Result of SIM4 for
pF1KE1289
seq1 = pF1KE1289.tfa, 2787 bp
seq2 = pF1KE1289/gi568815588f_7718710.tfa (gi568815588f:7718710_8114748), 396039 bp
>pF1KE1289 2787
>gi568815588f:7718710_8114748 (Chr10)
1-166 (100001-100166) 100% ->
167-409 (105609-105851) 100% ->
410-2232 (245211-247033) 99% ->
2233-2315 (258532-258614) 100% ->
2316-2568 (290369-290621) 100% ->
2569-2675 (295022-295128) 100% ->
2676-2787 (295928-296039) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTGCGAGAGTTACTCCAGGTCGTTGTTGAGGGTCTCGGTGGCGCAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTGCGAGAGTTACTCCAGGTCGTTGTTGAGGGTCTCGGTGGCGCAGAT
50 . : . : . : . : . :
51 CTGCCAGGCGCTGGGCTGGGACTCGGTGCAGCTCAGCGCCTGCCACCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CTGCCAGGCGCTGGGCTGGGACTCGGTGCAGCTCAGCGCCTGCCACCTCC
100 . : . : . : . : . :
101 TCACGGACGTGCTGCAGCGCTATCTGCAGCAGCTGGGCCGGGGCTGCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TCACGGACGTGCTGCAGCGCTATCTGCAGCAGCTGGGCCGGGGCTGCCAT
150 . : . : . : . : . :
151 CGGTACTCTGAGCTCT ATGGCCGAACAGACCCAATTTTGGA
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
100151 CGGTACTCTGAGCTCTGTG...CAGATGGCCGAACAGACCCAATTTTGGA
200 . : . : . : . : . :
192 TGATGTTGGTGAAGCTTTCCAGCTGATGGGGGTTAGTCTACATGAACTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105634 TGATGTTGGTGAAGCTTTCCAGCTGATGGGGGTTAGTCTACATGAACTAG
250 . : . : . : . : . :
242 AAGACTATATTCACAACATTGAGCCTGTCACCTTCCCACACCAAATTCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105684 AAGACTATATTCACAACATTGAGCCTGTCACCTTCCCACACCAAATTCCG
300 . : . : . : . : . :
292 TCATTTCCTGTTAGCAAGAACAATGTACTTCAGTTTCCTCAACCTGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105734 TCATTTCCTGTTAGCAAGAACAATGTACTTCAGTTTCCTCAACCTGGAAG
350 . : . : . : . : . :
342 TAAAGATGCAGAGGAAAGAAAAGAATACATTCCTGATTACCTGCCACCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105784 TAAAGATGCAGAGGAAAGAAAAGAATACATTCCTGATTACCTGCCACCCA
400 . : . : . : . : . :
392 TTGTGTCTTCTCAAGAAG AAGAAGAAGAAGAGCAGGTGCCC
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
105834 TTGTGTCTTCTCAAGAAGGTT...CAGAAGAAGAAGAAGAGCAGGTGCCC
450 . : . : . : . : . :
433 ACTGATGGAGGCACATCAGCAGAAGCCATGCAGGTTCCCTTGGAAGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245234 ACTGATGGAGGCACATCAGCAGAAGCCATGCAGGTTCCCTTGGAAGAAGA
500 . : . : . : . : . :
483 TGATGAATTGGAGGAGGAAGAAATTATTAATGATGAGAATTTCCTGGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245284 TGATGAATTGGAGGAGGAAGAAATTATTAATGATGAGAATTTCCTGGGCA
550 . : . : . : . : . :
533 AGAGACCACTGGATAGTCCTGAAGCTGAAGAACTGCCAGCCATGAAGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245334 AGAGACCACTGGATAGTCCTGAAGCTGAAGAACTGCCAGCCATGAAGCGG
600 . : . : . : . : . :
583 CCTCGGCTATTAAGCACTAAAGGGGACACGCTAGATGTTGTGTTATTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245384 CCTCGGCTATTAAGCACTAAAGGGGACACGCTAGATGTTGTGTTATTGGA
650 . : . : . : . : . :
633 AGCTCGAGAGCCACTCAGCTCAATAAATACTCAAAAGATCCCACCAATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245434 AGCTCGAGAGCCACTCAGCTCAATAAATACTCAAAAGATCCCACCAATGC
700 . : . : . : . : . :
683 TTTCTCCAGTCCATGTACAGGACAGTACAGACTTGGCACCTCCCTCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245484 TTTCTCCAGTCCATGTACAGGACAGTACAGACTTGGCACCTCCCTCACCC
750 . : . : . : . : . :
733 GAGCCGCCAATGTTGGCTCCAGTTGCAAAATCACAAATGCCAACTGCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245534 GAGCCGCCAATGTTGGCTCCAGTTGCAAAATCACAAATGCCAACTGCAAA
800 . : . : . : . : . :
783 ACCATTAGAAACAAAGTCATTTACACCTAAAACAAAGACTAAAACTAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245584 ACCATTAGAAACAAAGTCATTTACACCTAAAACAAAGACTAAAACTAGCT
850 . : . : . : . : . :
833 CTCCAGGACAGAAGACTAAATCACCTAAAACCGCCCAGTCACCAGCAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245634 CTCCAGGACAGAAGACTAAATCACCTAAAACCGCCCAGTCACCAGCAATG
900 . : . : . : . : . :
883 GTCGGAAGTCCTATTCGATCACCAAAAACTGTATCCAAAGAAAAGAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245684 GTCGGAAGTCCTATTCGATCACCAAAAACTGTATCCAAAGAAAAGAAATC
950 . : . : . : . : . :
933 ACCTGGACGTTCCAAGAGCCCCAAGAGTCCCAAGAGCCCCAAGGTCACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245734 ACCTGGACGTTCCAAGAGCCCCAAGAGTCCCAAGAGCCCCAAGGTCACGA
1000 . : . : . : . : . :
983 CTCACATTCCCCAAACACCTGTGAGACCTGAAACGCCCAACAGGACTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245784 CTCACATTCCCCAAACACCTGTGAGACCTGAAACGCCCAACAGGACTCCT
1050 . : . : . : . : . :
1033 TCAGCTACACTCAGTGAAAAAATCAGTAAAGAGACTATCCAGGTAAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245834 TCAGCTACACTCAGTGAAAAAATCAGTAAAGAGACTATCCAGGTAAAACA
1100 . : . : . : . : . :
1083 AATACAGACACCCCCTGATGCTGGGAAACTGAACAGTGAGAATCAGCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245884 AATACAGACACCCCCTGATGCTGGGAAACTGAACAGTGAGAATCAGCCGA
1150 . : . : . : . : . :
1133 AAAAGGCTGTGGTAGCAGATAAAACGATTGAGGCCTCTATCGATGCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245934 AAAAGGCTGTGGTAGCAGATAAAACGATTGAGGCCTCTATCGATGCTGTG
1200 . : . : . : . : . :
1183 ATTGCACGAGCCTGTGCTGAGCGAGAGCCAGATCCTTTCGAATTTTCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245984 ATTGCACGAGCCTGTGCTGAGCGAGAGCCAGATCCTTTCGAATTTTCTTC
1250 . : . : . : . : . :
1233 TGGATCGGAATCTGAAGGAGACATTTTTACTAGCCCTAAGAGAATTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246034 TGGATCGGAATCTGAAGGAGACATTTTTACTAGCCCTAAGAGAATTTCAG
1300 . : . : . : . : . :
1283 GCCCGGAGTGTACTACTCCCAAAGCTTCCACTTCCGCGAACAGTTTCACA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
246084 GCCCGGAGTGTACTACTCCCAAAGCTTCCACTTCCGCGAACAATTTCACA
1350 . : . : . : . : . :
1333 AAGTCAGGATCCACTCCTCTGCCTCTTTCCGGTGGAACCTCAAGTTCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246134 AAGTCAGGATCCACTCCTCTGCCTCTTTCCGGTGGAACCTCAAGTTCCGA
1400 . : . : . : . : . :
1383 TAACTCATGGACAATGGATGCCTCCATTGATGAGGTTGTACGTAAAGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246184 TAACTCATGGACAATGGATGCCTCCATTGATGAGGTTGTACGTAAAGCAA
1450 . : . : . : . : . :
1433 AACTGGGAACACCTTCAAATATGCCCCCCAACTTTCCTTATATCTCTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246234 AACTGGGAACACCTTCAAATATGCCCCCCAACTTTCCTTATATCTCTTCT
1500 . : . : . : . : . :
1483 CCGTCAGTGTCTCCTCCCACTCCCGAACCTCTCCACAAGGTGTATGAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246284 CCGTCAGTGTCTCCTCCCACTCCCGAACCTCTCCACAAGGTGTATGAGGA
1550 . : . : . : . : . :
1533 GAAAACCAAGCTGCCTTCCTCCGTGGAGGTAAAGAAGAAGTTGAAAAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246334 GAAAACCAAGCTGCCTTCCTCCGTGGAGGTAAAGAAGAAGTTGAAAAAGG
1600 . : . : . : . : . :
1583 AACTAAAGACTAAAATGAAAAAGAAAGAAAAGCAGAGAGATAGGGAGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246384 AACTAAAGACTAAAATGAAAAAGAAAGAAAAGCAGAGAGATAGGGAGAGG
1650 . : . : . : . : . :
1633 GAAAAAGACAAGAACAAGGACAAAAGTAAGGAGAAGGATAAAGTGAAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246434 GAAAAAGACAAGAACAAGGACAAAAGTAAGGAGAAGGATAAAGTGAAAGA
1700 . : . : . : . : . :
1683 GAAAGAGAAAGACAAGGAAACTGGCAGGGAAACAAAGTATCCCTGGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246484 GAAAGAGAAAGACAAGGAAACTGGCAGGGAAACAAAGTATCCCTGGAAGG
1750 . : . : . : . : . :
1733 AATTTCTTAAAGAGGAAGAGGCAGATCCCTACAAGTTTAAAATCAAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246534 AATTTCTTAAAGAGGAAGAGGCAGATCCCTACAAGTTTAAAATCAAAGAA
1800 . : . : . : . : . :
1783 TTTGAAGATGTTGATCCCAAAGTGAAATTGAAAGATGGACTTGTGAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246584 TTTGAAGATGTTGATCCCAAAGTGAAATTGAAAGATGGACTTGTGAGGAA
1850 . : . : . : . : . :
1833 GGAGAAAGAGAAGCATAAAGATAAGAAGAAAGATAGAGAGAAAGGCAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246634 GGAGAAAGAGAAGCATAAAGATAAGAAGAAAGATAGAGAGAAAGGCAAGA
1900 . : . : . : . : . :
1883 AAGATAAAGATAAGAGAGAGAAAGAAAAAGTGAAAGATAAAGGCAGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246684 AAGATAAAGATAAGAGAGAGAAAGAAAAAGTGAAAGATAAAGGCAGAGAA
1950 . : . : . : . : . :
1933 GATAAGATGAAAGCCCCAGCACCCCCACTGGTGTTGCCCCCAAAAGAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246734 GATAAGATGAAAGCCCCAGCACCCCCACTGGTGTTGCCCCCAAAAGAGTT
2000 . : . : . : . : . :
1983 GGCCCTGCCCTTGTTCAGCCCTGCCACAGCCTCCAGGGTCCCAGCCATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246784 GGCCCTGCCCTTGTTCAGCCCTGCCACAGCCTCCAGGGTCCCAGCCATGC
2050 . : . : . : . : . :
2033 TGCCATCTTTGTTGCCAGTGCTTCCGGAAAAACTGTTTGAGGAGAAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246834 TGCCATCTTTGTTGCCAGTGCTTCCGGAAAAACTGTTTGAGGAGAAAGAG
2100 . : . : . : . : . :
2083 AAGCCGAAGGAGAAAGAAAAGAAAAAGGACAAAAAGGAGAAGAAGAAAAA
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246884 AAGGTGAAGGAGAAAGAAAAGAAAAAGGACAAAAAGGAGAAGAAGAAAAA
2150 . : . : . : . : . :
2133 GAAGGAAAAAGAGAAGGAGAAGAAGGAGAAGGAAAGAGAGAAAGAGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246934 GAAGGAAAAAGAGAAGGAGAAGAAGGAGAAGGAAAGAGAGAAAGAGAAGA
2200 . : . : . : . : . :
2183 GAGAGCGAGAGAAGAGAGAAAAAGAGAAGGAGAAACACAAGCATGAAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246984 GAGAGCGAGAGAAGAGAGAAAAAGAGAAGGAGAAACACAAGCATGAAAAA
2250 . : . : . : . : . :
2233 ATAAAAGTGGAACCAGTCGCTCTGGCCCCGAGTCCAGTTAT
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
247034 GTA...CAGATAAAAGTGGAACCAGTCGCTCTGGCCCCGAGTCCAGTTAT
2300 . : . : . : . : . :
2274 CCCCAGATTAACTCTCCGAGTCGGTGCTGGCCAAGACAAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
258573 CCCCAGATTAACTCTCCGAGTCGGTGCTGGCCAAGACAAGATGTA...CA
2350 . : . : . : . : . :
2316 TGTCATCAGCAAGGTGGTCCCTGCCCCCGAGGCCAAGCCGGCGCCCTCG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290368 GTGTCATCAGCAAGGTGGTCCCTGCCCCCGAGGCCAAGCCGGCGCCCTCG
2400 . : . : . : . : . :
2365 CAGAACAGGCCGAAGACCCCACCGCCGGCCCCCGCGCCCGCCCCCGGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290418 CAGAACAGGCCGAAGACCCCACCGCCGGCCCCCGCGCCCGCCCCCGGCCC
2450 . : . : . : . : . :
2415 CATGCTCGTCAGCCCTGCGCCCGTGCCGCTGCCGCTGCTCGCCCAGGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290468 CATGCTCGTCAGCCCTGCGCCCGTGCCGCTGCCGCTGCTCGCCCAGGCCG
2500 . : . : . : . : . :
2465 CCGCGGGCCCTGCCCTGCTGCCCTCCCCGGGTCCCGCCGCCTCCGGGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290518 CCGCGGGCCCTGCCCTGCTGCCCTCCCCGGGTCCCGCCGCCTCCGGGGCC
2550 . : . : . : . : . :
2515 AGTGCCAAAGCCCCCGTGCGCAGCGTGGTGACTGAGACGGTCAGCACCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290568 AGTGCCAAAGCCCCCGTGCGCAGCGTGGTGACTGAGACGGTCAGCACCTA
2600 . : . : . : . : . :
2565 CGTG ATCCGAGATGAGTGGGGCAATCAGATCTGGATCTGCC
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290618 CGTGGTG...CAGATCCGAGATGAGTGGGGCAATCAGATCTGGATCTGCC
2650 . : . : . : . : . :
2606 CTGGGTGTAACAAGCCTGACGATGGGAGTCCCATGATTGGGTGTGACGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
295059 CTGGGTGTAACAAGCCTGACGATGGGAGTCCCATGATTGGGTGTGACGAC
2700 . : . : . : . : . :
2656 TGCGATGACTGGTACCACTG GCCCTGTGTTGGAATCATGAC
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
295109 TGCGATGACTGGTACCACTGGTG...CAGGCCCTGTGTTGGAATCATGAC
2750 . : . : . : . : . :
2697 TGCACCCCCAGAAGAGATGCAGTGGTTCTGCCCCAAGTGTGCGAACAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
295949 TGCACCCCCAGAAGAGATGCAGTGGTTCTGCCCCAAGTGTGCGAACAAGA
2800 . : . : . : . :
2747 AGAAGGACAAAAAGCACAAGAAGAGGAAGCATCGAGCCCAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
295999 AGAAGGACAAAAAGCACAAGAAGAGGAAGCATCGAGCCCAC