seq1 = pF1KE1115.tfa, 570 bp
seq2 = pF1KE1115/gi568815576f_38915591.tfa (gi568815576f:38915591_39118384), 202794 bp

>pF1KE1115 570
>gi568815576f:38915591_39118384 (Chr22)

14-174  (100001-100161)   100% ->
175-454  (102176-102455)   100% ->
455-570  (102679-102794)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     14 TCAGAAACCCGATGAAGGCAATGTATCCAGGCACATTCTACTTCCAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 TCAGAAACCCGATGAAGGCAATGTATCCAGGCACATTCTACTTCCAATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     64 AAAAACCTATGGGAAGCCAACGATCGGAACGAAACTTGGCTGTGCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAAAACCTATGGGAAGCCAACGATCGGAACGAAACTTGGCTGTGCTTCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    114 CGTGGAAGGTATAAAGCGCCGCTCAGTTGTCTCCTGGAAGACGGGCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGTGGAAGGTATAAAGCGCCGCTCAGTTGTCTCCTGGAAGACGGGCGTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    164 TCCGAAACCAG         GTGGATTCTGAGACCCATTGTCATGCAGAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCGAAACCAGGTA...CAGGTGGATTCTGAGACCCATTGTCATGCAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    205 AGGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGCGACGACATACTGTCTCCTAACACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102206 AGGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGCGACGACATACTGTCTCCTAACACAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    255 GTACCAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGACTGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102256 GTACCAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGACTGTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    305 GGGAGGTGGCCGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102306 GGGAGGTGGCCGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    355 TTCACCGCCCGCCTCTACTACTTCCAGTATCCATGTTACCAGGAGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102356 TTCACCGCCCGCCTCTACTACTTCCAGTATCCATGTTACCAGGAGGGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    405 CCGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGTCGCTGTGGAGATCATGGACTATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102406 CCGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGTCGCTGTGGAGATCATGGACTATGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    455          ATTTTAAATATTGTTGGGAAAACTTTGTGTACAATGATAAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102456 GTG...CAGATTTTAAATATTGTTGGGAAAACTTTGTGTACAATGATAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    496 GAGCCATTCAAGCCTTGGAAGGGATTAAAAACCAACTTTCGACTTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102720 GAGCCATTCAAGCCTTGGAAGGGATTAAAAACCAACTTTCGACTTCTGAA

    550     .    :    .    :    .
    546 AAGAAGGCTACGGGAGAGTCTCCAG
        |||||||||||||||||||||||||
 102770 AAGAAGGCTACGGGAGAGTCTCCAG