seq1 = pF1KE1131.tfa, 777 bp
seq2 = pF1KE1131/gi568815579f_17115406.tfa (gi568815579f:17115406_17319810), 204405 bp

>pF1KE1131 777
>gi568815579f:17115406_17319810 (Chr19)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-152  (100397-100446)   100% ->
153-231  (100587-100665)   100% ->
232-384  (100764-100916)   100% ->
385-422  (102952-102986)   89% ->
423-597  (103808-103982)   99% ->
598-777  (104226-104405)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGTCGAGGCTGGAGCTAAACCTGGTGCGGCTGCTATCCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGTCGAGGCTGGAGCTAAACCTGGTGCGGCTGCTATCCCGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGGCGATGGCAGCGGAGAAACGGGACCCGGACGAGTGGCGCCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGGCGATGGCAGCGGAGAAACGGGACCCGGACGAGTGGCGCCTGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AG         TACGTGGGAGCCCTAGAGGACATGTTGCAGGCCCTGAAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGTG...CAGTACGTGGGAGCCCTAGAGGACATGTTGCAGGCCCTGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCCACGCGAG         CAAACCGGCCTCTGAGGTGATCAATGAATA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100436 GTCCACGCGAGGTG...CAGCAAACCGGCCTCTGAGGTGATCAATGAATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTCCTGGAAGGTGGATTTTCTGAAGGGGATGCTGCAAGCCGAGAAGCTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100617 TTCCTGGAAGGTGGATTTTCTGAAGGGGATGCTGCAAGCCGAGAAGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    232         ACCTCCTCCTCAGAGAAAGCACTGGCCAACCAGTTCCTGGCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100667 TG...CAGACCTCCTCCTCAGAGAAAGCACTGGCCAACCAGTTCCTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCTGGCCGTGTGCCAACCACAGCCAGAGAGCGAGTGCCCGCCACAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100806 CCTGGCCGTGTGCCAACCACAGCCAGAGAGCGAGTGCCCGCCACAAAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGTGCATCTGCAGTCACGGGCGCGGTACACCAGCGAGATGCGGAGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100856 GGTGCATCTGCAGTCACGGGCGCGGTACACCAGCGAGATGCGGAGTGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TACTAGGCACG         GACTCTGCAGAGCCTGAGATGGACGTAAGG
        |||||||||||>>>...>>>--|| |-|||||||||||||||||||||||
 100906 TACTAGGCACGGTA...TTG  CTTT CAGAGCCTGAGATGGACGTAAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAGAGAAC         TGGAGTGGCAGGGTCCCAGCCAGTGAGTGAGAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102979 AAGAGAACGTG...CAGTGGAGTGGCAGGGTCCCAGCCAGTGAGTGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GCAGTCGGCAGCTGAGCTAGACCTCGTCCTGCAGCGACATCAGAACCTCC
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103841 GCAGTTGGCAGCTGAGCTAGACCTCGTCCTGCAGCGACATCAGAACCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGGAAAAGCTGGCGGAAGAGATGCTAGGACTGGCCCGGAGCCTCAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103891 AGGAAAAGCTGGCGGAAGAGATGCTAGGACTGGCCCGGAGCCTCAAGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AATACCCTGGCCGCCCAGAGTGTCATCAAGAAGGACAACCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103941 AATACCCTGGCCGCCCAGAGTGTCATCAAGAAGGACAACCAGGTG...CA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    598  ACCCTGTCACACTCACTGAAAATGGCGGACCAGAACCTGGAGAAACTGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104225 GACCCTGTCACACTCACTGAAAATGGCGGACCAGAACCTGGAGAAACTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGACGGAGTCAGAGCGTCTGGAGCAGCACACGCAGAAGTCAGTCAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104275 AGACGGAGTCAGAGCGTCTGGAGCAGCACACGCAGAAGTCAGTCAACTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTGCTCTGGGCCATGCTCATTATCGTCTGCTTCATCTTCATTAGCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104325 CTGCTCTGGGCCATGCTCATTATCGTCTGCTTCATCTTCATTAGCATGAT

    800     .    :    .    :    .    :
    747 CCTCTTCATTCGAATCATGCCTAAACTCAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 104375 CCTCTTCATTCGAATCATGCCTAAACTCAAA