seq1 = pF1KE1108.tfa, 309 bp
seq2 = pF1KE1108/gi568815575f_140902694.tfa (gi568815575f:140902694_141690685), 787992 bp

>pF1KE1108 309
>gi568815575f:140902694_141690685 (ChrX)

1-90  (100001-100090)   100% ->
91-309  (100738-100956)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCAACAATCCAGTGTCCGCAGGCTGAAGAGGAGCGTCCCCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCAACAATCCAGTGTCCGCAGGCTGAAGAGGAGCGTCCCCTGTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCCAACGAGGCCAACGAGGCCAATGAGGCCAACAAGACG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100051 ATCCAACGAGGCCAACGAGGCCAATGAGGCCAACAAGACGGTA...CAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCCGGAGACCCCAACTGGGGACTCAGACCCGCAACCTGCTCCTAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100739 TGCCGGAGACCCCAACTGGGGACTCAGACCCGCAACCTGCTCCTAAAAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGAAAACATCTGAGTCCTCGACCATACTAGTGGTTCGCTACAGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100789 ATGAAAACATCTGAGTCCTCGACCATACTAGTGGTTCGCTACAGGAGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGTGAAAAGAACATCTCCAGAGGAACTGGTGAATGACCACGCCCGAGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100839 CGTGAAAAGAACATCTCCAGAGGAACTGCTGAATGACCACGCCCGAGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACAGAATCAACCCCGACCAAATGGAGGAGGAGGAATTCATAGAAATAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100889 ACAGAATCAACCCCGACCAAATGGAGGAGGAGGAATTCATAGAAATAACG

    300     .    :    .
    292 ACTGAAAGACCTAAAAAG
        ||||||||||||||||||
 100939 ACTGAAAGACCTAAAAAG