seq1 = pF1KE1147.tfa, 1386 bp
seq2 = pF1KE1147/gi568815594r_105582736.tfa (gi568815594r:105582736_105800005), 217270 bp

>pF1KE1147 1386
>gi568815594r:105582736_105800005 (Chr4)

(complement)

1-156  (100001-100156)   100% ->
157-309  (104338-104490)   100% ->
310-497  (106520-106707)   100% ->
498-657  (107871-108030)   100% ->
658-804  (113168-113314)   100% ->
805-1386  (116689-117270)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCTACTGTGAACTTGGAACTTGATCCCATTTTTTTGAAAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCTACTGTGAACTTGGAACTTGATCCCATTTTTTTGAAAGCACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGTTTCTTGCATTCAAAGAGTAAAGATTCTGCTGAAAAGCTAAAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGTTTCTTGCATTCAAAGAGTAAAGATTCTGCTGAAAAGCTAAAAGCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTTGATGAATCTTTGGCTCGGGGCATTGATTCCAGTTACCGTCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTTGATGAATCTTTGGCTCGGGGCATTGATTCCAGTTACCGTCCATCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAAAAG         GATGTGGAGCCACCCAAAATTTCAAGCACAAAAAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAAAAGGTA...TAGGATGTGGAGCCACCCAAAATTTCAAGCACAAAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATTTCCATTAAGCAAGAGCCCAAAATATCATCCAGTCTTCCTTCTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104373 CATTTCCATTAAGCAAGAGCCCAAAATATCATCCAGTCTTCCTTCTGGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATAATAATGGCAAGGTCCTCACAACTGAAAAGGTAAAGAAGGAAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104423 ATAATAATGGCAAGGTCCTCACAACTGAAAAGGTAAAGAAGGAAGCTGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGAGACCTGCTGATAAA         ATGAAATCAGACATCACTGAAGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104473 AAGAGACCTGCTGATAAAGTA...TAGATGAAATCAGACATCACTGAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGTTGATATTCCAAAGAAACCTAGATTGGAGAAACCAGAAACACAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106543 AGTTGATATTCCAAAGAAACCTAGATTGGAGAAACCAGAAACACAGTCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTCCCATTACTGTCCAAAGTAGCAAGGATTTACCTATGGCTGACCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106593 CTCCCATTACTGTCCAAAGTAGCAAGGATTTACCTATGGCTGACCTTTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGTTTTGAGGAGACCAGTGCTGATGATTTTGCCATGGAGATGGGATTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106643 AGTTTTGAGGAGACCAGTGCTGATGATTTTGCCATGGAGATGGGATTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTGCGTTGTTTGTAG         GCAAATGATGGTGGCATCTGGCAATC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 106693 CTGCGTTGTTTGTAGGTA...TAGGCAAATGATGGTGGCATCTGGCAATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AATTAGTAGAATGTCAGGAGTGCCATAATCTCTACCACCGAGATTGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107897 AATTAGTAGAATGTCAGGAGTGCCATAATCTCTACCACCGAGATTGTCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAACCCCAGGTGACAGACAAGGAAGCGAATGACCCTCGCCTGGTGTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107947 AAACCCCAGGTGACAGACAAGGAAGCGAATGACCCTCGCCTGGTGTGGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TTGTGCCCGATGTACCAGACAAATGAAAAGAATG         GCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 107997 TTGTGCCCGATGTACCAGACAAATGAAAAGAATGGTA...CAGGCTCAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAACTCAGAAACCACCGCAGAAACCAGCCCCTGCAGTTGTTTCTGTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113175 AAACTCAGAAACCACCGCAGAAACCAGCCCCTGCAGTTGTTTCTGTAACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCAGCTGTCAAAGATCCATTGGTTAAGAAACCAGAAACTAAACTGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113225 CCAGCTGTCAAAGATCCATTGGTTAAGAAACCAGAAACTAAACTGAAACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGAGACAACTTTTCTAGCGTTTAAGAGAACAGAAGTCAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 113275 AGAGACAACTTTTCTAGCGTTTAAGAGAACAGAAGTCAAGGTA...TAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CATCCACAGTTATTTCAGGAAATTCTTCTAGTGCCAGCGTTTCCTCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116690 CATCCACAGTTATTTCAGGAAATTCTTCTAGTGCCAGCGTTTCCTCGTCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTAACTAGTGGCTTAACTGGATGGGCAGCTTTTGCAGCCAAAACTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116740 GTAACTAGTGGCTTAACTGGATGGGCAGCTTTTGCAGCCAAAACTTCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGCTGGTCCTTCAACAGCAAAATTGAGTTCAACAACACAAAACAATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116790 TGCTGGTCCTTCAACAGCAAAATTGAGTTCAACAACACAAAACAATACTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GGAAACCTGCTACTTCGTCAGCTAACCAGAAACCTGTGGGTTTGACTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116840 GGAAACCTGCTACTTCGTCAGCTAACCAGAAACCTGTGGGTTTGACTGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTGGCAACATCATCCAAAGGTGGAATAGGTTCCAAAATAGGTTCCAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116890 CTGGCAACATCATCCAAAGGTGGAATAGGTTCCAAAATAGGTTCCAATAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CAGCACTACGCCCACTGTACCTTTAAAACCACCTCCACCTCTAACCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116940 CAGCACTACGCCCACTGTACCTTTAAAACCACCTCCACCTCTAACCTTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GTAAAACTGGCCTTAGTCGCTCAGTTAGTTGTGACAATGTCAGCAAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116990 GTAAAACTGGCCTTAGTCGCTCAGTTAGTTGTGACAATGTCAGCAAAGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GGTCTTCCTAGTCCAAGTAGTTTAGTTCCAGGAAGCAGCAGCCAACTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117040 GGTCTTCCTAGTCCAAGTAGTTTAGTTCCAGGAAGCAGCAGCCAACTAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TGGGAATGGAAATAGTGGAACATCAGGACCTAGTGGAAGTACTACCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117090 TGGGAATGGAAATAGTGGAACATCAGGACCTAGTGGAAGTACTACCAGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 AAACTACTTCAGAATCCAGCAGCTCTCCCTCAGCATCCCTTAAAGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117140 AAACTACTTCAGAATCCAGCAGCTCTCCCTCAGCATCCCTTAAAGGCCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 ACTTCACAAGAATCACAGCTCAATGCTATGAAGCGATTACAGATGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117190 ACTTCACAAGAATCACAGCTCAATGCTATGAAGCGATTACAGATGGTCAA

   1400     .    :    .    :    .    :
   1356 GAAGAAAGCTGCCCAAAAGAAACTCAAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 117240 GAAGAAAGCTGCCCAAAAGAAACTCAAGAAG