seq1 = pF1KE1082.tfa, 1317 bp
seq2 = pF1KE1082/gi568815590f_127638263.tfa (gi568815590f:127638263_127840955), 202693 bp

>pF1KE1082 1317
>gi568815590f:127638263_127840955 (Chr8)

1-757  (100001-100757)   100% ->
758-1317  (102134-102693)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCCTCAACGTTAGCTTCACCAACAGGAACTATGACCTCGACTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCCTCAACGTTAGCTTCACCAACAGGAACTATGACCTCGACTACGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGGTGCAGCCGTATTTCTACTGCGACGAGGAGGAGAACTTCTACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCGGTGCAGCCGTATTTCTACTGCGACGAGGAGGAGAACTTCTACCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCAGCAGCAGAGCGAGCTGCAGCCCCCGGCGCCCAGCGAGGATATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCAGCAGCAGAGCGAGCTGCAGCCCCCGGCGCCCAGCGAGGATATCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGAAATTCGAGCTGCTGCCCACCCCGCCCCTGTCCCCTAGCCGCCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGAAATTCGAGCTGCTGCCCACCCCGCCCCTGTCCCCTAGCCGCCGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGGCTCTGCTCGCCCTCCTACGTTGCGGTCACACCCTTCTCCCTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGGCTCTGCTCGCCCTCCTACGTTGCGGTCACACCCTTCTCCCTTCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAGACAACGACGGCGGTGGCGGGAGCTTCTCCACGGCCGACCAGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAGACAACGACGGCGGTGGCGGGAGCTTCTCCACGGCCGACCAGCTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGGTGACCGAGCTGCTGGGAGGAGACATGGTGAACCAGAGTTTCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGGTGACCGAGCTGCTGGGAGGAGACATGGTGAACCAGAGTTTCATCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGACCCGGACGACGAGACCTTCATCAAAAACATCATCATCCAGGACTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGACCCGGACGACGAGACCTTCATCAAAAACATCATCATCCAGGACTGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGTGGAGCGGCTTCTCGGCCGCCGCCAAGCTCGTCTCAGAGAAGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGTGGAGCGGCTTCTCGGCCGCCGCCAAGCTCGTCTCAGAGAAGCTGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCTACCAGGCTGCGCGCAAAGACAGCGGCAGCCCGAACCCCGCCCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCCTACCAGGCTGCGCGCAAAGACAGCGGCAGCCCGAACCCCGCCCGCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCACAGCGTCTGCTCCACCTCCAGCTTGTACCTGCAGGATCTGAGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCACAGCGTCTGCTCCACCTCCAGCTTGTACCTGCAGGATCTGAGCGCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGCCTCAGAGTGCATCGACCCCTCGGTGGTCTTCCCCTACCCTCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCGCCTCAGAGTGCATCGACCCCTCGGTGGTCTTCCCCTACCCTCTCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACAGCAGCTCGCCCAAGTCCTGCGCCTCGCAAGACTCCAGCGCCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GACAGCAGCTCGCCCAAGTCCTGCGCCTCGCAAGACTCCAGCGCCTTCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCCGTCCTCGGATTCTCTGCTCTCCTCGACGGAGTCCTCCCCGCAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCCGTCCTCGGATTCTCTGCTCTCCTCGACGGAGTCCTCCCCGCAGGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCCCCGAGCCCCTGGTGCTCCATGAGGAGACACCGCCCACCACCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCCCCGAGCCCCTGGTGCTCCATGAGGAGACACCGCCCACCACCAGCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GACTCTG         AGGAGGAACAAGAAGATGAGGAAGAAATCGATGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GACTCTGGTA...AAGAGGAGGAACAAGAAGATGAGGAAGAAATCGATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGTTTCTGTGGAAAAGAGGCAGGCTCCTGGCAAAAGGTCAGAGTCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102168 TGTTTCTGTGGAAAAGAGGCAGGCTCCTGGCAAAAGGTCAGAGTCTGGAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CACCTTCTGCTGGAGGCCACAGCAAACCTCCTCACAGCCCACTGGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102218 CACCTTCTGCTGGAGGCCACAGCAAACCTCCTCACAGCCCACTGGTCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AAGAGGTGCCACGTCTCCACACATCAGCACAACTACGCAGCGCCTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102268 AAGAGGTGCCACGTCTCCACACATCAGCACAACTACGCAGCGCCTCCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CACTCGGAAGGACTATCCTGCTGCCAAGAGGGTCAAGTTGGACAGTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102318 CACTCGGAAGGACTATCCTGCTGCCAAGAGGGTCAAGTTGGACAGTGTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GAGTCCTGAGACAGATCAGCAACAACCGAAAATGCACCAGCCCCAGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102368 GAGTCCTGAGACAGATCAGCAACAACCGAAAATGCACCAGCCCCAGGTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 TCGGACACCGAGGAGAATGTCAAGAGGCGAACACACAACGTCTTGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102418 TCGGACACCGAGGAGAATGTCAAGAGGCGAACACACAACGTCTTGGAGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CCAGAGGAGGAACGAGCTAAAACGGAGCTTTTTTGCCCTGCGTGACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102468 CCAGAGGAGGAACGAGCTAAAACGGAGCTTTTTTGCCCTGCGTGACCAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TCCCGGAGTTGGAAAACAATGAAAAGGCCCCCAAGGTAGTTATCCTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102518 TCCCGGAGTTGGAAAACAATGAAAAGGCCCCCAAGGTAGTTATCCTTAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AAAGCCACAGCATACATCCTGTCCGTCCAAGCAGAGGAGCAAAAGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102568 AAAGCCACAGCATACATCCTGTCCGTCCAAGCAGAGGAGCAAAAGCTCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TTCTGAAGAGGACTTGTTGCGGAAACGACGAGAACAGTTGAAACACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102618 TTCTGAAGAGGACTTGTTGCGGAAACGACGAGAACAGTTGAAACACAAAC

   1300     .    :    .    :    .
   1292 TTGAACAGCTACGGAACTCTTGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||
 102668 TTGAACAGCTACGGAACTCTTGTGCG