seq1 = pF1KE1225.tfa, 861 bp
seq2 = pF1KE1225/gi568815579f_55763173.tfa (gi568815579f:55763173_55873176), 110004 bp

>pF1KE1225 861
>gi568815579f:55763173_55873176 (Chr19)

1-286  (8633-8918)   100% ->
287-861  (9430-10004)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAGCACTTCAAACAGATCATTAGATGTCCTGTCTGTCTAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8633 ATGGCTGAGCACTTCAAACAGATCATTAGATGTCCTGTCTGTCTAAAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTTGAAGAAGCCGTGCAACTGAAATGTGGATATGCCTGCTGCCTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8683 TCTTGAAGAAGCCGTGCAACTGAAATGTGGATATGCCTGCTGCCTCCAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTCAATTCACTCCAGAAGGAGCCCGATGGGGAAGGTTTACTGTGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8733 GCCTCAATTCACTCCAGAAGGAGCCCGATGGGGAAGGTTTACTGTGCCGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCTGCTCTGTGGTCTCTCAGAAGGATGACATCAAGCCCAAGTACAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8783 TTCTGCTCTGTGGTCTCTCAGAAGGATGACATCAAGCCCAAGTACAAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGGGCGCTGGTTTCCATCATCAAGGAACTAGAGCCCAAGCTGAAATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8833 GAGGGCGCTGGTTTCCATCATCAAGGAACTAGAGCCCAAGCTGAAATCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTCTAACAATGAACCCAAGGATGAGGAAGTTTCAAG         TGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
   8883 TTCTAACAATGAACCCAAGGATGAGGAAGTTTCAAGGTA...CAGTGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATGACGTTCGATGTGGACACAGCCAACAACTATCTCATCATTTCTGAAGA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   9435 ATGACCTTCGATGTGGACACAGCCAACAACTATCTCATCATTTCTGAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTGAGGAGTTTCCGAAGTGGGGATTTGAGCCAGAATAGGAAGGAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   9485 CCTGAGGAGTTTCCGAAGTGGGGATTTGAGCCAGAATAGGAAGGAGCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTGAGAGGTTCGACACTGCCCTGTGCGTCCTGGGCACCCCTCGCTTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   9535 CTGAGAGGTTCGACACTGCCCTGTGCGTCCTGGGCACCCCTCGCTTCACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCCGGCCGCCATTACTGGGAGGTGGACGTGGGCACCAGCCAAGTGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   9585 TCCGGCCGCCATTACTGGGAGGTGGACGTGGGCACCAGCCAAGTGTGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGTGGGCGTGTGCAAGGAATCTGTCAACCGACAGGGGAAGATTGTGCTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
   9635 TGTGGGCGTGTGCAAGGAATCTGTCAACCGACAGGGGAAGATTGAGCTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTTCAGAACACGGCTTCTTGACTGTGGGTTGCAGAGAAGGAAAGGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   9685 CTTCAGAACACGGCTTCTTGACTGTGGGTTGCAGAGAAGGAAAGGTCTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCTGCCAGCACTGTGCCTATGACTCCTCTCTGGGTGAGTCCCCAGTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   9735 GCTGCCAGCACTGTGCCTATGACTCCTCTCTGGGTGAGTCCCCAGTTGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAGAGTGGGGATTTTCCTGGATGTAGGTATGAGGTCCATTGCCTTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   9785 CAGAGTGGGGATTTTCCTGGATGTAGGTATGAGGTCCATTGCCTTTTACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATGTTAGTGATGGGTGCCATATCTACACATTCATCGAGATTCCTGTTTGC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
   9835 ATGTTAGTGATGGGTGCCATATCAACACATTCATCGAGATTCCTGTTTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAGCCCTGGCGTCCATTTTTTGCTCATAAACGTGGAAGTCAAGATGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   9885 GAGCCCTGGCGTCCATTTTTTGCTCATAAACGTGGAAGTCAAGATGATCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GAGCATCCTGAGTATCTGTTCTGTGATCAATCCATCCGCTGCCAGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
   9935 GAGCATCCTGAGTATCTGTTCTGTGATCAATCCATCCACTGCCAGTGCCC

    850     .    :    .    :
    842 CAGTTTCTTCTGAGGGAAAG
        ||||||||||||||||||||
   9985 CAGTTTCTTCTGAGGGAAAG