seq1 = pF1KE1091.tfa, 984 bp
seq2 = pF1KE1091/gi568815587f_73196519.tfa (gi568815587f:73196519_73397502), 200984 bp

>pF1KE1091 984
>gi568815587f:73196519_73397502 (Chr11)

1-984  (100001-100984)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAATGGGACAATGGCACAGGCCAGGCTCTGGGCTTGCCACCCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAATGGGACAATGGCACAGGCCAGGCTCTGGGCTTGCCACCCACCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTGTCTACCGCGAGAACTTCAAGCAACTGCTGCTGCCACCTGTGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGTGTCTACCGCGAGAACTTCAAGCAACTGCTGCTGCCACCTGTGTATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGCGGTGCTGGCGGCTGGCCTGCCGCTGAACATCTGTGTCATTACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGCGGTGCTGGCGGCTGGCCTGCCGCTGAACATCTGTGTCATTACCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCTGCACGTCCCGCCGGGCCCTGACCCGCACGGCCGTGTACACCCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCTGCACGTCCCGCCGGGCCCTGACCCGCACGGCCGTGTACACCCTAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTTGCTCTGGCTGACCTGCTATATGCCTGCTCCCTGCCCCTGCTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTTGCTCTGGCTGACCTGCTATATGCCTGCTCCCTGCCCCTGCTCATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAACTATGCCCAAGGTGATCACTGGCCCTTTGGCGACTTCGCCTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAACTATGCCCAAGGTGATCACTGGCCCTTTGGCGACTTCGCCTGCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGTCCGCTTCCTCTTCTATGCCAACCTGCACGGCAGCATCCTCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGTCCGCTTCCTCTTCTATGCCAACCTGCACGGCAGCATCCTCTTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACCTGCATCAGCTTCCAGCGCTACCTGGGCATCTGCCACCCGCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACCTGCATCAGCTTCCAGCGCTACCTGGGCATCTGCCACCCGCTGGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTGGCACAAACGTGGGGGCCGCCGGGCTGCCTGGCTAGTGTGTGTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTGGCACAAACGTGGGGGCCGCCGGGCTGCCTGGCTAGTGTGTGTAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGTGGCTGGCCGTGACAACCCAGTGCCTGCCCACAGCCATCTTCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGTGGCTGGCCGTGACAACCCAGTGCCTGCCCACAGCCATCTTCGCTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACAGGCATCCAGCGTAACCGCACTGTCTGCTATGACCTCAGCCCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CACAGGCATCCAGCGTAACCGCACTGTCTGCTATGACCTCAGCCCGCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCTGGCCACCCACTATATGCCCTATGGCATGGCTCTCACTGTCATCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCTGGCCACCCACTATATGCCCTATGGCATGGCTCTCACTGTCATCGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCCTGCTGCCCTTTGCTGCCCTGCTGGCCTGCTACTGTCTCCTGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCCTGCTGCCCTTTGCTGCCCTGCTGGCCTGCTACTGTCTCCTGGCCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCGCCTGTGCCGCCAGGATGGCCCGGCAGAGCCTGTGGCCCAGGAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCGCCTGTGCCGCCAGGATGGCCCGGCAGAGCCTGTGGCCCAGGAGCGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTGGCAAGGCGGCCCGCATGGCCGTGGTGGTGGCTGCTGCCTTTGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTGGCAAGGCGGCCCGCATGGCCGTGGTGGTGGCTGCTGCCTTTGCCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGCTTCCTGCCTTTTCACATCACCAAGACAGCCTACCTGGCAGTGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGCTTCCTGCCTTTTCACATCACCAAGACAGCCTACCTGGCAGTGCGCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GACGCCGGGCGTCCCCTGCACTGTATTGGAGGCCTTTGCAGCGGCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GACGCCGGGCGTCCCCTGCACTGTATTGGAGGCCTTTGCAGCGGCCTACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AAGGCACGCGGCCGTTTGCCAGTGCCAACAGCGTGCTGGACCCCATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AAGGCACGCGGCCGTTTGCCAGTGCCAACAGCGTGCTGGACCCCATCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTCTACTTCACCCAGAAGAAGTTCCGCCGGCGACCACATGAGCTCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCTACTTCACCCAGAAGAAGTTCCGCCGGCGACCACATGAGCTCCTACA

    950     .    :    .    :    .    :
    951 GAAACTCACAGCCAAATGGCAGAGGCAGGGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAAACTCACAGCCAAATGGCAGAGGCAGGGTCGC