seq1 = pF1KE1084.tfa, 636 bp
seq2 = pF1KE1084/gi568815591f_22627439.tfa (gi568815591f:22627439_22831570), 204132 bp

>pF1KE1084 636
>gi568815591f:22627439_22831570 (Chr7)

1-19  (99825-99843)   100% ->
20-210  (100006-100196)   100% ->
211-324  (101255-101368)   100% ->
325-471  (102076-102222)   100% ->
472-636  (103968-104132)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACTCCTTCTCCACAA         GCGCCTTCGGTCCAGTTGCCTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  99825 ATGAACTCCTTCTCCACAAGTA...CAGGCGCCTTCGGTCCAGTTGCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTCCCTGGGGCTGCTCCTGGTGTTGCCTGCTGCCTTCCCTGCCCCAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100028 CTCCCTGGGGCTGCTCCTGGTGTTGCCTGCTGCCTTCCCTGCCCCAGTAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCCAGGAGAAGATTCCAAAGATGTAGCCGCCCCACACAGACAGCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100078 CCCCAGGAGAAGATTCCAAAGATGTAGCCGCCCCACACAGACAGCCACTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCTCTTCAGAACGAATTGACAAACAAATTCGGTACATCCTCGACGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100128 ACCTCTTCAGAACGAATTGACAAACAAATTCGGTACATCCTCGACGGCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCAGCCCTGAGAAAGGAG         ACATGTAACAAGAGTAACATGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100178 CTCAGCCCTGAGAAAGGAGGTG...CAGACATGTAACAAGAGTAACATGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGAAAGCAGCAAAGAGGCACTGGCAGAAAACAACCTGAACCTTCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101277 GTGAAAGCAGCAAAGAGGCACTGGCAGAAAACAACCTGAACCTTCCAAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATGGCTGAAAAAGATGGATGCTTCCAATCTGGATTCAATGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101327 ATGGCTGAAAAAGATGGATGCTTCCAATCTGGATTCAATGAGGTA...TA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    325  GAGACTTGCCTGGTGAAAATCATCACTGGTCTTTTGGAGTTTGAGGTAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102075 GGAGACTTGCCTGGTGAAAATCATCACTGGTCTTTTGGAGTTTGAGGTAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACCTAGAGTACCTCCAGAACAGATTTGAGAGTAGTGAGGAACAAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102125 ACCTAGAGTACCTCCAGAACAGATTTGAGAGTAGTGAGGAACAAGCCAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCTGTGCAGATGAGTACAAAAGTCCTGATCCAGTTCCTGCAGAAAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 102175 GCTGTGCAGATGAGTACAAAAGTCCTGATCCAGTTCCTGCAGAAAAAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    472        GCAAAGAATCTAGATGCAATAACCACCCCTGACCCAACCACAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102225 G...CAGGCAAAGAATCTAGATGCAATAACCACCCCTGACCCAACCACAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGCCAGCCTGCTGACGAAGCTGCAGGCACAGAACCAGTGGCTGCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104011 ATGCCAGCCTGCTGACGAAGCTGCAGGCACAGAACCAGTGGCTGCAGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGACAACTCATCTCATTCTGCGCAGCTTTAAGGAGTTCCTGCAGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104061 ATGACAACTCATCTCATTCTGCGCAGCTTTAAGGAGTTCCTGCAGTCCAG

    650     .    :    .    :
    615 CCTGAGGGCTCTTCGGCAAATG
        ||||||||||||||||||||||
 104111 CCTGAGGGCTCTTCGGCAAATG