seq1 = pF1KE1215.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KE1215/gi568815592r_26170977.tfa (gi568815592r:26170977_26371384), 200408 bp

>pF1KE1215 408
>gi568815592r:26170977_26371384 (Chr6)

(complement)

1-408  (100001-100408)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCGCACCAAGCAGACTGCACGCAAGTCCACCGGTGGCAAAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCGCACCAAGCAGACTGCACGCAAGTCCACCGGTGGCAAAGCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCAAGCAGCTGGCCACTAAGGCGGCTCGGAAAAGCGCGCCGGCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCAAGCAGCTGGCCACTAAGGCGGCTCGGAAAAGCGCGCCGGCCACCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGCGTGAAGAAACCTCATCGCTACCGTCCCGGCACCGTGGCTCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGCGTGAAGAAACCTCATCGCTACCGTCCCGGCACCGTGGCTCTGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGATTCGCCGCTATCAGAAGTCGACTGAGCTGCTGATCCGCAAGTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGATTCGCCGCTATCAGAAGTCGACTGAGCTGCTGATCCGCAAGTTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTCCAACGCCTGGTGCGAGAAATCGCTCAGGACTTCAAGACAGATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTCCAACGCCTGGTGCGAGAAATCGCTCAGGACTTCAAGACAGATCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTTCAGAGTTCCGCGGTGATGGCCCTGCAGGAGGCCTGCGAGGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTTCAGAGTTCCGCGGTGATGGCCCTGCAGGAGGCCTGCGAGGCCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGGTGGGGCTCTTTGAGGATACCAACCTGTGTGCCATCCATGCTAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGGTGGGGCTCTTTGAGGATACCAACCTGTGTGCCATCCATGCTAAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGTGACTATCATGCCCAAGGACATTCAGCTCGCTCGCCGCATTCGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGTGACTATCATGCCCAAGGACATTCAGCTCGCTCGCCGCATTCGTGGGG

    400     .
    401 AGAGAGCG
        ||||||||
 100401 AGAGAGCG