seq1 = pF1KE1100.tfa, 915 bp
seq2 = pF1KE1100/gi568815583r_34984196.tfa (gi568815583r:34984196_35185110), 200915 bp

>pF1KE1100 915
>gi568815583r:34984196_35185110 (Chr15)

(complement)

1-915  (100001-100915)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGTGGATCCAGCTTGTCCCCAAAGCTTGCCTTGCTTTGAAGCATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 100001 ATGAGTGTGGATCCAGCTTGTCCCCAAAGCTTGCCTTGCTTTGAAGAATC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACTGTAAAGAATCTTCACCTATGCCTGTGATTTGTGGGCCTGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACTGTAAAGAATCTTCACCTATGCCTGTGATTTGTGGGCCTGAAGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTATCCATCCTTGCAAATGTCTTCTGCTGAGATGCCTCACACAGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTATCCATCCTTGCAAATGTCTTCTGCTGAGATGCCTCACACAGAGACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCTCTCCTCTTCCTTCCTCCATGGATCTGCTTATTCAGGACAGCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCTCTCCTCTTCCTTCCTCCATGGATCTGCTTATTCAGGACAGCCCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCTTCCACCAGTCCCAAAGGCAAACAACCCACTTCTGCAGAGAATAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTCTTCCACCAGTCCCAAAGGCAAACAACCCACTTCTGCAGAGAATAGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGCAAAAAAGGAAGACAAGGTCCCGGTCAAGAAACAGAAGACCAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCGCAAAAAAGGAAGACAAGGTCCCGGTCAAGAAACAGAAGACCAGAACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGTTCTCTTCCACCCAGCTGTGTGTACTCAATGATAGATTTCAGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGTTCTCTTCCACCCAGCTGTGTGTACTCAATGATAGATTTCAGAGACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAAATACCTCAGCCTCCAGCAGATGCAAGAACTCTCCAACATCCTGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAAATACCTCAGCCTCCAGCAGATGCAAGAACTCTCCAACATCCTGAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCAGCTACAAACAGGTGAAGACCTGGTTCCAGAACCAGAGAATGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCAGCTACAAACAGGTGAAGACCTGGTTCCAGAACCAGAGAATGAAATCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGAGGTGGCAGAAAAACAACTGGCCGAAGAATAGCAATGGTGTGACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGAGGTGGCAGAAAAACAACTGGCCGAAGAATAGCAATGGTGTGACGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAGGCCTCAGCACCTACCTACCCCAGCCTCTACTCTTCCTACCACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAGGCCTCAGCACCTACCTACCCCAGCCTCTACTCTTCCTACCACCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GATGCCTGGTGAACCCGACTGGGAACCTTCCAATGTGGAGCAACCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GATGCCTGGTGAACCCGACTGGGAACCTTCCAATGTGGAGCAACCAGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGGAACAATTCAACCTGGAGCAACCAGACCCAGAACATCCAGTCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGGAACAATTCAACCTGGAGCAACCAGACCCAGAACATCCAGTCCTGGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAACCACTCCTGGAACACTCAGACCTGGTGCACCCAATCCTGGAACAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAACCACTCCTGGAACACTCAGACCTGGTGCACCCAATCCTGGAACAATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGCCTGGAACAGTCCCTTCTATAACTGTGGAGAGGAATCTCTGCAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGCCTGGAACAGTCCCTTCTATAACTGTGGAGAGGAATCTCTGCAGTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGCATGCACTTCCAGCCAAATTCTCCTGCCAGTGACTTGGAGGCTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TGCATGCACTTCCAGCCAAATTCTCCTGCCAGTGACTTGGAGGCTGCCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGAAGCTGCTGGGGAAGGCCTTAATGTAATACAGCAGACCACTAGGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGAAGCTGCTGGGGAAGGCCTTAATGTAATACAGCAGACCACTAGGTATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTAGTACTCCACAAACCATGGATTTATTCCTAAACTACTCCATGAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTAGTACTCCACAAACCATGGATTTATTCCTAAACTACTCCATGAACATG

    900     .    :    .
    901 CAACCTGAAGACGTG
        |||||||||||||||
 100901 CAACCTGAAGACGTG