seq1 = pF1KE1150.tfa, 1458 bp
seq2 = pF1KE1150/gi568815579r_9510203.tfa (gi568815579r:9510203_9718170), 207968 bp

>pF1KE1150 1458
>gi568815579r:9510203_9718170 (Chr19)

(complement)

1-25  (98715-98739)   100% ->
26-114  (99992-100080)   100% ->
115-241  (101000-101126)   100% ->
242-324  (104068-104150)   100% ->
325-1458  (106835-107968)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCATTTATTTGTCCCGTG         GGTTTTTTTCCAGGGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
  98715 ATGGCAGCCATTTATTTGTCCCGTGGTA...TAGGGTTTTTTTCCAGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ACCAATCTGCCCTTTTGAAGAAAAGACAAAGGTAGAAAGGATGGTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100008 ACCAATCTGCCCTTTTGAAGAAAAGACAAAGGTAGAAAGGATGGTGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTACCTGGCAAGTGGTTATCAG         GATTCAGTGACGTTTGAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100058 ACTACCTGGCAAGTGGTTATCAGGTA...TAGGATTCAGTGACGTTTGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GATGTGGCTGTGGACTTCACCCCAGAGGAGTGGGCTTTACTGGACACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101018 GATGTGGCTGTGGACTTCACCCCAGAGGAGTGGGCTTTACTGGACACAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAGAAATACCTCTACAGAGATGTGATGCTGGAGAACTACATGAACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101068 TGAGAAATACCTCTACAGAGATGTGATGCTGGAGAACTACATGAACCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCTCTGTGG         AATGGGAAATACAACCTAGAACCAAACGGTCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101118 CCTCTGTGGGTA...TAGAATGGGAAATACAACCTAGAACCAAACGGTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCACTTCAGCAGGGTTTTTTGAAGAATCAAATATTCAGTGGGATACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104100 TCACTTCAGCAGGGTTTTTTGAAGAATCAAATATTCAGTGGGATACAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 G         ACAAGAGGCTACAGTGGATGGAAACTCTGTGACTGTAAGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104150 GGTA...CAGACAAGAGGCTACAGTGGATGGAAACTCTGTGACTGTAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATTGTGGAGAGGTCTTCAGGGAACAGTTTTGCCTTAAGACACACATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106875 ATTGTGGAGAGGTCTTCAGGGAACAGTTTTGCCTTAAGACACACATGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTTCAGAATGGAGGGAATACTTCTGAGGGTAATTGTTATGGAAAAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106925 GTTCAGAATGGAGGGAATACTTCTGAGGGTAATTGTTATGGAAAAGACAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCTCAGTGTGCACAAGGAAGCCTCTACTGGACAGGAACTTTCCAAATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106975 CCTCAGTGTGCACAAGGAAGCCTCTACTGGACAGGAACTTTCCAAATTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATCCATGTGGAAAAGTCTTTACTCTAACTCCAGGTCTTGCTGTACATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107025 ATCCATGTGGAAAAGTCTTTACTCTAACTCCAGGTCTTGCTGTACATCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAAGTTCTCAATGCAAGACAACCCTACAAATGTAAGGAATGTGGAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107075 GAAGTTCTCAATGCAAGACAACCCTACAAATGTAAGGAATGTGGAAAAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTTTAAGTATTTTGCAAGCCTTGATAATCATATGGGAATCCACACTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107125 CTTTAAGTATTTTGCAAGCCTTGATAATCATATGGGAATCCACACTGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGAAACTCTGTGAATTTCAGGAATATGGGAGAGCTGTCACAGCTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107175 AGAAACTCTGTGAATTTCAGGAATATGGGAGAGCTGTCACAGCTTCTTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CACCTAAAGCAGTGTGTAGCAGTTCATACAGGAAAGAAATCCAAAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107225 CACCTAAAGCAGTGTGTAGCAGTTCATACAGGAAAGAAATCCAAAAAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TAAGAAATGTGGGAAATCCTTCACTAATTTTTCTCAACTTTATGCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107275 TAAGAAATGTGGGAAATCCTTCACTAATTTTTCTCAACTTTATGCACCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGAAAACTCATAAAGGAGAGAAGTCCTTTGAATGTAAAGAATGTGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107325 TGAAAACTCATAAAGGAGAGAAGTCCTTTGAATGTAAAGAATGTGGAAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TCCTTTAGAAATTCCTCATGCCTTAATGATCACATTCAAATTCACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107375 TCCTTTAGAAATTCCTCATGCCTTAATGATCACATTCAAATTCACACTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AATAAAACCACACAAGTGTACTTACTGTGGGAAAGCCTTCACTAGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107425 AATAAAACCACACAAGTGTACTTACTGTGGGAAAGCCTTCACTAGATCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CTCAACTTACTGAACATGTAAGAACTCACACTGGAATAAAACCCTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107475 CTCAACTTACTGAACATGTAAGAACTCACACTGGAATAAAACCCTATGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TGTAAGGAATGTGGCCAAGCCTTTGCTCAGTACTCGGGCCTTTCTATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107525 TGTAAGGAATGTGGCCAAGCCTTTGCTCAGTACTCGGGCCTTTCTATACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CATACGAAGTCACAGTGGAAAGAAACCCTATCAGTGTAAGGAATGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107575 CATACGAAGTCACAGTGGAAAGAAACCCTATCAGTGTAAGGAATGTGGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 AAGCCTTCACTACATCCACAAGTCTTATTCAGCATACAAGAATTCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107625 AAGCCTTCACTACATCCACAAGTCTTATTCAGCATACAAGAATTCACACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GGAGAGAAGCCTTATGAATGTGTTGAATGTGGGAAGACCTTCATTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107675 GGAGAGAAGCCTTATGAATGTGTTGAATGTGGGAAGACCTTCATTACTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TTCCCGTCGTAGTAAACATTTGAAAACTCATAGTGGAGAAAAGCCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107725 TTCCCGTCGTAGTAAACATTTGAAAACTCATAGTGGAGAAAAGCCCTTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TATGCAAGATATGTGGGAAAGCATTTCTATATTCCTCACGCCTTAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107775 TATGCAAGATATGTGGGAAAGCATTTCTATATTCCTCACGCCTTAATGTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 CACCTGCGAACTCATACCGGAGAGAAACCCTTCGTATGTAAAGAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107825 CACCTGCGAACTCATACCGGAGAGAAACCCTTCGTATGTAAAGAATGTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GAAAGCATTTGCTGTTTCCTCACGCCTAAGTAGACATGAAAGAATTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107875 GAAAGCATTTGCTGTTTCCTCACGCCTAAGTAGACATGAAAGAATTCACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 CTGGGGAGAAACCCTATGAATGCAAGGATATGAGTGTTACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107925 CTGGGGAGAAACCCTATGAATGCAAGGATATGAGTGTTACCATT