seq1 = pF1KE1083.tfa, 1110 bp
seq2 = pF1KE1083/gi568815584r_91964330.tfa (gi568815584r:91964330_92196838), 232509 bp

>pF1KE1083 1110
>gi568815584r:91964330_92196838 (Chr14)

(complement)

1-24  (90287-90310)   100% ->
25-189  (100001-100165)   99% ->
190-234  (100702-100746)   100% ->
235-320  (103008-103093)   100% ->
321-387  (103521-103587)   100% ->
388-475  (108022-108109)   100% ->
476-608  (113581-113713)   100% ->
609-775  (114373-114539)   100% ->
776-872  (115778-115874)   100% ==
911-1018  (125797-125904)   99% ->
1019-1110  (132425-132516)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTCCATCTTCCACGAGAAA         CAAGAAGGCTCACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  90287 ATGGAGTCCATCTTCCACGAGAAAGTG...TAGCAAGAAGGCTCACTTTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGCTCAACATTGCCTGAATAACTTATTGCAAGGAGAATATTTTAGCCCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100018 TGCTCAACATTGCCTGAATAACTTATTGCAAGGAGAATATTTTAGCCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGAATTATCCTCAATTGCACATCAGCTGGATGAGGAGGAGAGGATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100068 TGGAATTATCCTCAATTGCACATCAGCTGGATGAGGAGGAGAGGATGAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGGCAGAAGGAGGAGTTACTAGTGAAGATTATCGCACGTTTTTACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100118 ATGGCAGAAGGAGGAGTTACTAGTGAAGATTATCGCACGTTTTTACAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190        CAGCCTTCTGGAAATATGGATGACAGTGGTTTTTTCTCTATTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100168 A...CAGCAGCCTTCTGGAAATATGGATGACAGTGGTTTTTTCTCTATTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AG         GTTATAAGCAATGCCTTGAAAGTTTGGGGTTTAGAACTA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100745 AGGTA...CAGGTTATAAGCAATGCCTTGAAAGTTTGGGGTTTAGAACTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATCCTGTTCAACAGTCCAGAGTATCAGAGGCTCAGGATCGATCCTAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103047 ATCCTGTTCAACAGTCCAGAGTATCAGAGGCTCAGGATCGATCCTATGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    321       AAATGAAAGATCATTTATATGCAATTATAAGGAACACTGGTTTA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103097 ...TAGAAATGAAAGATCATTTATATGCAATTATAAGGAACACTGGTTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CAGTTAGAAAATTAGGAAAACAG         TGGTTTAACTTGAATTCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103565 CAGTTAGAAAATTAGGAAAACAGGTA...CAGTGGTTTAACTTGAATTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 CTCTTGACGGGTCCAGAATTAATATCAGATACATATCTTGCACTTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108040 CTCTTGACGGGTCCAGAATTAATATCAGATACATATCTTGCACTTTTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGCTCAATTACAACAGGAAG         GTTATTCTATATTTGTCGTTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 108090 GGCTCAATTACAACAGGAAGGTA...TAGGTTATTCTATATTTGTCGTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AGGGTGATCTGCCAGATTGCGAAGCTGACCAACTCCTGCAGATGATTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113602 AGGGTGATCTGCCAGATTGCGAAGCTGACCAACTCCTGCAGATGATTAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GTCCAACAGATGCATCGACCAAAACTTATTGGAGAAGAATTAGCACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113652 GTCCAACAGATGCATCGACCAAAACTTATTGGAGAAGAATTAGCACAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AAAAGAGCAAAG         AGTCCATAAAACAGACCTGGAACGAGTGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113702 AAAAGAGCAAAGGTA...TAGAGTCCATAAAACAGACCTGGAACGAGTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TAGAAGCAAATGATGGCTCAGGAATGTTAGACGAAGATGAGGAGGATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114402 TAGAAGCAAATGATGGCTCAGGAATGTTAGACGAAGATGAGGAGGATTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CAGAGGGCTCTGGCACTAAGTCGCCAAGAAATTGACATGGAAGATGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114452 CAGAGGGCTCTGGCACTAAGTCGCCAAGAAATTGACATGGAAGATGAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGCAGATCTCCGCAGGGCTATTCAGCTAAGTATGCAAG         GTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 114502 AGCAGATCTCCGCAGGGCTATTCAGCTAAGTATGCAAGGTA...CAGGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GTTCCAGAAACATATCTCAAGATATGACACAGACATCAGGTACAAATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115781 GTTCCAGAAACATATCTCAAGATATGACACAGACATCAGGTACAAATCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :
    829 ACTTCAGAAGAGCTTCGGAAGAGACGAGAAGCCTACTTTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115831 ACTTCAGAAGAGCTTCGGAAGAGACGAGAAGCCTACTTTGAAAA

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGACCTATCAGGACAG
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125797 AGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGACCTATCAGGACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 AGTTCACATCCATGTGAAAGGCCAGCCACCAGTTCAGGAGCACTTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125847 AGTTCACATCCATGTGAAAGGCCAGCCACCAGTTCAGGAGCACTTGGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 TGATCTAG         GTGATGCTATGAGTGAAGAAGACATGCTTCAGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 125897 TGATCTAGGTA...CAGGTGATGCTATGAGTGAAGAAGACATGCTTCAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 CAGCTGTGACCATGTCTTTAGAAACTGTCAGAAATGATTTGAAAACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132458 CAGCTGTGACCATGTCTTTAGAAACTGTCAGAAATGATTTGAAAACAGAA

    200     .
   1102 GGAAAAAAA
        |||||||||
 132508 GGAAAAAAA