seq1 = pF1KE1253.tfa, 1590 bp
seq2 = pF1KE1253/gi568815590r_7871664.tfa (gi568815590r:7871664_7976395), 104732 bp

>pF1KE1253 1590
>gi568815590r:7871664_7976395 (Chr8)

(complement)

1-1590  (3143-4732)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGACGACTCACTCTACTTGGGAGGTGAGTGGCAGTTCAACCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3143 ATGGAGGACGACTCACTCTACTTGGGAGGTGAGTGGCAGTTCAACCACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCAAAACTCACATCTTCTCGGCCAGATGCAGCTTTTGCTGAAATCCAGC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
   3193 TTCAAAACTCACATCTCCTCGGCCAGATGCAGCTTTTGCTGAAATCCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGACTTCTCTCCCTGAGAAGTCACCACTCTCATCTGAGGCCCGTGTCGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
   3243 GGACTTCTCTCCCTGAGAAGTCACCACTCTCATCTGAGACCCGTGTCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCTGTGATGATTTGGCTCCTGTGGCAAGACAGCTTGCTCCCAGGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3293 CTCTGTGATGATTTGGCTCCTGTGGCAAGACAGCTTGCTCCCAGGGAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTTCCTCTGAGTAGCAGGAGACCTGCTGCGGTGGGGGCTGGGCTCCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
   3343 GCTTCCTCTGAGTAGCAGGAGACCTGCTGCTGTGGGGGCTGGTCTCCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATATGGGAAATACCTGCTACGAGAACGCTTCCCTGCAGTGCCTGACATAC
        ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||
   3393 ATATGGGAAATACCTGCTACTTGAATGCTTCCCTGCAGTGCCTGACATAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACACCGCCCCTTGCCAACTACATGCTGTCCCGGGAGCACTCTCAAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3443 ACACCGCCCCTTGCCAACTACATGCTGTCCCGGGAGCACTCTCAAACATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCAGCGTCCCAAGTGCTGCATGCTCTGTACTATGCAAGCTCACATCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3493 TCAGCGTCCCAAGTGCTGCATGCTCTGTACTATGCAAGCTCACATCACAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGCCCTCCACAGTCCTGGTCATGTCATCCAGCCCTCACAGGCATTGGCT
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
   3543 GGGCCCTCCACAGTCCTGGCCATGTCATCCAGCCCTCACAGGCATTGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGGCTTCCATAGAGGCAAGCAGGAAGATGCCCATGAATTTCTCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3593 GCTGGCTTCCATAGAGGCAAGCAGGAAGATGCCCATGAATTTCTCATGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACTGTGGATGCCATGAAAAAGGCATGCCTTCCCGGCCACAAGCAGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3643 CACTGTGGATGCCATGAAAAAGGCATGCCTTCCCGGCCACAAGCAGGTAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATCATCACTCTAAGGACACCACCCTCATCCACCAAATATTTGGAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3693 ATCATCACTCTAAGGACACCACCCTCATCCACCAAATATTTGGAGGCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGGAGATCTCAAATCAAGTGTCTCCACTGCCACGGGATTCCAGACACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
   3743 TGGAGATCTCAAATCAAGTGTCTCCACTGCCACGGGATTTCAGACACTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGACCCTTACCTGGACATCGCCCTGGATATCCAGGCAGCTCAGAGTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3793 TGACCCTTACCTGGACATCGCCCTGGATATCCAGGCAGCTCAGAGTGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCAAGCTTTGGAACAGTTGGTGAAGCCCGAAGAACTCAATGGAGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3843 AGCAAGCTTTGGAACAGTTGGTGAAGCCCGAAGAACTCAATGGAGAGAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCTATCATTGTGGTCTTTGTCTCCAGAGGGCGCCGGCCTCCAAGACGTT
        ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
   3893 GCCTATCCTTGCGGTCTTTGTCTCCAGAGGGCGCCGGCCTCCAACACGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AACTTTACACACTTCTGCCAAGGTCCTCATCCTTGTCTTGAAGAGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3943 AACTTTACACACTTCTGCCAAGGTCCTCATCCTTGTCTTGAAGAGATTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCGATGTCACAGGCAACAAACTTGCCAAGAATGTGCAATATCCTGAGTGC
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3993 GCGATGTCACAGGCAACAAACTTGCCAAGAATGTGCAATATCCTGAGTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTTGACATGCAGCCATACATGTCTCAGCAGAACACAGGACCTCTTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4043 CTTGACATGCAGCCATACATGTCTCAGCAGAACACAGGACCTCTTGTCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGTCCTCTATGCTGTGCTGGTCCACGCTGGGTGGAGTTGTCACAACGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
   4093 TGTCCTCTATGCTGTGCTGGTCCACGCTGGGTGGAGTTGTCACAACGGAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATTACTTCTCTTATGTCAAAGCTCAAGAAGGCCAGTGGTATAAAATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4143 ATTACTTCTCTTATGTCAAAGCTCAAGAAGGCCAGTGGTATAAAATGGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GATGCCGAGGTCACCGCCTCTAGCATCACTTCTGTCCTGAGTCAACAGGC
        |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
   4193 GATGCCGAGGTCACTGCCTGTAGCATCACTTCTGTCCTGAGTCAACAGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTACGTCCTCTTTTACATCCAGAAGAGTGAATGGGAAAGACACAGTGAGA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4243 CTATGTCCTCTTTTACATCCAGAAGAGTGAATGGGAAAGACACAGTGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GTGTGTCAAGAGGCAGGGAACCAAGAGCCCTTGGCGCAGAAGACACAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
   4293 GTGTGTCAAGAGGCAGGGAACCAAGAGCCCTTGGCGCTGAAGACACAGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AGGCGAGCAACGCAAGGAGAGCTCAAGAGAGACCACCCCTGCCTCCAGGC
        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| 
   4343 AGGCCAGCAACGCAAGGAGAGCTCAAGAGAGACCACCCTTGCCTCCAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCCCGAGTTGGACGAGCACTTGGTGGAAAGAGCCACTCAGGAAAGCACCT
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
   4393 ACCCGAGTTGGACGAGCACTTGGTGGAAAGAGCCACTGAGGAAAGCACCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TAGACCACTGGAAATTCCTTCAAGAGCAAAACAAAACGAAGCCTGAGTTC
        ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||
   4443 TAGACCACTGGAAATTCCCCCAAGAGCAAAACAAAATGAAGCCTGAGTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AACGTCAGAAAAGTCGAAGGTACCCTGCCTCCCGACGTACTTGTGATTCA
        |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
   4493 AACGTCAGAAAAGTTGAAGGTACCCTGCCTCCCAACGTACTTGTGATTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TCAATCAAAATACAAGTGTGGGATGAAGAACCATCATCCTGAACAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
   4543 TCAATCAAAATACAAGTGTGGGATGAAAAACCACCATCCTGAACAGCAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GCTCCCTGCTAAACCTCTCTTCGACGACCCCGACACATCAGGAGTCCATG
        |||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||
   4593 GCTCCCTGCTAAACCTCTCTTCGATGAACTCGACAGATCAGGAGTCCATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AACACTGGCACACTCGCTTCCCTGCGAGGGAGGGCCAGGAGATCCAAAGG
        |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||
   4643 AACACTGGCACACTCGCTTCTCTGCAAGGGAGGACCAGGAGATCCAAAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GAAGAACAAACACAGCAAGAGGGCTCTGCTTGTGTGCCAG
        |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||
   4693 GAAGAACAAACACAGCAAGAGATCTCTGCTTGTGTGCCAG