seq1 = pF1KE1274.tfa, 2133 bp
seq2 = pF1KE1274/gi568815590f_19717538.tfa (gi568815590f:19717538_19951802), 234265 bp

>pF1KE1274 2133
>gi568815590f:19717538_19951802 (Chr8)

1-129  (100001-100129)   100% ->
130-197  (100738-100805)   100% ->
198-301  (102036-102139)   100% ->
302-441  (102842-102981)   100% ->
442-523  (104902-104983)   100% ->
524-664  (105764-105904)   100% ->
665-836  (106336-106507)   100% ->
837-1006  (107266-107435)   100% ->
1007-1140  (108889-109022)   100% ->
1141-1297  (112866-113022)   100% ->
1298-1380  (114491-114573)   98% ->
1381-1533  (115632-115784)   100% ->
1534-1642  (119515-119623)   100% ->
1643-1722  (125311-125390)   100% ->
1723-1885  (126539-126701)   100% ->
1886-1979  (128167-128260)   100% ->
1980-2133  (134112-134265)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGCCCAGGGGGACTGCGAGTTCCTGGTGCAGCGAGCCCGGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGCCCAGGGGGACTGCGAGTTCCTGGTGCAGCGAGCCCGGGAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGCCGCAAGACCTGTGGGCAGCCAAGGCGTGGCTGATCACGGCCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGCCGCAAGACCTGTGGGCAGCCAAGGCGTGGCTGATCACGGCCCGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTCTACCCGGCAGACTTTAACATCCAG         TATGAGATGTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100101 GCCTCTACCCGGCAGACTTTAACATCCAGGTG...CAGTATGAGATGTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCATCGAGCGGAATGCAGAGCGGACCGCCACCGCCGGGAGGCTGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100750 ACCATCGAGCGGAATGCAGAGCGGACCGCCACCGCCGGGAGGCTGCTGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGACAT         GTTTGTGAATTTCCCAGACCAGCCGGTGGTGTGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100800 CGACATGTG...TAGGTTTGTGAATTTCCCAGACCAGCCGGTGGTGTGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAGAAATCAGCATTATTACATCAGCATTAAGGAACGATTCACAGGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102071 GAGAAATCAGCATTATTACATCAGCATTAAGGAACGATTCACAGGACAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAAACCCAATTTTTAAGAA         GTTTATTTGAAACTCTTCCTGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102121 CAAACCCAATTTTTAAGAAGTA...CAGGTTTATTTGAAACTCTTCCTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCGGGTCCAGTGTGAAATGTTACTAAAGGTCACGGAACAATGCTTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102864 TCGGGTCCAGTGTGAAATGTTACTAAAGGTCACGGAACAATGCTTCAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGTTAGAACGATCAGAAATGTTGCTTCTACTTTTGAGGCGCTTCCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102914 CGTTAGAACGATCAGAAATGTTGCTTCTACTTTTGAGGCGCTTCCCTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACGGTGGTGCAGCATGGG         GTTGGCCTTGGGGAGGCACTATT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102964 ACGGTGGTGCAGCATGGGGTG...TAGGTTGGCCTTGGGGAGGCACTATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGAGGCTGAAACTATTGAAGAACAAGAATCTCCAGTGAACTGCTTTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104925 AGAGGCTGAAACTATTGAAGAACAAGAATCTCCAGTGAACTGCTTTAGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AATTATTTG         TTTGTGATGTCCTTCCTCTAATAATTAACAAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 104975 AATTATTTGGTA...CAGTTTGTGATGTCCTTCCTCTAATAATTAACAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CATGATGTTCGATTACCTGCCAATTTATTGTATAAGTACTTGAACAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105796 CATGATGTTCGATTACCTGCCAATTTATTGTATAAGTACTTGAACAAAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGCTGAATTTTATATCAATTATGTCACTAGGTCTACTCAAATAGAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105846 AGCTGAATTTTATATCAATTATGTCACTAGGTCTACTCAAATAGAAAATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCATCAAG         GCGCCCAGGATACATCTGATTTAATGTCACCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105896 AGCATCAAGGTA...CAGGCGCCCAGGATACATCTGATTTAATGTCACCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AGCAAACGTAGCTCTCAGAAGTACATAATAGAAGGGCTGACGGAAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106368 AGCAAACGTAGCTCTCAGAAGTACATAATAGAAGGGCTGACGGAAAAATC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ATCCCAGATCGTGGACCCTTGGGAGAGGTTGTTTAAGATTTTGAATGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106418 ATCCCAGATCGTGGACCCTTGGGAGAGGTTGTTTAAGATTTTGAATGTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTGGAATGAGATGTGAATGGCAGATGGATAAAGGAAGACG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106468 TTGGAATGAGATGTGAATGGCAGATGGATAAAGGAAGACGGTA...TAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AGCTATGGAGATATTTTGCATAGAATGAAGGATCTCTGCAGATACATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107267 AGCTATGGAGATATTTTGCATAGAATGAAGGATCTCTGCAGATACATGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CAACTTTGATAGTGAAGCACATGCAAAATATAAAAACCAAGTGGTGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107317 CAACTTTGATAGTGAAGCACATGCAAAATATAAAAACCAAGTGGTGTATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCACCATGCTGGTCTTCTTTAAGAATGCATTCCAGTATGTCAACAGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107367 CCACCATGCTGGTCTTCTTTAAGAATGCATTCCAGTATGTCAACAGCATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CAGCCATCTCTCTTCCAAG         GTCCTAATGCCCCGAGCCAAGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 107417 CAGCCATCTCTCTTCCAAGGTT...TAGGTCCTAATGCCCCGAGCCAAGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TCCACTGGTTCTTCTTGAAGATGTATCGAATGTGTATGGTGATGTAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108911 TCCACTGGTTCTTCTTGAAGATGTATCGAATGTGTATGGTGATGTAGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TTGATCGTAATAAACACATCCATAAAAAGAGGAAACTAGCTGAAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108961 TTGATCGTAATAAACACATCCATAAAAAGAGGAAACTAGCTGAAGGAAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GAAAAAACCATG         CAGAGTTCAGACGATGAAGACTGTTCGGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 109011 GAAAAAACCATGGTA...AAGCAGAGTTCAGACGATGAAGACTGTTCGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GAAAGGAAGAAATCGTCACATTGTAGTCAATAAAGCCGAACTTGCTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112895 GAAAGGAAGAAATCGTCACATTGTAGTCAATAAAGCCGAACTTGCTAACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCACTGAAGTGTTAGAAAGCTTTAAATTGGCCAGGGAGAGCTGGGAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112945 CCACTGAAGTGTTAGAAAGCTTTAAATTGGCCAGGGAGAGCTGGGAGTTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CTCTATTCCCTAGAATTCCTTGACAAAG         AATTTACAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 112995 CTCTATTCCCTAGAATTCCTTGACAAAGGTA...CAGAATTTACAAGGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TTGCTTGGCCTGGAAGACGGATACTTGGCTTTGGTTAAGAATCTTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114504 TTGCTTGGCCTGGAAGACGGATACTTGGCTTTGGTTAAGAATCTTCCTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CTGATATGATAATCTATCAG         GGTCAATATAAAAAGGCGATA
        |||||||||| |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 114554 CTGATATGATCATCTATCAGGTA...TAGGGTCAATATAAAAAGGCGATA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GCCAGCCTGCATCACTTAGCAGCTCTCCAGGGATCCATTTCTCAGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115653 GCCAGCCTGCATCACTTAGCAGCTCTCCAGGGATCCATTTCTCAGCCACA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GATCACAGGGCAGGGGACCCTGGAGCATCAGAGGGCGCTCATCCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115703 GATCACAGGGCAGGGGACCCTGGAGCATCAGAGGGCGCTCATCCAGCTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CGACGTGCCACTTTGCGCTAGGGGAGTACAGA         ATGACATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 115753 CGACGTGCCACTTTGCGCTAGGGGAGTACAGAGTG...TAGATGACATGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GAAAAAGTCCTTGATTTGATGTGCTACATGGTACTCCCCATTCAAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119524 GAAAAAGTCCTTGATTTGATGTGCTACATGGTACTCCCCATTCAAGATGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AGGCAAATCCCAGGAGGAACCCTCGAAAGTAAAGCCCAAATTTAGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119574 AGGCAAATCCCAGGAGGAACCCTCGAAAGTAAAGCCCAAATTTAGAAAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643          GTTCGGATCTGAAGCTCCTGCCTTGTACCAGCAAGGCTATC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119624 GTA...TAGGTTCGGATCTGAAGCTCCTGCCTTGTACCAGCAAGGCTATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 ATGCCATACTGCCTCCATTTAATGTTAGCCTGTTTTAAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 125352 ATGCCATACTGCCTCCATTTAATGTTAGCCTGTTTTAAGGTA...CAGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 TAGAGCTTTCACAGACAACAGAGACGACATGGCATTGGGGCATGTGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126541 TAGAGCTTTCACAGACAACAGAGACGACATGGCATTGGGGCATGTGATTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TGTTGCTTCAGCAAGAGTGGCCACGGGGCGAGAATCTTTTCCTGAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126591 TGTTGCTTCAGCAAGAGTGGCCACGGGGCGAGAATCTTTTCCTGAAAGCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GTCAATAAAATTTGCCAACAAGGAAATTTCCAATATGAGAATTTTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126641 GTCAATAAAATTTGCCAACAAGGAAATTTCCAATATGAGAATTTTTTCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 TTACGTTACAA         ATATTGATATGCTGGAGGAATTTGCCTACT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 126691 TTACGTTACAAGTA...CAGATATTGATATGCTGGAGGAATTTGCCTACT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 TGAGAACTCAGGAAGGTGGGAAAATTCATCTGGAATTACTACCCAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128197 TGAGAACTCAGGAAGGTGGGAAAATTCATCTGGAATTACTACCCAATCAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GGAATGCTGATCAA         GCACCACACTGTAACTCGAGGCATCAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 128247 GGAATGCTGATCAAGTA...CAGGCACCACACTGTAACTCGAGGCATCAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CAAAGGCGTGAAGGAGGACTTTCGCCTGGCCATGGAGCGCCAGGTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134139 CAAAGGCGTGAAGGAGGACTTTCGCCTGGCCATGGAGCGCCAGGTCTCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 GCTGTGGAGAGAATCTGATGGTGGTTCTGCACAGGTTCTGCATTAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134189 GCTGTGGAGAGAATCTGATGGTGGTTCTGCACAGGTTCTGCATTAATGAG

   2250     .    :    .    :    .
   2107 AAGATCTTGCTCCTTCAGACTCTGACC
        |||||||||||||||||||||||||||
 134239 AAGATCTTGCTCCTTCAGACTCTGACC