seq1 = pF1KE1214.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KE1214/gi568815592f_26125155.tfa (gi568815592f:26125155_26325562), 200408 bp

>pF1KE1214 408
>gi568815592f:26125155_26325562 (Chr6)

1-408  (100001-100408)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCGTACTAAGCAGACGGCTCGTAAATCCACAGGCGGTAAAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCGTACTAAGCAGACGGCTCGTAAATCCACAGGCGGTAAAGCACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCAAACAGCTGGCCACTAAGGCAGCTCGCAAGAGCGCTCCGGCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCAAACAGCTGGCCACTAAGGCAGCTCGCAAGAGCGCTCCGGCCACGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGCGTGAAGAAGCCCCATCGCTACCGCCCTGGCACCGTGGCTCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGCGTGAAGAAGCCCCATCGCTACCGCCCTGGCACCGTGGCTCTGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGATCCGTCGCTACCAGAAGTCTACCGAGCTTCTAATCCGGAAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGATCCGTCGCTACCAGAAGTCTACCGAGCTTCTAATCCGGAAGCTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTTTCAGCGCCTGGTGCGAGAAATAGCTCAGGACTTCAAGACCGACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTTTCAGCGCCTGGTGCGAGAAATAGCTCAGGACTTCAAGACCGACCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTCCAGAGTTCCGCGGTGATGGCGCTGCAGGAGGCCTGCGAGGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTCCAGAGTTCCGCGGTGATGGCGCTGCAGGAGGCCTGCGAGGCCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGGTGGGGCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCTATTCATGCCAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGGTGGGGCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCTATTCATGCCAAACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGTGACCATCATGCCTAAAGACATCCAGCTTGCCCGCCGCATTCGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGTGACCATCATGCCTAAAGACATCCAGCTTGCCCGCCGCATTCGTGGGG

    400     .
    401 AGAGGGCG
        ||||||||
 100401 AGAGGGCG