seq1 = pF1KE1206.tfa, 378 bp
seq2 = pF1KE1206/gi568815592r_27032373.tfa (gi568815592r:27032373_27232750), 200378 bp

>pF1KE1206 378
>gi568815592r:27032373_27232750 (Chr6)

(complement)

1-378  (100001-100378)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAGAGCCAGCGAAGTCTGCTCCCGCCCCGAAAAAGGGCTCCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAGAGCCAGCGAAGTCTGCTCCCGCCCCGAAAAAGGGCTCCAAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGGTGACTAAGGCGCAGAAGAAAGACGGCAAGAAGCGCAAGCGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGGTGACTAAGGCGCAGAAGAAAGACGGCAAGAAGCGCAAGCGCAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAAGGAGAGCTATTCCATCTATGTGTACAAGGTTCTGAAGCAGGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAAGGAGAGCTATTCCATCTATGTGTACAAGGTTCTGAAGCAGGTCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTGACACCGGCATTTCGTCCAAGGCCATGGGCATCATGAATTCGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTGACACCGGCATTTCGTCCAAGGCCATGGGCATCATGAATTCGTTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAACGACATTTTCGAGCGCATCGCAGGTGAGGCTTCCCGCCTGGCGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAACGACATTTTCGAGCGCATCGCAGGTGAGGCTTCCCGCCTGGCGCATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAACAAGCGCTCGACCATCACCTCCAGGGAGATCCAGACGGCCGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAACAAGCGCTCGACCATCACCTCCAGGGAGATCCAGACGGCCGTGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCTGCTGCCTGGGGAGTTGGCCAAGCACGCCGTGTCCGAGGGTACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCTGCTGCCTGGGGAGTTGGCCAAGCACGCCGTGTCCGAGGGTACTAA

    350     .    :    .    :    .
    351 GGCCGTCACCAAGTACACCAGCGCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCGTCACCAAGTACACCAGCGCTAAG