seq1 = pF1KE1304.tfa, 867 bp
seq2 = pF1KE1304/gi568815588r_70104873.tfa (gi568815588r:70104873_70333327), 228455 bp

>pF1KE1304 867
>gi568815588r:70104873_70333327 (Chr10)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-123  (102929-102987)   100% ->
124-177  (114511-114564)   100% ->
178-297  (115397-115516)   100% ->
298-384  (118742-118828)   100% ->
385-511  (119739-119865)   100% ->
512-639  (123643-123770)   100% ->
640-725  (124038-124123)   100% ->
726-795  (126995-127064)   100% ->
796-838  (128413-128455)   100% ->
839-867  (130142-130170)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGGCTTCAGCACCGAGGAGCGCGCCGCGCCCTTCTCCCTGGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGGCTTCAGCACCGAGGAGCGCGCCGCGCCCTTCTCCCTGGAGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGAGTCTTCCTCA         AAAATGAGAAAGGACAATATATATCTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGAGTCTTCCTCAGTG...CAGAAAATGAGAAAGGACAATATATATCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CATTTCATGATATTCCAATTTATGCAGATAAG         GATGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102956 CATTTCATGATATTCCAATTTATGCAGATAAGGTA...CAGGATGTGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CACATGGTAGTTGAAGTACCACGCTGGTCTAATGCAAAAATGGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 114520 CACATGGTAGTTGAAGTACCACGCTGGTCTAATGCAAAAATGGAGGTA..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    178     ATTGCTACAAAGGACCCTTTAAACCCTATTAAACAAGATGTGAAAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114570 .CAGATTGCTACAAAGGACCCTTTAAACCCTATTAAACAAGATGTGAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AAGGAAAACTTCGCTATGTTGCGAATTTGTTCCCGTATAAAGGATATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115443 AAGGAAAACTTCGCTATGTTGCGAATTTGTTCCCGTATAAAGGATATATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TGGAACTATGGTGCCATCCCTCAG         ACTTGGGAAGACCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 115493 TGGAACTATGGTGCCATCCCTCAGGTA...TAGACTTGGGAAGACCCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GCACAATGATAAACATACTGGCTGTTGTGGTGACAATGACCCAATTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118759 GCACAATGATAAACATACTGGCTGTTGTGGTGACAATGACCCAATTGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGTGTGAAATTGGAAGCAAG         GTATGTGCAAGAGGTGAAATA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 118809 TGTGTGAAATTGGAAGCAAGGTA...CAGGTATGTGCAAGAGGTGAAATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 ATTGGCGTGAAAGTTCTAGGCATATTGGCTATGATTGACGAAGGGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119760 ATTGGCGTGAAAGTTCTAGGCATATTGGCTATGATTGACGAAGGGGAAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CGACTGGAAAGTCATTGCCATTAATGTGGATGATCCTGATGCAGCCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119810 CGACTGGAAAGTCATTGCCATTAATGTGGATGATCCTGATGCAGCCAATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ATAATG         ATATCAATGATGTCAAACGGCTGAAACCTGGCTAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119860 ATAATGGTA...TAGATATCAATGATGTCAAACGGCTGAAACCTGGCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TTAGAAGCTACTGTGGACTGGTTTAGAAGGTATAAGGTTCCTGATGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123678 TTAGAAGCTACTGTGGACTGGTTTAGAAGGTATAAGGTTCCTGATGGAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ACCAGAAAATGAGTTTGCGTTTAATGCAGAATTTAAAGATAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 123728 ACCAGAAAATGAGTTTGCGTTTAATGCAGAATTTAAAGATAAGGTA...T

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    640   GACTTTGCCATTGATATTATTAAAAGCACTCATGACCATTGGAAAGCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124036 AGGACTTTGCCATTGATATTATTAAAAGCACTCATGACCATTGGAAAGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TTAGTGACTAAGAAAACGAATGGAAAAGGAATCAGTTG         CAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 124086 TTAGTGACTAAGAAAACGAATGGAAAAGGAATCAGTTGGTA...TAGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 GAATACAACTTTGTCTGAGAGCCCCTTCAAGTGTGATCCTGATGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126998 GAATACAACTTTGTCTGAGAGCCCCTTCAAGTGTGATCCTGATGCTGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GAGCCATTGTGGATGCT         TTACCACCACCCTGTGAATCTGCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 127048 GAGCCATTGTGGATGCTGTA...TAGTTACCACCACCCTGTGAATCTGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 TGCACAGTACCAACAGACG         TGGATAAGTGGTTCCATCACCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 128437 TGCACAGTACCAACAGACGGTA...CAGTGGATAAGTGGTTCCATCACCA

    950     .
    861 GAAAAAC
        |||||||
 130164 GAAAAAC