seq1 = pF1KE1098.tfa, 945 bp
seq2 = pF1KE1098/gi568815584f_67264768.tfa (gi568815584f:67264768_67483437), 218670 bp

>pF1KE1098 945
>gi568815584f:67264768_67483437 (Chr14)

1-241  (100001-100241)   100% ->
242-321  (109701-109780)   100% ->
322-473  (111672-111823)   100% ->
474-580  (115892-115998)   100% ->
581-678  (116826-116923)   100% ->
679-822  (117680-117823)   100% ->
823-945  (118548-118670)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGGTCTAAGTTGTAGATTTTATCAACACAAATTTCCTGAGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGGTCTAAGTTGTAGATTTTATCAACACAAATTTCCTGAGGTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGATGTAGTGATGGTGAATGTCAGATCCATTGCTGAAATGGGGGCTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGATGTAGTGATGGTGAATGTCAGATCCATTGCTGAAATGGGGGCTTATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAGCTTGCTGGAATACAACAACATTGAAGGCATGATTCTTCTTAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAGCTTGCTGGAATACAACAACATTGAAGGCATGATTCTTCTTAGTGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTATCCAGAAGGCGTATCCGTTCTATCAACAAACTCATCCGAATTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTATCCAGAAGGCGTATCCGTTCTATCAACAAACTCATCCGAATTGGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAATGAGTGTGTGGTTGTCATTAGGGTGGACAAAGAAAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100201 GAATGAGTGTGTGGTTGTCATTAGGGTGGACAAAGAAAAAGGTA...CAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GATATATTGATTTGTCAAAAAGAAGAGTTTCTCCAGAGGAAGCAATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109701 GATATATTGATTTGTCAAAAAGAAGAGTTTCTCCAGAGGAAGCAATCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGTGAAGACAAATTCACAAAATCCAAAACT         GTTTATAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 109751 TGTGAAGACAAATTCACAAAATCCAAAACTGTA...TAGGTTTATAGCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTTCGTCATGTTGCTGAGGTGTTAGAATACACCAAGGATGAGCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111683 TCTTCGTCATGTTGCTGAGGTGTTAGAATACACCAAGGATGAGCAGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAAGCCTATTCCAGAGGACTGCCTGGGTCTTTGATGACAAGTACAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111733 AAAGCCTATTCCAGAGGACTGCCTGGGTCTTTGATGACAAGTACAAGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCTGGATATGGTGCCTATGATGCATTTAAGCATGCAGTCTC         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111783 CCTGGATATGGTGCCTATGATGCATTTAAGCATGCAGTCTCGTA...CAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGACCCATCTATTTTGGATAGTTTAGATTTGAATGAAGATGAACGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115892 AGACCCATCTATTTTGGATAGTTTAGATTTGAATGAAGATGAACGGGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TACTCATTAATAATATTAATAGGCGCTTGACCCCACAGGCTGTCAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115942 TACTCATTAATAATATTAATAGGCGCTTGACCCCACAGGCTGTCAAAATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGAGCAG         ATATTGAAGTGGCTTGTTATGGTTATGAAGGCAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115992 CGAGCAGGTA...TAGATATTGAAGTGGCTTGTTATGGTTATGAAGGCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGATGCTGTAAAAGAAGCCCTAAGAGCAGGTTTGAATTGTTCTACAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116860 TGATGCTGTAAAAGAAGCCCTAAGAGCAGGTTTGAATTGTTCTACAGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACATGCCCATTAAG         ATTAATCTAATAGCTCCTCCTCGGTAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 116910 ACATGCCCATTAAGGTG...TAGATTAATCTAATAGCTCCTCCTCGGTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTAATGACTACGACAACCCTGGAGAGAACAGAAGGCCTTTCTGTCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117707 GTAATGACTACGACAACCCTGGAGAGAACAGAAGGCCTTTCTGTCCTCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCAAGCTATGGCTGTTATCAAAGAGAAGATTGAGGAAAAGAGGGGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117757 TCAAGCTATGGCTGTTATCAAAGAGAAGATTGAGGAAAAGAGGGGTGTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCAATGTTCAAATGGAG         CCCAAAGTGGTCACAGATACAGAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 117807 TCAATGTTCAAATGGAGGTG...CAGCCCAAAGTGGTCACAGATACAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAGACTGAACTTGCGAGGCAGATGGAGAGGCTTGAAAGAGAAAATGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118572 GAGACTGAACTTGCGAGGCAGATGGAGAGGCTTGAAAGAGAAAATGCCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    897 AGTGGATGGAGATGATGATGCAGAAGAAATGGAAGCCAAAGCTGAAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118622 AGTGGATGGAGATGATGATGCAGAAGAAATGGAAGCCAAAGCTGAAGAT