seq1 = pF1KE1053.tfa, 1128 bp
seq2 = pF1KE1053/gi568815590f_143169397.tfa (gi568815590f:143169397_143376801), 207405 bp

>pF1KE1053 1128
>gi568815590f:143169397_143376801 (Chr8)

1-124  (100001-100124)   100% ->
125-223  (105308-105406)   100% ->
224-1128  (106501-107405)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCCTAGGGGACATTCAGGAGTCCCCTTCTGTCCCGTCCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCCCTAGGGGACATTCAGGAGTCCCCTTCTGTCCCGTCCCCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGTCTCTCATCACCGGGGACACCTGGAACCCAGCACCACGAGCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGTCTCTCATCACCGGGGACACCTGGAACCCAGCACCACGAGCCTCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCACCTCCATGGGCATCAACATG         GCTCCCCTGGCTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100101 TTCACCTCCATGGGCATCAACATGGTA...CAGGCTCCCCTGGCTCCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTAAGGTGCTCTCCCAGCCGTCCGACCTGGATCTCCAAGACGTAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105325 CCTAAGGTGCTCTCCCAGCCGTCCGACCTGGATCTCCAAGACGTAGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTGGAGATCGGCAGAGACACCTTCTGGCCCG         ACTCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 105375 AGTGGAGATCGGCAGAGACACCTTCTGGCCCGGTG...CAGACTCCGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCAAGCCGGAGCAGGCTCCACGCTCTCCTGGCTCTCAGGCCCCTGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106510 CCAAGCCGGAGCAGGCTCCACGCTCTCCTGGCTCTCAGGCCCCTGACGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGGGCGGGCGGGGCGCTGCGCAGCCTCCTGAGGAGCCTTCCCCGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106560 GGGGCGGGCGGGGCGCTGCGCAGCCTCCTGAGGAGCCTTCCCCGCAGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCGGTGCAGCGCCGGCTTCGGGCCTGAATCCAGCGCGGAGCGGCCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106610 CCGGTGCAGCGCCGGCTTCGGGCCTGAATCCAGCGCGGAGCGGCCGGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCCAGCCGCCTGGGGCCGTCCCTTGCGCCCAGCCGCGGGGCGCCTGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106660 GCCAGCCGCCTGGGGCCGTCCCTTGCGCCCAGCCGCGGGGCGCCTGGCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTGACGCTCGTGCAGCAAGCAGCGGCTGGGCCCGAGGGTGCGCCCGAGCG
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 106710 GTGACGCTCGTGCAGCAAGCAGCGGCCGGGCCCGAGGGTGCGCCCGAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCTGCCGAGCTGGGAGTCAACTTCGGTCGGAGCCGGCAGGGCAGCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106760 GGCTGCCGAGCTGGGAGTCAACTTCGGTCGGAGCCGGCAGGGCAGCGCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GGGGGGCCAAGCCGCACAGGTGCGAGGCCTGCGGCAAGAGTTTCAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106810 GGGGGGCCAAGCCGCACAGGTGCGAGGCCTGCGGCAAGAGTTTCAAGTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AACTCGCTGCTCCTGAAGCACCAGCGCATCCACACGGGCGAGAAGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106860 AACTCGCTGCTCCTGAAGCACCAGCGCATCCACACGGGCGAGAAGCCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CGCCTGCCACGAGTGCGGCAAGCGCTTCCGCGGCTGGTCGGGCTTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106910 CGCCTGCCACGAGTGCGGCAAGCGCTTCCGCGGCTGGTCGGGCTTCATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGCACCACCGCATCCACACGGGCGAGAAGCCCTACGAGTGCGGCCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106960 AGCACCACCGCATCCACACGGGCGAGAAGCCCTACGAGTGCGGCCAGTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GGCCGCGCCTTCAGCCACAGCTCGCACTTCACGCAGCACCTGCGCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107010 GGCCGCGCCTTCAGCCACAGCTCGCACTTCACGCAGCACCTGCGCATCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CAACGGCGAGAAGCCCTACAAGTGCGGCGAGTGCGGCCAGGCCTTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107060 CAACGGCGAGAAGCCCTACAAGTGCGGCGAGTGCGGCCAGGCCTTCAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AGAGCTCCAACCTGGTGCGCCACCAGCGGCTGCACACGGGTGAGAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107110 AGAGCTCCAACCTGGTGCGCCACCAGCGGCTGCACACGGGTGAGAAGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TACGCCTGCAGCCAGTGCGGCAAGGCCTTCATCTGGAGCTCCGTGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107160 TACGCCTGCAGCCAGTGCGGCAAGGCCTTCATCTGGAGCTCCGTGCTCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CGAGCACCAGCGCATCCACACTGGCGAGAAGCCCTACGAGTGCTCCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107210 CGAGCACCAGCGCATCCACACTGGCGAGAAGCCCTACGAGTGCTCCGACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GCGGCAAAGCCTTCCGCGGCCGCTCGCACTTCTTCCGGCACCTGCGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107260 GCGGCAAAGCCTTCCGCGGCCGCTCGCACTTCTTCCGGCACCTGCGGACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CACACGGGCGAGAAGCCCTTCGCGTGTGGCGCCTGCGGCAAGGCCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107310 CACACGGGCGAGAAGCCCTTCGCGTGTGGCGCCTGCGGCAAGGCCTTCGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1083 CCAGAGCTCCCAGCTCATCCAGCACCAGCGGGTGCACTACCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107360 CCAGAGCTCCCAGCTCATCCAGCACCAGCGGGTGCACTACCGCGAG