seq1 = pF1KE1128.tfa, 495 bp
seq2 = pF1KE1128/gi568815577r_44671380.tfa (gi568815577r:44671380_44901748), 230369 bp

>pF1KE1128 495
>gi568815577r:44671380_44901748 (Chr21)

(complement)

1-43  (100001-100043)   100% ->
44-79  (113654-113689)   100% ->
80-125  (113784-113829)   100% ->
126-244  (124332-124450)   100% ->
245-385  (128062-128202)   100% ->
386-495  (130260-130369)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGGACCGCGCTCAAGAGGCTGATGGCCGAGTACAAAC       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100001 ATGGCGGGGACCGCGCTCAAGAGGCTGATGGCCGAGTACAAACGTG...T

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     44   AATTAACACTGAATCCTCCGGAAGGAATTGTAGCAG         GCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 113652 AGAATTAACACTGAATCCTCCGGAAGGAATTGTAGCAGGTA...CAGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 CCATGAATGAAGAGAACTTTTTTGAATGGGAGGCATTGATCAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 113787 CCATGAATGAAGAGAACTTTTTTGAATGGGAGGCATTGATCATGTA...T

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    126   GGGCCCAGAAGACACCTGCTTTGAGTTTGGTGTTTTTCCTGCCATCCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124330 AGGGGCCCAGAAGACACCTGCTTTGAGTTTGGTGTTTTTCCTGCCATCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 GAGTTTCCCACTTGATTACCCGTTAAGTCCCCCAAAGATGAGATTTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124380 GAGTTTCCCACTTGATTACCCGTTAAGTCCCCCAAAGATGAGATTTACCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GTGAGATGTTTCATCCCAACA         TCTACCCTGATGGGAGAGTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 124430 GTGAGATGTTTCATCCCAACAGTA...CAGTCTACCCTGATGGGAGAGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 TGCATTTCCATCCTCCACGCGCCAGGCGATGACCCCATGGGCTACGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128082 TGCATTTCCATCCTCCACGCGCCAGGCGATGACCCCATGGGCTACGAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CAGCGCGGAGCGGTGGAGTCCTGTGCAGAGTGTGGAGAAGATCCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128132 CAGCGCGGAGCGGTGGAGTCCTGTGCAGAGTGTGGAGAAGATCCTGCTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CGGTGGTGAGCATGCTGGCAG         AGCCCAATGACGAAAGTGGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 128182 CGGTGGTGAGCATGCTGGCAGGTA...CAGAGCCCAATGACGAAAGTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GCTAACGTGGATGCGTCCAAAATGTGGCGCGATGACCGGGAGCAGTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130280 GCTAACGTGGATGCGTCCAAAATGTGGCGCGATGACCGGGAGCAGTTCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TAAGATTGCCAAGCAGATCGTCCAGAAGTCTCTGGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130330 TAAGATTGCCAAGCAGATCGTCCAGAAGTCTCTGGGACTG