seq1 = pF1KE1111.tfa, 390 bp
seq2 = pF1KE1111/gi568815592r_27792760.tfa (gi568815592r:27792760_27993149), 200390 bp

>pF1KE1111 390
>gi568815592r:27792760_27993149 (Chr6)

(complement)

1-390  (100001-100390)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGGACGTGGCAAGCAGGGCGGCAAGGCTCGCGCCAAGGCCAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGGACGTGGCAAGCAGGGCGGCAAGGCTCGCGCCAAGGCCAAAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCTCCTCTAGAGCTGGGCTCCAATTTCCTGTAGGACGAGTGCACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCTCCTCTAGAGCTGGGCTCCAATTTCCTGTAGGACGAGTGCACCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTCCGCAAGGGCAACTACGCTGAGCGGGTCGGGGCCGGCGCGCCGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTCCGCAAGGGCAACTACGCTGAGCGGGTCGGGGCCGGCGCGCCGGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACCTGGCGGCGGTGCTGGAGTACCTAACTGCCGAGATCCTGGAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACCTGGCGGCGGTGCTGGAGTACCTAACTGCCGAGATCCTGGAGCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGCAACGCAGCCCGCGACAACAAAAAGACCCGCATCATCCCGCGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGCAACGCAGCCCGCGACAACAAAAAGACCCGCATCATCCCGCGCCACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCAGCTGGCCATCCGCAACGACGAGGAGCTCAACAAGCTGCTTGGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCAGCTGGCCATCCGCAACGACGAGGAGCTCAACAAGCTGCTTGGTAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTTACCATCGCTCAGGGCGGTGTTCTGCCTAACATCCAGGCCGTACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTTACCATCGCTCAGGGCGGTGTTCTGCCTAACATCCAGGCCGTACTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCCAAGAAGACTGAGAGCCACCACAAAGCTAAGGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCCAAGAAGACTGAGAGCCACCACAAAGCTAAGGGCAAG