTTCTCCGCTTGGGTTCCTGGAACGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTGATGTTCGTCACCTATGAGCAGCTGAAACGAGCCCTCATGGCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103298 GTGATGTTCGTCACCTATGAGCAGCTGAAACGAGCCCTCATGGCTGCCTG

    950     .    :    .    :
    906 CACTTCCCGAGAGGCTCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||
 103348 CACTTCCCGAGAGGCTCCCTTC