seq1 = pF1KE1230.tfa, 1029 bp
seq2 = pF1KE1230/gi568815579f_48602957.tfa (gi568815579f:48602957_48803985), 201029 bp

>pF1KE1230 1029
>gi568815579f:48602957_48803985 (Chr19)

1-1029  (100001-101029)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGTCGTTCAGATGCCTTTCTCCTTTCCCATGGCCCACTTCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGTCGTTCAGATGCCTTTCTCCTTTCCCATGGCCCACTTCATCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTGTCTTTACGGTTTCCACTATATTTCACGTTCAGCAGCGGCTAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTTGTCTTTACGGTTTCCACTATATTTCACGTTCAGCAGCGGCTAGCGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGATTCAAGCCATGTGGGAGTTACCGGTGCAGATACCAGTGCTAGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGATTCAAGCCATGTGGGAGTTACCGGTGCAGATACCAGTGCTAGCCTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACATCAAAGGCACTGGGACCCAGCCAGCTCAGGGGGATGTGGACGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACATCAAAGGCACTGGGACCCAGCCAGCTCAGGGGGATGTGGACGATCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCAATAGGCCGCCTGGGGAACCAGATGGGCGAGTACGCCACACTGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCAATAGGCCGCCTGGGGAACCAGATGGGCGAGTACGCCACACTGTACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCTGGCCAAGATGAACGGGCGGCCCGCCTTCATCCCGGCCCAGATGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCTGGCCAAGATGAACGGGCGGCCCGCCTTCATCCCGGCCCAGATGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCACCCTGGCCCCCATCTTCAGAATCACCCTGCCGGTGCTGCACAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCACCCTGGCCCCCATCTTCAGAATCACCCTGCCGGTGCTGCACAGCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACGGCCAGCAGGATCCCCTGGCAGAACTACCACCTGAACGACTGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACGGCCAGCAGGATCCCCTGGCAGAACTACCACCTGAACGACTGGATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGAGGAATACCGCCACATCCCGGGGGAGTACGTCCGCTTCACCGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGAGGAATACCGCCACATCCCGGGGGAGTACGTCCGCTTCACCGGCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCTGCTCCTGGACCTTCTACCACCACCTCCGCCAGGAGATCCTCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCTGCTCCTGGACCTTCTACCACCACCTCCGCCAGGAGATCCTCCAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTTCACCCTGCACGACCACGTGCGGGAGGAGGCCCAGAAGTTCCTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTTCACCCTGCACGACCACGTGCGGGAGGAGGCCCAGAAGTTCCTGCGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCTGCAGGTGAACGGGAGCCGGCCGGGCACCTTTGTAGGGGTCCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCTGCAGGTGAACGGGAGCCGGCCGGGCACCTTTGTAGGGGTCCATGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGCCGAGGGGACTATGTCCATGTCATGCCAAAAGTGTGGAAGGGGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGCCGAGGGGACTATGTCCATGTCATGCCAAAAGTGTGGAAGGGGGTGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCCGACCGGCGATACCTACAGCAGGCCCTGGACTGGTTCCGAGCTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCCGACCGGCGATACCTACAGCAGGCCCTGGACTGGTTCCGAGCTCGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACAGCTCCCTCATCTTCGTGGTCACCAGTAATGGCATGGCCTGGTGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACAGCTCCCTCATCTTCGTGGTCACCAGTAATGGCATGGCCTGGTGTCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGAACATTGACACCTCCCACGGTGATGTGGTGTTTGCTGGCGATGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGAACATTGACACCTCCCACGGTGATGTGGTGTTTGCTGGCGATGGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGAGGGCTCACCTGCCAAAGATTTTGCTCTACTCACACAGTGTAACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGAGGGCTCACCTGCCAAAGATTTTGCTCTACTCACACAGTGTAACCACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCATCATGACCATTGGGACGTTCGGGATCTGGGCCGCATACCTCACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCATCATGACCATTGGGACGTTCGGGATCTGGGCCGCATACCTCACGGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GGAGACACCATCTACCTGGCCAATTACACCCTCCCCGACTCCCCTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGAGACACCATCTACCTGGCCAATTACACCCTCCCCGACTCCCCTTTCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAAAATCTTTAAGCCAGAGGCAGCCTTCCTGCCGGAGTGGACAGGGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAAAATCTTTAAGCCAGAGGCAGCCTTCCTGCCGGAGTGGACAGGGATTG

   1000     .    :    .    :    .
   1001 CCGCAGACCTGTCCCCCTTACTCAAGCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCGCAGACCTGTCCCCCTTACTCAAGCAC