seq1 = pF1KE1175.tfa, 1992 bp
seq2 = pF1KE1175/gi568815591r_127273344.tfa (gi568815591r:127273344_127491557), 218214 bp

>pF1KE1175 1992
>gi568815591r:127273344_127491557 (Chr7)

(complement)

1-61  (100001-100061)   100% ->
62-157  (105403-105498)   100% ->
158-301  (114229-114372)   100% ->
302-1992  (116524-118214)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTTTAAGGGACAAATACTGTCAGACTGACCACCATCATCACGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTTTAAGGGACAAATACTGTCAGACTGACCACCATCATCACGGATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTGAACCAG         TTTATATCCTGGAACCTGGAGATCCTCCTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGTGAACCAGGTA...TAGTTTATATCCTGGAACCTGGAGATCCTCCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTTACAGCAACCACTACAGACATCCAAATCTGGTATTCAACAAATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105433 TGTTACAGCAACCACTACAGACATCCAAATCTGGTATTCAACAAATAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGTGCTTTCGATCAG         GAACTAAACAACTTAAGCATATTTT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105483 GAGTGCTTTCGATCAGGTA...CAGGAACTAAACAACTTAAGCATATTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ATTAAAAGATGTGGACACTATTTTTGAATGTAAGTTATGCCGCAGTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114254 ATTAAAAGATGTGGACACTATTTTTGAATGTAAGTTATGCCGCAGTCTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAGAGGATTACCAAATTTAATTACCCATAAAAAATTCTACTGCCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114304 TCAGAGGATTACCAAATTTAATTACCCATAAAAAATTCTACTGCCCACCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTCTCCAGATGGATGACA         ACCTTCCTGATGTAAATGATAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 114354 AGTCTCCAGATGGATGACAGTA...CAGACCTTCCTGATGTAAATGATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACAAAGCCAAGCCATAAATGATCTCCTAGAAGCCATATATCCAAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116546 ACAAAGCCAAGCCATAAATGATCTCCTAGAAGCCATATATCCAAGTGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACAAACGAGAATATATTATTAAGCTAGAACCCATAGAAACTAATCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116596 ACAAACGAGAATATATTATTAAGCTAGAACCCATAGAAACTAATCAAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCAGTATTTCAATATATTTCGAGGACTGATAATCCTATTGAAGTCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116646 GCAGTATTTCAATATATTTCGAGGACTGATAATCCTATTGAAGTCACAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTCAAGCAGTACTCCTGAACAAACCGAAGTTCAGATACAGGAAACTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116696 GTCAAGCAGTACTCCTGAACAAACCGAAGTTCAGATACAGGAAACTAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGAACAGTCAAAAACAGTACCGGTTACAGATACAGAGGTGGAAACTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116746 CTGAACAGTCAAAAACAGTACCGGTTACAGATACAGAGGTGGAAACTGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGCCCCCTCCTGTTGAGATTGTTACAGATGAAGTTGCACCTACATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116796 GAGCCCCCTCCTGTTGAGATTGTTACAGATGAAGTTGCACCTACATCTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGAACAACCTCAGGAGTCGCAGGCTGACTTGGAAACTTCTGACAATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116846 TGAACAACCTCAGGAGTCGCAGGCTGACTTGGAAACTTCTGACAATTCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATTTTGGTCACCAGTTGATATGTTGTCTTTGTAGAAAAGAATTCAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116896 ATTTTGGTCACCAGTTGATATGTTGTCTTTGTAGAAAAGAATTCAATTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGACGAGGTGTTCGCCGTCACATTCGAAAAGTACACAAGAAAAAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116946 AGACGAGGTGTTCGCCGTCACATTCGAAAAGTACACAAGAAAAAGATGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AGAACTAAAAAAGTACATTGAAACACGAAAGAATCCAAACCAATCCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116996 AGAACTAAAAAAGTACATTGAAACACGAAAGAATCCAAACCAATCCTCTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AAGGACGCAGTAAGAATGTTCTAGTTCCATTAAGTAGGAGTTGTCCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117046 AAGGACGCAGTAAGAATGTTCTAGTTCCATTAAGTAGGAGTTGTCCAGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TGTTGTAAATCATTTGCTACAAAAGCGAATGTAAGGAGGCATTTTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117096 TGTTGTAAATCATTTGCTACAAAAGCGAATGTAAGGAGGCATTTTGATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 AGTTCATAGAGGACTAAGGAGGGATTCAATTACTCCTGATATAGCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117146 AGTTCATAGAGGACTAAGGAGGGATTCAATTACTCCTGATATAGCAACAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AGCCTGGGCAACCTTTGTTCCTGGATTCTATTTCTCCTAAAAAATCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117196 AGCCTGGGCAACCTTTGTTCCTGGATTCTATTTCTCCTAAAAAATCTTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AAGACTCGAAAACAAAAGTCTTCTTCAAAGGCTGAATACAATTTAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117246 AAGACTCGAAAACAAAAGTCTTCTTCAAAGGCTGAATACAATTTAACTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 ATGCAAATGCCTCCTTTGCAAGAGGAAATATAGTTCACAAATAATGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117296 ATGCAAATGCCTCCTTTGCAAGAGGAAATATAGTTCACAAATAATGCTTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AAAGACATATGCAAATTGTCCACAAGATAACTCTTTCTGGAACAAACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117346 AAAGACATATGCAAATTGTCCACAAGATAACTCTTTCTGGAACAAACTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AAAAGAGAAAAAGGCCCTAATAATACTGCCAACAGTTCAGAAATAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117396 AAAAGAGAAAAAGGCCCTAATAATACTGCCAACAGTTCAGAAATAAAAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TAAAGTTGAACCAGCAGATTCTGTAGAATCTTCACCCCCTTCCATTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117446 TAAAGTTGAACCAGCAGATTCTGTAGAATCTTCACCCCCTTCCATTACCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 ATTCTCCACAGAATGAATTAAAGGGAACAAATCATTCAAATGAAAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117496 ATTCTCCACAGAATGAATTAAAGGGAACAAATCATTCAAATGAAAAAAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 AACACACCGGCAGCACAGAAAAATAAAGTTAAACAAGACTCTGAAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117546 AACACACCGGCAGCACAGAAAAATAAAGTTAAACAAGACTCTGAAAGCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TAAATCAACTAGTCCGTCGGCTGCAGGTGGCCAGCAAAAAACCAGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117596 TAAATCAACTAGTCCGTCGGCTGCAGGTGGCCAGCAAAAAACCAGAAAAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 CAAAACTTTCAGCTGGCTTTGACTTTAAGCAACTTTACTGTAAACTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117646 CAAAACTTTCAGCTGGCTTTGACTTTAAGCAACTTTACTGTAAACTTTGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 AAACGTCAGTTTACTTCCAAACAGAACTTGACTAAACACATCGAGTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117696 AAACGTCAGTTTACTTCCAAACAGAACTTGACTAAACACATCGAGTTGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CACAGATGGAAATAACATTTATGTTAAATTCTACAAGTGTCCTCTTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117746 CACAGATGGAAATAACATTTATGTTAAATTCTACAAGTGTCCTCTTTGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 CTTATGAAACTCGTCGGAAACGTGATGTGATACGACATATAACTGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117796 CTTATGAAACTCGTCGGAAACGTGATGTGATACGACATATAACTGTGGTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 CATAAAAAGTCATCTCGTTATCTTGGGAAAATAACAGCCAGTTTAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117846 CATAAAAAGTCATCTCGTTATCTTGGGAAAATAACAGCCAGTTTAGAGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 CAGAGCTATAAAAAAGCCTATTGATTTTGTTCTAAATAAAGTGGCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117896 CAGAGCTATAAAAAAGCCTATTGATTTTGTTCTAAATAAAGTGGCAAAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 GAGGCCCTTCGAGGGATGAAGCAAAACATAGTGATTCAAAACATGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117946 GAGGCCCTTCGAGGGATGAAGCAAAACATAGTGATTCAAAACATGATGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 ACTTCTAACTCTCCTAGTAAAAAGTATGAAGTAGCTGACGTCGGTATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117996 ACTTCTAACTCTCCTAGTAAAAAGTATGAAGTAGCTGACGTCGGTATTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 AGTAAAAGTCACAAAAAACTTTTCTCTTCACAGATGCAATAAATGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118046 AGTAAAAGTCACAAAAAACTTTTCTCTTCACAGATGCAATAAATGTGGAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 AGGCATTTGCCAAAAAGACTTACCTTGAACATCATAAGAAAACTCATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118096 AGGCATTTGCCAAAAAGACTTACCTTGAACATCATAAGAAAACTCATAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 GCAAATGCTTCCAATTCACCTGAAGGAAACAAAACCAAAGGCCGAAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118146 GCAAATGCTTCCAATTCACCTGAAGGAAACAAAACCAAAGGCCGAAGTAC

   2000     .    :    .
   1974 AAGATCTAAGGCTCTTGTC
        |||||||||||||||||||
 118196 AAGATCTAAGGCTCTTGTC