seq1 = pF1KE1118.tfa, 981 bp
seq2 = pF1KE1118/gi568815588r_47368850.tfa (gi568815588r:47368850_47579889), 211040 bp

>pF1KE1118 981
>gi568815588r:47368850_47579889 (Chr10)

(complement)

1-21  (95957-95977)   100% ->
22-112  (100002-100092)   100% ->
113-207  (101263-101357)   100% ->
208-321  (102696-102809)   100% ->
322-412  (103568-103658)   100% ->
413-492  (104318-104397)   100% ->
493-552  (104886-104945)   100% ->
553-646  (105492-105585)   100% ->
647-742  (105825-105920)   100% ->
743-801  (107699-107757)   100% ->
802-924  (108506-108628)   100% ->
925-981  (110984-111040)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTGGTGGAAATCCTGG         ATTGAACAGGAGGGTGTCAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
  95957 ATGGCCTGGTGGAAATCCTGGGTA...CAGATTGAACAGGAGGGTGTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGTGAAGAGCAGCTCCCACTTCAACCCAGACCCTGATGCAGAGACCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100022 AGTGAAGAGCAGCTCCCACTTCAACCCAGACCCTGATGCAGAGACCCTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACAAAGCCATGAAGGGGATCG         GGACCAACGAGCAGGCTATC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100072 ACAAAGCCATGAAGGGGATCGGTG...CAGGGACCAACGAGCAGGCTATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATCGATGTGCTCACCAAGAGAAGCAACACGCAGCGGCAGCAGATCGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101283 ATCGATGTGCTCACCAAGAGAAGCAACACGCAGCGGCAGCAGATCGCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTCCTTCAAGGCTCAGTTCGGCAAG         GACCTCACTGAGACCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101333 GTCCTTCAAGGCTCAGTTCGGCAAGGCA...TAGGACCTCACTGAGACCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGAAGTCTGAGCTCAGTGGCAAGTTTGAGAGGCTCATTGTGGCCCTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102712 TGAAGTCTGAGCTCAGTGGCAAGTTTGAGAGGCTCATTGTGGCCCTTATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TACCCGCCATACAGATACGAAGCCAAGGAGCTGCATGACGCCATGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 102762 TACCCGCCATACAGATACGAAGCCAAGGAGCTGCATGACGCCATGAAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    322        GGCTTAGGAACCAAGGAGGGTGTCATCATTGAGATCCTGGCCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102812 A...CAGGGCTTAGGAACCAAGGAGGGTGTCATCATTGAGATCCTGGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CTCGGACCAAGAACCAGCTGCGGGAGATAATGAAGGCGTATGAGGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 103611 CTCGGACCAAGAACCAGCTGCGGGAGATAATGAAGGCGTATGAGGAAGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    413        ACTATGGGTCCAGCCTGGAGGAGGACATCCAAGCAGACACAAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103661 A...CAGACTATGGGTCCAGCCTGGAGGAGGACATCCAAGCAGACACAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGGCTACCTGGAGAGGATCCTGGTGTGCCTCCTGCAG         GGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 104361 TGGCTACCTGGAGAGGATCCTGGTGTGCCTCCTGCAGGTG...TAGGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 GCAGGGATGATGTGAGCAGCTTTGTGGACCCAGGACTGGCCCTCCAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104890 GCAGGGATGATGTGAGCAGCTTTGTGGACCCAGGACTGGCCCTCCAAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GCACAG         GATCTGTATGCGGCAGGCGAGAAGATTCGTGGGAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104940 GCACAGGTG...TAGGATCTGTATGCGGCAGGCGAGAAGATTCGTGGGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 TGATGAGATGAAATTCATCACCATCCTGTGCACGCGCAGTGCCACTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105527 TGATGAGATGAAATTCATCACCATCCTGTGCACGCGCAGTGCCACTCACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TGCTGAGAG         TGTTTGAAGAGTATGAGAAAATTGCCAACAAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105577 TGCTGAGAGGTA...CAGTGTTTGAAGAGTATGAGAAAATTGCCAACAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 AGCATTGAGGACAGCATCAAGAGTGAGACCCATGGCTCACTGGAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105857 AGCATTGAGGACAGCATCAAGAGTGAGACCCATGGCTCACTGGAGGAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 CATGCTCACTGTGG         TGAAATGCACCCAAAACCTCCACAGCT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105907 CATGCTCACTGTGGGTA...CAGTGAAATGCACCCAAAACCTCCACAGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 ACTTTGCAGAGAGACTCTACTATGCCATGAAG         GGAGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 107726 ACTTTGCAGAGAGACTCTACTATGCCATGAAGGTA...CAGGGAGCAGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 ACGCGTGATGGGACCCTGATAAGAAACATCGTTTCAAGGAGCGAGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108515 ACGCGTGATGGGACCCTGATAAGAAACATCGTTTCAAGGAGCGAGATTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 CTTAAATCTTATCAAATGTCACTTCAAGAAGATGTACGGCAAGACCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108565 CTTAAATCTTATCAAATGTCACTTCAAGAAGATGTACGGCAAGACCCTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 GCAGCATGATCATG         GAAGACACCAGCGGTGACTACAAGAAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 108615 GCAGCATGATCATGGTA...CAGGAAGACACCAGCGGTGACTACAAGAAC

   1050     .    :    .    :    .    :
    952 GCCCTGCTGAGCCTGGTGGGCAGCGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 111011 GCCCTGCTGAGCCTGGTGGGCAGCGACCCC