seq1 = pF1KE1298.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KE1298/gi568815592r_26096843.tfa (gi568815592r:26096843_26297250), 200408 bp

>pF1KE1298 408
>gi568815592r:26096843_26297250 (Chr6)

(complement)

1-408  (100001-100408)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCGTACTAAGCAGACTGCTCGCAAGTCCACGGGTGGGAAAGCGCC
        ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCGTACCAAGCAGACTGCTCGCAAGTCCACGGGTGGGAAAGCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACGCAAGCAGCTGGCCACCAAGGCTGCTCGAAAGAGCGCTCCAGCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACGCAAGCAGCTGGCCACCAAGGCTGCTCGAAAGAGCGCTCCAGCCACCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGCGTGAAGAAGCCCCACCGTTACCGGCCCGGCACGGTGGCTCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGCGTGAAGAAGCCCCACCGTTACCGGCCCGGCACGGTGGCTCTGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGATCCGCCGCTACCAGAAGTCGACCGAGCTGCTGATTCGCAAACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGATCCGCCGCTACCAGAAGTCGACCGAGCTGCTGATTCGCAAACTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATTCCAGCGTCTAGTCCGTGAGATCGCGCAGGACTTCAAGACTGATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATTCCAGCGTCTAGTCCGTGAGATCGCGCAGGACTTCAAGACTGATCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTTTTCAGAGCTCGGCGGTGATGGCGCTGCAGGAGGCCTGCGAGGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTTTTCAGAGCTCGGCGGTGATGGCGCTGCAGGAGGCCTGCGAGGCCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGTGGGGCTGTTTGAGGACACCAACCTATGCGCCATTCACGCCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGTGGGGCTGTTTGAGGACACCAACCTATGCGCCATTCACGCCAAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGTGACTATCATGCCCAAGGACATCCAGCTTGCTCGCCGCATTCGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGTGACTATCATGCCCAAGGACATCCAGCTTGCTCGCCGCATTCGTGGGG

    400     .
    401 AGAGGGCG
        ||||||||
 100401 AGAGGGCG