seq1 = pF1KE1205.tfa, 378 bp
seq2 = pF1KE1205/gi568815592r_26116266.tfa (gi568815592r:26116266_26316643), 200378 bp

>pF1KE1205 378
>gi568815592r:26116266_26316643 (Chr6)

(complement)

1-378  (100001-100378)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGAACCAGCTAAGTCAGCTCCTGCTCCGAAGAAGGGTTCCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGAACCAGCTAAGTCAGCTCCTGCTCCGAAGAAGGGTTCCAAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGTGACCAAGGCGCAGAAGAAGGATGGCAAGAAGCGCAAGCGCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGTGACCAAGGCGCAGAAGAAGGATGGCAAGAAGCGCAAGCGCAGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTAAGGAGAGCTACTCCGTGTATGTGTACAAGGTGCTAAAACAGGTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTAAGGAGAGCTACTCCGTGTATGTGTACAAGGTGCTAAAACAGGTTCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGATACTGGCATCTCATCCAAGGCCATGGGCATCATGAATTCCTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGATACTGGCATCTCATCCAAGGCCATGGGCATCATGAATTCCTTCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAACGACATCTTCGAACGCATCGCAGGCGAGGCTTCCCGTCTGGCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TAACGACATCTTCGAACGCATCGCAGGCGAGGCTTCCCGTCTGGCCCACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAACAAGCGCTCGACCATTACCTCCAGGGAGATCCAGACCGCCGTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAACAAGCGCTCGACCATTACCTCCAGGGAGATCCAGACCGCCGTGCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCTGCTTCCCGGAGAGCTGGCCAAGCACGCAGTGTCCGAAGGTACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCTGCTTCCCGGAGAGCTGGCCAAGCACGCAGTGTCCGAAGGTACCAA

    350     .    :    .    :    .
    351 GGCTGTCACCAAGTATACAAGCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCTGTCACCAAGTATACAAGCTCCAAG