seq1 = pF1KE1135.tfa, 1059 bp
seq2 = pF1KE1135/gi568815587f_76695617.tfa (gi568815587f:76695617_76896675), 201059 bp

>pF1KE1135 1059
>gi568815587f:76695617_76896675 (Chr11)

1-1059  (100001-101059)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGTGGCCCCTGCTGCTGCTGCTGGCCGTGAGTGGGGCCCAGACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGTGGCCCCTGCTGCTGCTGCTGGCCGTGAGTGGGGCCCAGACAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGCCATGCTTCCCCGGGTGCCAATGCGAGGTGGAGACCTTCGGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGCCATGCTTCCCCGGGTGCCAATGCGAGGTGGAGACCTTCGGCCTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGACAGCTTCAGCCTGACTCGGGTGGATTGTAGCGGCCTGGGCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGACAGCTTCAGCCTGACTCGGGTGGATTGTAGCGGCCTGGGCCCCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCATGCCGGTGCCCATCCCTCTGGACACAGCCCACTTGGACCTGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCATGCCGGTGCCCATCCCTCTGGACACAGCCCACTTGGACCTGTCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACCGGCTGGAGATGGTGAATGAGTCGGTGTTGGCGGGGCCGGGCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACCGGCTGGAGATGGTGAATGAGTCGGTGTTGGCGGGGCCGGGCTACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGACGTTGGCTGGCCTGGATCTCAGCCACAACCTGCTCACCAGCATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGACGTTGGCTGGCCTGGATCTCAGCCACAACCTGCTCACCAGCATCTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCACTGCCTTCTCCCGCCTTCGCTACCTGGAGTCGCTTGACCTCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCACTGCCTTCTCCCGCCTTCGCTACCTGGAGTCGCTTGACCTCAGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAATGGCCTGACAGCCCTGCCAGCCGAGAGCTTCACCAGCTCACCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAATGGCCTGACAGCCCTGCCAGCCGAGAGCTTCACCAGCTCACCCCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCGACGTGAACCTTAGCCACAACCAGCTCCGGGAGGTCTCAGTGTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCGACGTGAACCTTAGCCACAACCAGCTCCGGGAGGTCTCAGTGTCTGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCACGACGCACAGTCAGGGCCGGGCACTACACGTGGACCTCTCCCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCACGACGCACAGTCAGGGCCGGGCACTACACGTGGACCTCTCCCACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTCATTCACCGCCTCGTGCCCCACCCCACGAGGGCCGGCCTGCCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTCATTCACCGCCTCGTGCCCCACCCCACGAGGGCCGGCCTGCCTGCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCACCATTCAGAGCCTGAACCTGGCCTGGAACCGGCTCCATGCCGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCACCATTCAGAGCCTGAACCTGGCCTGGAACCGGCTCCATGCCGTGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AACCTCCGAGACTTGCCCCTGCGCTACCTGAGCCTGGATGGGAACCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AACCTCCGAGACTTGCCCCTGCGCTACCTGAGCCTGGATGGGAACCCTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGCTGTCATTGGTCCGGGTGCCTTCGCGGGGCTGGGAGGCCTTACACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGCTGTCATTGGTCCGGGTGCCTTCGCGGGGCTGGGAGGCCTTACACACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGTCTCTGGCCAGCCTGCAGAGGCTCCCTGAGCTGGCGCCCAGTGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGTCTCTGGCCAGCCTGCAGAGGCTCCCTGAGCTGGCGCCCAGTGGCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CGTGAGCTACCGGGCCTGCAGGTCCTGGACCTGTCGGGCAACCCCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CGTGAGCTACCGGGCCTGCAGGTCCTGGACCTGTCGGGCAACCCCAAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TAACTGGGCAGGAGCTGAGGTGTTTTCAGGCCTGAGCTCCCTGCAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TAACTGGGCAGGAGCTGAGGTGTTTTCAGGCCTGAGCTCCCTGCAGGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGACCTTTCGGGCACCAACCTGGTGCCCCTGCCTGAGGCGCTGCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGACCTTTCGGGCACCAACCTGGTGCCCCTGCCTGAGGCGCTGCTCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CACCTCCCGGCACTGCAGAGCGTCAGCGTGGGCCAGGATGTGCGGTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CACCTCCCGGCACTGCAGAGCGTCAGCGTGGGCCAGGATGTGCGGTGCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCGCCTGGTGCGGGAGGGCACCTACCCCCGGAGGCCTGGCTCCAGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCGCCTGGTGCGGGAGGGCACCTACCCCCGGAGGCCTGGCTCCAGCCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGGTGGCCCTGCACTGCGTAGACACCCGGGAATCTGCTGCCAGGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 101001 AGGTGGCCCTGCACTGCGTAGACACCCGGGATTCTGCTGCCAGGGGCCCC

   1050     .
   1051 ACCATCTTG
        |||||||||
 101051 ACCATCTTG