seq1 = pF1KE1144.tfa, 1284 bp
seq2 = pF1KE1144/gi568815585r_76907148.tfa (gi568815585r:76907148_77121860), 214713 bp

>pF1KE1144 1284
>gi568815585r:76907148_77121860 (Chr13)

(complement)

1-348  (100001-100348)   100% ->
349-471  (103139-103261)   100% ->
472-643  (106281-106452)   100% ->
644-1284  (114073-114713)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAACGAGGAGGAAGAGATAGTGACCGTAATTCATCAGAAGAAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAACGAGGAGGAAGAGATAGTGACCGTAATTCATCAGAAGAAGGAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCAGAGAAATCCAAGAAACTGAGGACTACAAATGAGCATTCTCAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCAGAGAAATCCAAGAAACTGAGGACTACAAATGAGCATTCTCAGACTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGATTGGGGTAATCTCCTTCAGGACATTATTCTCCAAGTATTTAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGATTGGGGTAATCTCCTTCAGGACATTATTCTCCAAGTATTTAAATAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGCCTCTTCTTGACCGGGCTCATGCTTCACAAGTTTGCCGCAACTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGCCTCTTCTTGACCGGGCTCATGCTTCACAAGTTTGCCGCAACTGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGGTATTTCACATGCCTGACTTGTGGAGATGTTTTGAATTTGAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGGTATTTCACATGCCTGACTTGTGGAGATGTTTTGAATTTGAACTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCAGCCAGCTACATCTTATTTGAAAGCTACCCATCCAGAGCTGATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCAGCCAGCTACATCTTATTTGAAAGCTACCCATCCAGAGCTGATCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGATTATTAAAAGACATTCAAACCATCTACAATATGTCAGCTTCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100301 CAGATTATTAAAAGACATTCAAACCATCTACAATATGTCAGCTTCAAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    349        GTGGACAGCAGCAAGGAATCAGCTGAAGCAGCTTGTGATATAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 A...AAGGTGGACAGCAGCAAGGAATCAGCTGAAGCAGCTTGTGATATAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TATCGCAACTTGTGAATTGCTCTTTAAAAACACTTGGACTTATTTCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103182 TATCGCAACTTGTGAATTGCTCTTTAAAAACACTTGGACTTATTTCAACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCTCGACCAAGCTTTATGGATTTACCAAAG         TCTCACTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103232 GCTCGACCAAGCTTTATGGATTTACCAAAGGTA...CAGTCTCACTTTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTCTGCACTGACAGTTGTGTTCGTAAACTCCAAATCCCTGTCTTCGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106292 CTCTGCACTGACAGTTGTGTTCGTAAACTCCAAATCCCTGTCTTCGCTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGATAGATGATACTCCAGTAGATGATCCATCTCTCAAAGTACTAGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106342 AGATAGATGATACTCCAGTAGATGATCCATCTCTCAAAGTACTAGTGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AACAATAGTGATACACTCAAGCTGTTGAAAATGAGCAGCTGTCCTCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106392 AACAATAGTGATACACTCAAGCTGTTGAAAATGAGCAGCTGTCCTCATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CTCTCCAGCAG         GTATCCTTTGTGTGGCTGATCAGTGTCACG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 106442 CTCTCCAGCAGGTA...AAGGTATCCTTTGTGTGGCTGATCAGTGTCACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCTTAAGAGAACTAGCCCTGAACTACCACTTATTGAGTGATGAGTTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114103 GCTTAAGAGAACTAGCCCTGAACTACCACTTATTGAGTGATGAGTTGTTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTTGCATTGTCTTCTGAAAAACATGTTCGATTAGAACATTTGCGCATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114153 CTTGCATTGTCTTCTGAAAAACATGTTCGATTAGAACATTTGCGCATTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TGTAGTCAGTGAGAATCCTGGACAGACACACTTCCATACTATTCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114203 TGTAGTCAGTGAGAATCCTGGACAGACACACTTCCATACTATTCAGAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GTAGCTGGGATGCTTTCATCAGACATTCACCCAAAGTGAACTTAGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114253 GTAGCTGGGATGCTTTCATCAGACATTCACCCAAAGTGAACTTAGTGATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TATTTTTTTTTATATGAAGAAGAATTTGACCCCTTCTTTCGCTATGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114303 TATTTTTTTTTATATGAAGAAGAATTTGACCCCTTCTTTCGCTATGAAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 ACCTGCCACCCATCTGTACTTTGGGAGATCAGTAAGCAAAGATGTGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114353 ACCTGCCACCCATCTGTACTTTGGGAGATCAGTAAGCAAAGATGTGCTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GCCGTGTGGGAATGACATGCCCTAGACTGGTTGAACTAGTAGTGTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114403 GCCGTGTGGGAATGACATGCCCTAGACTGGTTGAACTAGTAGTGTGTGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AATGGATTACGGCCACTTGATGAAGAGTTAATTCGCATTGCAGAACGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114453 AATGGATTACGGCCACTTGATGAAGAGTTAATTCGCATTGCAGAACGTTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CAAAAATTTGTCAGCTATTGGACTAGGGGAATGTGAAGTCTCATGTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114503 CAAAAATTTGTCAGCTATTGGACTAGGGGAATGTGAAGTCTCATGTAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CCTTTGTTGAGTTTGTGAAGATGTGTGGTGGCCGCCTATCTCAATTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114553 CCTTTGTTGAGTTTGTGAAGATGTGTGGTGGCCGCCTATCTCAATTATCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 ATTATGGAAGAAGTACTAATTCCTGACCAAAAGTATAGTTTGGAGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114603 ATTATGGAAGAAGTACTAATTCCTGACCAAAAGTATAGTTTGGAGCAGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TCACTGGGAAGTGTCCAAGCATCTTGGTAGGGTGTGGTTTCCCGACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114653 TCACTGGGAAGTGTCCAAGCATCTTGGTAGGGTGTGGTTTCCCGACATGA

   1300     .    :
   1274 TGCCCACTTGG
        |||||||||||
 114703 TGCCCACTTGG