seq1 = pF1KE1069.tfa, 531 bp
seq2 = pF1KE1069/gi568815581f_1180002.tfa (gi568815581f:1180002_1395623), 215622 bp

>pF1KE1069 531
>gi568815581f:1180002_1395623 (Chr17)

1-387  (100001-100387)   100% ->
388-526  (115490-115628)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCACCCGGTGCAGTCCGAGTTTCCTTCAGCACAGGAGCCAGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCACCCGGTGCAGTCCGAGTTTCCTTCAGCACAGGAGCCAGGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCGCATTCCTGGACCTGCCGGAGATGGAGATACTCCTCACCAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCCGCATTCCTGGACCTGCCGGAGATGGAGATACTCCTCACCAAGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAACAAGGATGACAAGACCCTGAATCTGTCCAAGACCCTCTCGGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAACAAGGATGACAAGACCCTGAATCTGTCCAAGACCCTCTCGGGGCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGATCTGGAGCAGAACAGCCAGGGCCTACCCTTCAAGGCCATCTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGATCTGGAGCAGAACAGCCAGGGCCTACCCTTCAAGGCCATCTCCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGGCACCTGGAGGCCCCACTGCCTCGGTCCCCCTCCCGGGCCAGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGGCACCTGGAGGCCCCACTGCCTCGGTCCCCCTCCCGGGCCAGCTCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGAGGGCGTCCTCCATCGCCACCACCTCCTATGCCCAAGACCAAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGAGGGCGTCCTCCATCGCCACCACCTCCTATGCCCAAGACCAAGAAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCAGAGATTACCTCATCCTGGCCGTCGTCGCCTGCTTCTGCCCCGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCAGAGATTACCTCATCCTGGCCGTCGTCGCCTGCTTCTGCCCCGTCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCCCTCAACCTCATCCCCCTCATCATTTCCATCATG         TCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100351 GCCCCTCAACCTCATCCCCCTCATCATTTCCATCATGGTA...CAGTCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GAAGCAGCATGCAACAGGGCAACGTGGACGGCGCCCGGAGGCTGGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115494 GAAGCAGCATGCAACAGGGCAACGTGGACGGCGCCCGGAGGCTGGGCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTGGCTCGGCTGCTCAGCATTACCCTCATCATCATGGGCATCGTCATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115544 CTGGCTCGGCTGCTCAGCATTACCCTCATCATCATGGGCATCGTCATTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .
    492 CATGGTGGCCGTGACCGTCAACTTCACAGTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||| | |||
 115594 CATGGTGGCCGTGACCGTCAACTTCACAGGTGAGA