seq1 = pF1KE1059.tfa, 2610 bp
seq2 = pF1KE1059/gi568815582r_75129514.tfa (gi568815582r:75129514_75343091), 213578 bp

>pF1KE1059 2610
>gi568815582r:75129514_75343091 (Chr16)

(complement)

6-633  (99996-100622)   99% ->
634-795  (105748-105909)   100% ->
796-912  (106094-106210)   100% ->
913-2010  (107106-108203)   99% ->
2011-2100  (109157-109246)   100% ->
2101-2610  (113069-113578)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      6 CCACCTGAACGTGCTGGCCAAAGCGCTCTATGACAATGTGGCCGAGTCCC
        ||-|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 CC CCAGAACGTGCTGGCCAAAGCGCTCTATGACAATGTGGCCGAGTCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     56 CGGATGAGCTCTCCTTCCGCAAGGGTGACATCATGACGGTGCTGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100045 CGGATGAGCTCTCCTTCCGCAAGGGTGACATCATGACGGTGCTGGAGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    106 GACACGCAGGGCCTGGACGGCTGGTGGCTCTGCTCGCTGCATGGGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100095 GACACGCAGGGCCTGGACGGCTGGTGGCTCTGCTCGCTGCATGGGCGCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    156 GGGCATCGTGCCTGGGAACCGCCTCAAGATCTTGGTGGGCATGTATGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100145 GGGCATCGTGCCTGGGAACCGCCTCAAGATCTTGGTGGGCATGTATGATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    206 AGAAGCCAGCAGGGCCTGGCTCCGGCCCTCCCGCCACCCCGGCCCAGCCT
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100195 AGAAGCCAGCAGGGCCTGGCCCCGGCCCTCCCGCCACCCCGGCCCAGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    256 CAGCCTGGCCTCCATGCCCCAGCGCCTCCGGCCTCCCAGTACACGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100245 CAGCCTGGCCTCCATGCCCCAGCGCCTCCGGCCTCCCAGTACACGCCCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    306 GCTCCCCAACACCTACCAGCCCCAGCCAGACAGCGTCTACCTGGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100295 GCTCCCCAACACCTACCAGCCCCAGCCAGACAGCGTCTACCTGGTGCCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 CTCCCAGCAAGGCTCAGCAAGGCCTCTACCAAGTCCCGGGTCCCAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100345 CTCCCAGCAAGGCTCAGCAAGGCCTCTACCAAGTCCCGGGTCCCAGCCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 CAGTTCCAGTCTCCCCCAGCCAAGCAGACATCCACCTTCTCGAAGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100395 CAGTTCCAGTCTCCCCCAGCCAAGCAGACATCCACCTTCTCGAAGCAGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 ACCCCATCACCCGTTTCCCAGCCCGGCCACAGACCTGTACCAGGTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100445 ACCCCATCACCCGTTTCCCAGCCCGGCCACAGACCTGTACCAGGTGCCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CAGGGCCTGGAGGCCCTGCCCAGGATATTTACCAGGTGCCACCTTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100495 CAGGGCCTGGAGGCCCTGCCCAGGATATTTACCAGGTGCCACCTTCTGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGGATGGGGCATGACATCTACCAGGTCCCCCCGTCCATGGACACACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100545 GGGATGGGGCATGACATCTACCAGGTCCCCCCGTCCATGGACACACGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTGGGAGGGCACGAAGCCCCCGGCAAAG         GTGGTGGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100595 CTGGGAGGGCACGAAGCCCCCGGCAAAGGTA...CAGGTGGTGGTGCCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCCGCGTGGGGCAGGGCTATGTATACGAGGCCGCCCAGCCGGAGCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105761 CCCGCGTGGGGCAGGGCTATGTATACGAGGCCGCCCAGCCGGAGCAGGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAGTACGACATCCCGCGACACCTGCTGGCCCCGGGGCCACAGGACATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105811 GAGTACGACATCCCGCGACACCTGCTGGCCCCGGGGCCACAGGACATCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGATGTGCCCCCGGTTCGGGGGCTGCTTCCCAGCCAGTATGGCCAGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 105861 TGATGTGCCCCCGGTTCGGGGGCTGCTTCCCAGCCAGTATGGCCAGGAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    796         GTGTATGACACACCCCCCATGGCTGTCAAGGGTCCCAATGGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105911 TA...CAGGTGTATGACACACCCCCCATGGCTGTCAAGGGTCCCAATGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CGAGACCCGTTGCTGGAGGTGTATGACGTGCCCCCCAGTGTGGAGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106136 CGAGACCCGTTGCTGGAGGTGTATGACGTGCCCCCCAGTGTGGAGAAGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCTGCCACCGTCCAACCACCACGCA         GTCTACGACGTTCCTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 106186 CCTGCCACCGTCCAACCACCACGCAGTG...CAGGTCTACGACGTTCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CATCGGTGAGCAAGGATGTGCCCGATGGCCCACTGCTGCGTGAGGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107122 CATCGGTGAGCAAGGATGTGCCCGATGGCCCACTGCTGCGTGAGGAGACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TACGATGTGCCCCCCGCCTTCGCCAAGGCCAAGCCCTTTGACCCGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107172 TACGATGTGCCCCCCGCCTTCGCCAAGGCCAAGCCCTTTGACCCGGCCCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CACCCCACTGGTACTGGCTGCGCCCCCTCCAGACTCCCCGCCGGCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107222 CACCCCACTGGTACTGGCTGCGCCCCCTCCAGACTCCCCGCCGGCCGAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACGTGTATGACGTGCCGCCCCCGGCTCCTGACCTCTACGACGTGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107272 ACGTGTATGACGTGCCGCCCCCGGCTCCTGACCTCTACGACGTGCCCCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GGCTTGCGGCGGCCTGGCCCGGGCACCCTGTACGATGTGCCCCGTGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107322 GGCTTGCGGCGGCCTGGCCCGGGCACCCTGTACGATGTGCCCCGTGAACG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GGTGCTTCCTCCTGAGGTGGCTGATGGTGGCGTGGTCGACAGTGGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107372 GGTGCTTCCTCCTGAGGTGGCTGATGGTGGCGTGGTCGACAGTGGTGTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ATGCGGTGCCTCCCCCAGCTGAACGTGAAGCCCCAGCAGAGGGCAAGCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 107422 ATGCGGTGCCTCCCCCAGCTGAACGTGAAGCCCCGGCAGAGGGCAAGCGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CTGTCGGCCTCCAGCACCGGCAGCACACGCAGCAGCCAGTCTGCGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107472 CTGTCGGCCTCCAGCACCGGCAGCACACGCAGCAGCCAGTCTGCGTCCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CTTGGAGGTGGCAGGGCCGGGCCGGGAACCCCTGGAGCTGGAAGTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107522 CTTGGAGGTGGCAGGGCCGGGCCGGGAACCCCTGGAGCTGGAAGTTGCTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGGAGGCCCTGGCACGGCTGCAGCAGGGTGTGAGCGCCACCGTTGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107572 TGGAGGCCCTGGCACGGCTGCAGCAGGGTGTGAGCGCCACCGTTGCCCAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CTTCTGGACCTGGCAGGCAGCGCCGGTGCGACTGGGAGCTGGCGTAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107622 CTTCTGGACCTGGCAGGCAGCGCCGGTGCGACTGGGAGCTGGCGTAGCCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CTCTGAGCCACAGGAGCCGCTGGTGCAGGACCTGCAGGCTGCTGTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107672 CTCTGAGCCACAGGAGCCGCTGGTGCAGGACCTGCAGGCTGCTGTGGCCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 CCGTCCAGAGTGCCGTCCACGAGCTGTTGGAGTTTGCCCGCAGCGCGGTG
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107722 CTGTCCAGAGTGCCGTCCACGAGCTGTTGGAGTTTGCCCGCAGCGCGGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 GGCAATGCTGCCCACACATCTGACCGTGCCCTGCATGCCAAGCTTAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107772 GGCAATGCTGCCCACACATCTGACCGTGCCCTGCATGCCAAGCTTAGCCG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 GCAGCTGCAGAAGATGGAGGACGTGCACCAGACGCTGGTGGCACATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107822 GCAGCTGCAGAAGATGGAGGACGTGCACCAGACGCTGGTGGCACATGGTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 AGGCCCTCGACGCTGGCCGGGGAGGCTCTGGAGCCACCCTTGAGGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107872 AGGCCCTCGACGCTGGCCGGGGAGGCTCTGGAGCCACCCTTGAGGACCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 GACCGGCTGGTGGCCTGCTCGCGGGCTGTGCCCGAGGACGCCAAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107922 GACCGGCTGGTGGCCTGCTCGCGGGCTGTGCCCGAGGACGCCAAGCAGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 GGCCTCCTTCCTGCACGGCAATGCCTCACTGCTCTTCAGACGGACCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107972 GGCCTCCTTCCTGCACGGCAATGCCTCACTGCTCTTCAGACGGACCAAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 CCACTGCCCCGGGGCCTGAGGGGGGTGGCACCCTGCACCCCAACCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108022 CCACTGCCCCGGGGCCTGAGGGGGGTGGCACCCTGCACCCCAACCCCACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 GACAAGACCAGCAGCATCCAGTCACGACCCCTGCCCTCACCCCCTAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108072 GACAAGACCAGCAGCATCCAGTCACGACCCCTGCCCTCACCCCCTAAGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 CACCTCCCAGGACTCGCCAGATGGGCAGTACGAGAACAGCGAGGGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108122 CACCTCCCAGGACTCGCCAGATGGGCAGTACGAGAACAGCGAGGGGGGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 GGATGGAGGACTATGACTACGTCCACCTACAG         GGGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 108172 GGATGGAGGACTATGACTACGTCCACCTACAGGTG...CAGGGGAAGGAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 GAGTTTGAGAAGACCCAGAAGGAGCTGCTGGAAAAGGGCAGCATCACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109166 GAGTTTGAGAAGACCCAGAAGGAGCTGCTGGAAAAGGGCAGCATCACGCG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 GCAGGGCAAGAGCCAGCTGGAGTTGCAGCAG         CTGAAGCAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 109216 GCAGGGCAAGAGCCAGCTGGAGTTGCAGCAGGTG...CAGCTGAAGCAGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 TTGAACGACTGGAACAGGAGGTGTCACGGCCCATAGACCACGACCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113079 TTGAACGACTGGAACAGGAGGTGTCACGGCCCATAGACCACGACCTGGCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 AACTGGACGCCAGCCCAACCCCTGGCCCCGGGGCGAACAGGCGGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113129 AACTGGACGCCAGCCCAACCCCTGGCCCCGGGGCGAACAGGCGGCCTGGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 GCCCTCGGACCGGCAGCTGCTGCTCTTCTACCTGGAGCAGTGTGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113179 GCCCTCGGACCGGCAGCTGCTGCTCTTCTACCTGGAGCAGTGTGAGGCCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 ACCTGACCACACTGACCAACGCCGTGGACGCCTTCTTTACCGCCGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113229 ACCTGACCACACTGACCAACGCCGTGGACGCCTTCTTTACCGCCGTGGCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2311 ACCAACCAGCCGCCCAAGATCTTTGTGGCGCACAGCAAGTTCGTCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113279 ACCAACCAGCCGCCCAAGATCTTTGTGGCGCACAGCAAGTTCGTCATCCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2361 CAGCGCCCACAAGCTGGTGTTCATCGGGGACACACTGTCACGGCAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113329 CAGCGCCCACAAGCTGGTGTTCATCGGGGACACACTGTCACGGCAGGCCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2411 AGGCTGCTGACGTGCGCAGCCAGGTGACCCACTACAGCAACCTGCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113379 AGGCTGCTGACGTGCGCAGCCAGGTGACCCACTACAGCAACCTGCTGTGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2461 GACCTCCTGCGCGGCATCGTGGCCACCACCAAGGCCGCTGCCTTGCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113429 GACCTCCTGCGCGGCATCGTGGCCACCACCAAGGCCGCTGCCTTGCAGTA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2511 CCCATCGCCTTCCGCGGCCCAGGACATGGTGGAGAGGGTCAAGGAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113479 CCCATCGCCTTCCGCGGCCCAGGACATGGTGGAGAGGGTCAAGGAGCTGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2561 GCCACAGCACCCAGCAGTTCCGCCGCGTCCTAGGCCAGCTGGCAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113529 GCCACAGCACCCAGCAGTTCCGCCGCGTCCTAGGCCAGCTGGCAGCCGCC